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蛋白測序服務

作者:卡梅德生物科技(天津)有限公司 2018-09-18T00:00 (訪問量:8564)

基于超高分辨率質譜和高保真基因克隆技術,卡梅德生物能夠為客戶提供高保真的抗體和蛋白測序服務。

重組蛋白表達服務 — 蛋白De Novo測序服務

卡梅德生物建立了先進的Orbitrap Fusion Lumos質譜儀與數據庫結合法測序服務,為廣大客戶提供極為強大和精準的蛋白質全序列測序服務。鑒于不同的實驗需求,我司也為廣大科研人員提供Edman降解法測定蛋白N端多達60個氨基酸序列長度。

基于Edman降解法的蛋白N-端測序

Edman法測定單個氨基酸循環包括3步:第一步是在堿性條件下,PITC與蛋白N端的游離氨基結合;第二步是在酸性溶液中,N端殘基被切除;第三步是PITC結合的殘基轉化成為更為穩定的PTH殘基,經過在線的HPLC分析,根據洗脫時間最終確定氨基酸種類。

測序步驟:蛋白樣品首先進行SDS-PAGE的分離,保證樣品的純度滿足測序的要求;隨后將SDS-PAGE上的蛋白樣品轉移到PVDF膜上;經過染色確定把蛋白條帶并切出;Edman測序儀對得到的PVDF膜上的蛋白樣品進行分析。

項目服務特征:

*蛋白表達及pulldown產物的鑒定:重組蛋白氨基酸順序驗證以及各種免疫沉淀蛋白產物的驗證

*細胞株表達產物的驗證:驗證細胞株建立和發酵過程中蛋白產物N端甲硫氨酸和信號肽是否正確處理

*抗體藥物N端序列驗證

基于Orbitrap Fusion Lumos質譜儀與Edman降解互補的全蛋白從頭測序

客戶將蛋白產品寄送至卡梅德生物后,我們會先對蛋白樣品進行鑒定和片段化處理,我們會謹慎選用常用6種蛋白酶包括TrypsinChymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-CLys-,以盡可能得到最多的片段化序列,實現100%蛋白覆蓋。多肽質譜測序后的序列信息經過PEAKs StudioPEAKs Ab?軟件拼接,并加以人工輔助拼接實現接近100%正確的蛋白或抗體一級序列。更多信息關于完全從頭氨基酸序列測序,請查閱抗體從頭測序服務

我們的服務優勢:

---極為優秀的抗體測序服務保證

我們的測序服務執行嚴格的質量控制,采用寬進窄出的原則,在不遺漏任何有效數據信息的同時實現了蛋白序列的準確鑒定。目前我們實驗室使用的Orbitrap Fusion Lumos質譜儀,相比于上一代Orbitrap Elite質譜儀,Lumos在提高了一級二級質譜掃描速度的同時保證肽段分子量的準確性。同時結合我們行業標桿性邏輯算法和強大的處理能力(基于PEAKS軟件分析),我們能夠區分分子量接近的氨基酸,如實現分子量差異在0.03Da的谷氨酰胺和賴氨酸差別分析。

---抗體測序服務保證100%?序列覆蓋

卡梅德生物針對不同的項目需求,會采用多達6種不同的蛋白酶對目標蛋白進行消化酶切,對單個氨基酸生成至少10次的片段,利用PEAKs StudioPEAKs Ab軟件自動實現不同輕重鏈酶切肽段之間100%全序列拼接;同時利用人工和數據庫進行雙重驗證。

---強大的修飾分析能力

我們的抗體測序平臺能夠高效地區分同源氨基酸的不同變異體,通過二級碎裂片段的特征峰即可實現亮氨酸和異亮氨酸的準確判定。對于轉錄后修飾的氨基酸分子,我們的系統也能高效區分。


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