RNAeasy™動物RNA抽提試劑盒(離心柱式)-分析方法-資訊-生物在線

RNAeasy™動物RNA抽提試劑盒(離心柱式)

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-11-04T00:00 (訪問量:5358)

??離心柱式RNAeasy?動物RNA抽提試劑盒(RNAeasy? Animal RNA Isolation Kit with Spin Column)是一種基于離心柱法從動物組織或培養的動物細胞中安全、快速、便捷、穩定、高效、高質量地抽提長度大于200個核苷酸(nucleotide, nt)的RNA的試劑盒。抽提獲得的大于200個核苷酸的RNA(也常被稱為總RNA)可以用于各種常規用途。

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本試劑盒抽提得到的RNA可用于反轉錄、RT-PCR、qPCR、Northern、點雜交(Dot Blot)、純化mRNA、體外翻譯、RNase protection assay、cDNA克隆等下游實驗;也可用于基因表達芯片分析(microarray)、高通量測序(high throughput
sequencing)等對RNA質量要求較高的情況。
三款離心柱式及Trizol法RNA抽提試劑盒的主要特點和差異如下:

產品編號 R0024/ R0026/ R0027 R0028 R0032 R0011/R0016
產品名稱 RNAeasy?動物RNA
抽提試劑盒
RNAeasy?動物小RNA
抽提試劑盒
RNAeasy? Plus動物RNA
抽提試劑盒
Beyozol Trizol
推薦指數 ★★★★★ ★★★★★ ★★★ ★★
抽提方式 離心柱式 離心柱式 離心柱式 原始方式
抽提產物 RNA(>200nt) 小RNA(<200nt) 總RNA(含<200nt的小RNA) 總RNA(含<200nt的小RNA)
操作時間 最短(15-20分鐘) 稍較長(20-25分鐘) 較長(25-30分鐘) 最長(45-60分鐘)
操作步驟 4步驟() 6步驟() 6步驟() 很多步驟
使用便捷性 ★★★★★ ★★★★ ★★★★ ★★
推薦細胞量/得率 50-100萬/5-20μg 50萬/1-2μg 50-100萬/5-20μg 50-100萬/5-20μg
推薦組織量/得率 5-20mg/10-40μg () 5mg/1-1.5μg () 3-5mg/3-10μg () 50mg/100-500μg (很多)
RNA純度
有毒有害試劑
人體與環境安全
國外同類產品 RNeasy Mini Kit (Qiagen)
PureLink? RNA Mini Kit
(Thermo)
PureLink? miRNA Isolation Kit (Thermo) miRNeasy Mini Kit (Qiagen) TRIzol (Thermo)
用途 非小RNA相關各種用途 小RNA相關各種用途 不同長度RNA各種用途 不同長度RNA各種用途

動物組織或細胞中的RNA按照長度可以分為長鏈RNA(long RNA)和小RNA(small RNA),長鏈RNA通常大于200nt,而小RNA通常小于200nt。長鏈RNA按照是否編碼蛋白或多肽可以分為長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)和mRNA。小RNA主要包括非編碼的5.8S rRNA(ribosomal RNA)、5S rRNA、tRNA(transfer RNA)、microRNA(miRNA)、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(Piwi-associated small RNA)、tsRNA(tRNA-derived small RNA)、srRNA(small rDNA-derived RNA)等。
本試劑盒抽提RNA的基本流程如圖1所示。樣品在裂解液中迅速裂解,釋放出總RNA,然后讓RNA特異性地結合到純化柱上,而基因組DNA和蛋白質等其它組分通過高速離心被有效去除,再通過3次洗滌充分去除非特異性結合的蛋白、鹽等雜質,最后用洗脫液將高純度的RNA洗脫下來。

