離子交換層析的固定相是離子交換劑。離子交換劑由聚合物(或硅膠)基體以及與基體相連接的離子交換功能團組成。離子交換層析通過電荷間的相互作用進行分離。
離子交換層析的關鍵是要控制樣品離子與流動相離子對固定相表面電荷位置的競爭作用。
為得到最佳的分離條件，可控制以下幾個方面的選擇：
(1)離子交換劑的類型；
(2)流動相的pH；
(3)流動相的離子強度；
(4)流動相中配對離子的類型。
(2)流動相的pH；
(3)流動相的離子強度；
(4)流動相中配對離子的類型。
BioToolomics通過設計珠粒尺寸、孔徑、官能團和單個基體的機械強度，BioToolomics離子交換層析填料可用于從大體積中捕獲大宗產品或雜質，作為中間純化步驟，或作為高分辨率純化的最終步驟。
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