細菌的接種方法有很多種，如劃線法、涂布法、傾注法、斜面接種法、液體培養基接種法、螺旋接種法等，其方法和應用各有不同，下面進行解釋以幫助實驗人員選擇操作。

劃線法：此法主要用于菌種分純，獲得單菌落

由接種環沾取少許待分離的材料，在無菌平板表面進行平行劃線、扇形劃線或其他形式的連續劃線，微生物細胞數量將隨著劃線次數的增加而減少，并逐步分散開來，如果劃線適宜的話，微生物能一一分散，經培養后，可在平板表面得到單菌落。
優點：可以觀察菌落特征，對混合菌進行分離。
缺點：不能用于菌落計數。

涂布法：此法主要用于菌落總數計數

先將培養基熔化后趁熱倒入無菌平板中，然后用無菌吸管吸取0.1ml菌液接種在已凝固的瓊脂平板上。再用無菌L型玻璃棒將菌液在平板上涂抹均勻，將涂抹好的平板平放于桌上20~30min，使菌液滲透入培養基內，然后將平板倒轉，保溫培養，至長出菌落后即可計數。
優點：可以計數，可以觀察菌落特征。
缺點：接種前需梯度稀釋，吸收量較少，較麻煩，平板不干燥效果不好，容易蔓延。

傾倒法：此法主要用于菌落總數的計數
吸取1ml菌液加入平板中，倒入已融化并冷卻至45~50℃的細菌培養基，輕輕轉動平板，使菌液與培養基混合均勻，冷疑后倒置，適溫培養。至長出菌落后即可計數。
優點：可以計數，較方便。
缺點：接種前需梯度稀釋，不能觀察菌落特征，不適用于嚴格好氧菌和熱敏感菌。

斜面接種法：此法主要用于保存菌種，或觀察細菌的某些生化特性和動力
用接種環或接種針伸入菌種管內，挑取用來移種的菌落。伸入斜面培養管內，先從斜面底部到頂端拖一條接種線，再自下而上蜿蜒劃線，或直接自下而上地蜿蜒劃線。接種完成之后，用火焰滅菌培養管口，并塞上棉塞，置于37℃培養。

液體培養基接種法：此法主要用于菌液比濁實驗
用滅菌接種環挑取菌落或標本，在試管內壁與液面交界處輕輕研磨，使細菌均勻得散落在液體培養基中。

螺旋接種法：此法主要用于菌落總數計數
Spiral plater 可以在無任何全部或中間稀釋的情況下快速細菌接種。對數減少的樣品容量以阿基米德螺旋線的形式被自動分注在旋轉式培養基表面。培養基上每一點的容量可以被知曉和校準。菌液的濃度可以通過培養皿上一定區域的菌落數量除以同區域樣品分注量來計算。
優點：螺旋接種法菌液無需稀釋（其他接種方法均需經過梯度稀釋才能計菌落數），自動化接種，效率高，可節省3/4的耗材和時間
缺點：產品成本高，適用于樣品量比較大的實驗