圖1. 離心柱式RNA抽提流程示意圖

本試劑盒使用安全。本試劑盒通過特殊的柱純化介質進行RNA分離純化,能有效避免傳統的Trizol法抽提時使用的酚、氯仿等有毒有害有機試劑。
本試劑盒使用快速、便捷。本試劑盒采用柱純化,無需繁瑣的RNA沉淀步驟,抽提操作過程僅15-20分鐘。相比于傳統的Trizol抽提法,本試劑盒的操作流程顯著簡化,縮短了抽提時間,降低了RNA被降解的風險。和國外同類柱純化產品相比,所需操作步驟和操作時間基本一致。
本試劑盒抽提RNA的得率高,優于國外同類產品。本試劑盒的抽提效果經反復測試,100萬個HeLa細胞能抽提得到約15-20μgRNA,20mg小鼠肝組織能抽提得到約25-35μgRNA,20mg小鼠腦組織中抽提得到約10-20μgRNA(新鮮樣品的得率高于凍存樣品)。本試劑盒與傳統的Trizol方法及國際知名Q品牌同類產品的抽提效果對比參見圖2。
本試劑盒抽提得到的RNA純度高,顯著優于Trizol和國外Q品牌的同類產品。本試劑盒抽提得到的RNA的A260/A280通常為2.0-2.2。A260/A230通常為1.9-2.1。本試劑盒與傳統的Trizol方法及國際知名Q品牌同類產品的抽提效果對比參見圖2。由圖2可知,本試劑盒在抽提組織樣品的RNA時,A260/A230非常顯著地高于Trizol法和Q品牌的同類產品,提示純度高。

圖2. 本試劑盒與Trizol、Q品牌同類產品的RNA抽提效果對比。樣品為凍存的50萬個HeLa細胞、20mg小鼠肝組織和20mg小鼠腦組織。洗脫液用量均為40μl。均取6μl洗脫的樣品經變性處理后,在含6.67%甲醛和適量NA-Red的1.2%變性瓊脂糖凝膠中電泳約45分鐘后拍照。實際抽提效果會因實驗條件、檢測儀器等的不同而存在差異,本圖僅供參考。
注:純的RNA其A260/A280約為2.0,但在很多儀器上測定時會高于2.0,低于1.9通常認為有蛋白、DNA或者酚等的污染;純的RNA其A260/A230約為2.0左右或者略高,低于1.9通常認為有碳水化合物、胍鹽、多肽或酚等的污染。

本產品與Qiagen公司的RNeasy Mini Kit一致,用于純化200nt以上的RNA,對小于200nt的small RNA即小RNA(如5.8S rRNA、5S rRNA、tRNA、miRNA、piRNA等)被選擇性地去除,如果希望抽提得到小于200nt的小RNA,推薦RNAeasy?動物小RNA抽提試劑盒(離心柱式)(R0028)或RNAeasy? Plus動物RNA抽提試劑盒(離心柱式)(R0032)。
本試劑盒適用于新鮮或凍存的動物組織或細胞RNA的抽提,推薦的細胞用量為50-100萬(上限可達1000萬),組織用量為15-20mg(上限可達30mg)。對于不同的組織或細胞上限會有所差別,例如小鼠肝臟組織的上限可達30mg,但肌肉組織的上限為20mg。
本試劑盒可用于12個樣品的RNA抽提。
包裝清單:

產品編號 產品名稱 包裝
R0024-1 裂解液 8ml
R0024-2 結合液 8ml
R0024-3 洗滌液I 8ml
R0024-4 洗滌液II 15ml
R0024-5 洗脫液 1.2ml
R0024-6 RNA純化柱及廢液收集管 12套
R0024-7 RNA洗脫管 12個
說明書 1份

保存條件:
室溫保存,一年有效。
注意事項:
對于富含RNase的樣品(如動物組織),建議使用前在裂解液中添加二硫蘇糖醇(Dithiothreitol, DTT)至終濃度為40mM (例如1ml裂解液中加入20μl 2M DTT)或β-巰基乙醇至終濃度為1% (如1ml裂解液中加入10μl β-巰基乙醇)。含DTT或β-巰基乙醇的裂解液可在室溫放置1個月。
通過本試劑盒抽提到的RNA已經去除絕大多數DNA,通常情況無需DNase處理。后續如進行某些對極少量DNA殘留較敏感的實驗時,可以在使用說明中步驟4離心后,在純化柱中加入適量DNase I (如80μl含10U DNase I的酶溶液,推薦使用DNase I,D7076),室溫消化15分鐘。消化結束后,不要離心,直接加入500μl洗滌液II,進入使用說明的步驟5進行操作。
本試劑盒提供的所有試劑和耗材都是RNase-free,操作時應小心,避免被污染。所有自行準備的試劑和耗材也都應是RNase-free。如果可能有RNase污染,可考慮用0.01%的DEPC水浸泡過夜,然后高溫高壓滅菌并烘干。操作時應避免對著樣品或所使用的試劑盒耗材呼氣或說話,以防RNase污染。建議戴一次性口罩操作。
對于操作環境中RNA酶的去除,推薦使用生產的RNase and DNase Away (R0123)以去除實驗桌面上或其它接觸面上的RNase。
使用凍存的細胞或組織抽提RNA的效果通常比新鮮的細胞或組織差一些。因為在細胞或組織凍融過程中一些細胞或組織內的RNase會被釋放出來并剪切樣品中的RNA。對于組織樣品,推薦使用RNALater?動物組織RNA穩定保存液(R0118)進行保存以保證樣品RNA的完整性。
本試劑盒所有操作均在室溫進行,操作時無需冰浴。所有離心也均在室溫進行。
廢液收集管在一次抽提中需多次使用,切勿中途丟棄。
結合液、洗滌液中含有乙醇,使用后須旋緊瓶蓋以防揮發,并須按照易燃試劑的相關規范進行存放和使用。
本產品僅限于專業人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。
為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

