Q:SDS-PAGE電泳凝膠中各主要成分的作用?
A: 聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺為蛋白質電泳提供載體,其凝固的好壞直接關系到電泳成功與否,與促凝劑及環境密切相關;制膠緩沖液:濃縮膠選擇pH6.8,分離膠選擇pH8.8,選擇Tris-HCL系統。
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Q:TEMED與AP的作用?
A:促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固。
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Q:十二烷基硫酸鈉(SDS)的作用?
A:陽離子去污劑,作用有四:去蛋白質電荷、解離蛋白質之間的氫鍵、取消蛋白分子內的疏水作用、去多肽折疊。
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Q:提高SDS-PAGE電泳分辨率的途徑?
A:1、聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝膠的分辨率。建議做法:待凝膠在室溫凝固后,可在室溫下放置一段時間使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易導致凝固不充分,后者可導致SDS結晶。一般凝膠可在室溫下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。
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???2、一般常用的有氨基黑、考馬斯亮藍、銀染色三種染料,不同染料有各自不同的染色方法,具體可參照郭堯君編著的《蛋白質電泳技術手冊》P82-103。
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Q:“微笑”(兩邊翹起中間凹下)形帶原因?
A:主要是由于凝膠的中間部分凝固不均勻所致,多出現于較厚的凝膠中。處理辦法:待其充分凝固再作后續實驗。
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Q:“皺眉”(兩邊向下中間鼓起)形帶原因?
A:主要出現在蛋白質垂直電泳槽中,一般是兩板之間的底部間隙氣泡未排除干凈。處理辦法:可在兩板間加入適量緩沖液,以排除氣泡。
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Q:為什么帶出現拖尾現象?
A:主要是樣品融解效果不佳或分離膠濃度過大引起的。處理辦法:加樣前離心;選擇適當的樣品緩沖液,加適量樣品促溶劑;電泳緩沖液時間過長,重新配制;降低凝膠濃度。
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Q:為什么帶出現紋理現象?
A:主要是樣品不溶性顆粒引起的。處理辦法:加樣前離心;加適量樣品促溶劑。
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Q:什么是“鬼帶”,如何處理?
A:“鬼帶”就是在跑大分子構象復雜的蛋白質分子時,常會出現在泳道頂端(有時在濃縮膠中)的一些大分子未知條帶或加樣孔底部有沉淀,主要由于還原劑在加熱的過程中被氧化而失去活性,致使原來被解離的蛋白質分子重新折疊結合和亞基重新締合,聚合成大分子,其分子量要比目標條帶大,有時不能進入分離膠。但它卻于目標條帶有相同的免疫學活性,在WB反應中可見其能與目標條帶對應的抗體作用。處理辦法:在加熱煮沸后,再添加適量的DTT或Beta巰基乙醇,以補充不足的還原劑;或可加適量EDTA來阻止還原劑的氧化。
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Q:為什么溴酚藍不能起到指示作用?
A:我們在實驗中常會遇到溴酚藍已跑出板底,但蛋白質卻還未跑下來的現象。主要與緩沖液和分離膠的濃度有關。處理辦法:更換正確pH值的Buffer;降低分離膠的濃度。
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Q:為什么電泳的條帶很粗?
A:電泳中條帶很粗是常見的事,主要是未濃縮好的原因。處理辦法:適當增加濃縮膠的長度;保證濃縮膠貯液的pH正確(6.8);適當降低電壓。
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