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使用說明:
1.?樣品的準備。
細胞樣品:收集50-100萬左右的細胞。對于懸浮細胞,1000-2000g離心1分鐘后棄上清,加入300μl裂解液,輕輕吹打8-10次至固懸物溶解、溶液澄清;對于貼壁細胞,吸凈培養液后加入300μl裂解液,輕輕吹打5-10次至固懸物溶解、溶液澄清,轉移至一潔凈離心管內。
組織樣品:取15-20mg動物組織,置于液氮中研磨成粉末,立即加入600μl裂解液。也可將組織置于1.5ml離心管中,迅速加入600μl冰浴預冷的裂解液,用微型電動勻漿器勻漿,或者用普通玻璃勻漿器進行勻漿。研磨或勻漿后,輕輕吹打勻漿液8-10次,室溫放置3-5分鐘。然后約14,000g離心2分鐘,將上清液移至新的離心管中。對于比較容易裂解且勻漿很充分的組織(如肝組織、腦組織等)可以不用高速離心而直接進入步驟2。
注意:細胞的數量一般不超過500萬,不超過100萬細胞宜使用300μl裂解液,多于100萬細胞宜使用600μl裂解液。動物組織的用量一般不超過30mg,用量過多可能會因裂解不充分導致得率下降。組織樣品在裂解和離心后,離心管下部可能會有一些膠狀物質,宜作為上清轉移至下一步操作。如果棄除膠狀物,會導致得率下降約30-50%。后續加入結合液后膠狀物會消失。離心是為了去除未勻漿充分的明顯塊狀物。如果裂解后仍有粘稠物,需增加吹打次數至溶液完全澄清。對于富含RNase的樣品,裂解液中宜添加DTT至終濃度為40mM或添加β-巰基乙醇至終濃度為1%。
2.?加入等體積結合液至裂解液中,輕輕顛倒混勻3-5次。此時可能會有沉淀物產生,屬于正常現象。
3.?將混合物(包括沉淀物)轉移至純化柱內,12,000g離心30秒,倒棄收集管內液體。
注意:當裂解液的體積大于300μl時,在加入等體積結合液后,總體積會超過純化柱的容量,這時應分成2次過柱,即將一半的混合物過柱后,再將剩余的混合物重復步驟3一次。對于一些特殊的樣品,如出現溶液未完全通過時,可延長離心時間至1-2分鐘,或者加大離心力至16,000g。對于一些能快速啟動達到12,000g的離心機,離心30秒已經足夠,對于一些啟動速度緩慢的離心機本步驟及后續步驟中的30秒離心宜調整為60秒。
4.?加入600μl洗滌液I,12,000g離心30秒,倒棄收集管內液體。
5.?加入600μl洗滌液II,12,000g離心30秒,倒棄收集管內液體。
6.?重復步驟5一次。
7.?最高速(約14,000-16,000g)離心2分鐘,去除殘留的液體。
8.?將RNA純化柱置于本試劑盒提供的RNA洗脫管中,加入30-50μl洗脫液,室溫放置2-3分鐘,最高速離心30秒,所得溶液即為純化的RNA。
注意:
洗脫液需要加到純化柱柱面中央,使其被完全吸收。如需獲得更高濃度的樣品,可把洗脫液的體積減小至20μl,但洗脫下來的RNA量會相對減少。室溫較低時,洗脫液在37℃預熱片刻對得率有所幫助。此外,洗脫后的溶液再次加回到原純化柱再離心洗脫一次,可提高得率約10-30%;或者在第一次洗脫后使用新的洗脫液再洗脫一次,會獲得約為第一次洗脫量15-40%的RNA。?

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