新型冠狀病毒主蛋白酶-分析方法-資訊-生物在線

新型冠狀病毒主蛋白酶

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-12-04T00:00 (訪問量:6442)

?新型冠狀病毒(2019-nCoV)屬于單正鏈的RNA病毒,與SARS-CoV以及MERS-CoV具有較高的同源性,該病毒感染進入宿主細胞后,在宿主細胞的幫助下,其遺傳物質RNA的ORF1a/b首先翻譯表達出兩條多聚蛋白前體(pp1a和pp1ab),多聚蛋白前體在主蛋白酶(main protease, 簡稱Mpro)和木瓜樣蛋白酶(papain like proteases)的作用下發生分子內的切割產生多個非結構蛋白。Mpro也被稱為3C-like protease (3CLpro),因為其切割位點的特異性與微小RNA病毒(picornavirus)的3C蛋白酶(3C protease)很相似,兩者并稱為Mpro/3CLpro。多聚蛋白前體產生的非結構蛋白參與了病毒亞基因RNA和四個結構蛋白(envelope/E蛋白、membrane/M蛋白、spike/S蛋白和nucleocapsid/N蛋白)的產生,進而完成子代病毒的繁衍與釋放。由于Mpro蛋白酶在病毒的生命周期中起到了至關重要的作用,且人體內沒有同源蛋白,故Mpro主蛋白酶是一個抗病毒藥物研發的理想靶點,自2003年SARS爆發后,已有大量基于Mpro結構為基礎的抗SARS藥物的研究。Lopinavir(洛匹那韋)與Ritonavir(利托那韋)等抗HIV藥物也是作用于類似的蛋白酶靶點,并在臨床上得到很好的驗證。同時,Mpro在beta冠狀病毒中保守性高,篩選出的Mpro抑制劑具有一定程度的廣譜抗冠狀病毒能力,甚至可能用于豬冠狀病毒等其它動物的疾病治療中。
2019-nCoV Mpro/3CLpro與SARS-CoV的Mpro/3CLpro只差12個氨基酸,同源性大于96%,兩者結構基本一致。Mpro在介導病毒復制和轉錄中起關鍵作用,是病毒的重要的理想的藥物靶標。2019-nCoV Mpro/3CLpro是自主研發的PerfectProtein?蛋白表達技術平臺純化而來,由E.coli重組表達,沒有任何額外的標簽,沒有任何一個額外的氨基酸,確保與2019-nCoV病毒的Mpro/3CLpro氨基酸序列完全一致。

產品用途(Applications) 用于新型冠狀病毒抑制劑的篩選、酶活性研究或結構研究
外觀(Physical appearance) 液體
活性(Biological activity) ≥300U/g或300μmol/min/g
活力單位(Unit definition) 在pH7.0,溫度37℃條件下,每分鐘催化生成1μmol MCA-AVLQ的酶量定義為一個單位。
濃度(Concentration) ~1mg/ml
純度(Purity) ≥ 95% by SDS-PAGE.
配方(Formulation) 500mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 50% Glycerol, pH7.3。
使用方法(Recommended usage) 用于抑制劑篩選時,一般每個反應體系(200μl)約需要0.2-1μg本蛋白酶。
氨基酸序列(Amino acid sequence) SGFRKMAFPS GKVEGCMVQV TCGTTTLNGL WLDDVVYCPR HVICTSEDML NPNYEDLLIR KSNHNFLVQA GNVQLRVIGH SMQNCVLKLK VDTANPKTPK YKFVRIQPGQ TFSVLACYNG SPSGVYQCAM RPNFTIKGSF LNGSCGSVGF NIDYDCVSFC YMHHMELPTG VHAGTDLEGN FYGPFVDRQT AQAAGTDTTI TVNVLAWLYA AVINGDRWFL NRFTTTLNDF NLVAMKYNYE PLTQDHVDIL GPLSAQTGIA VLDMCASLKE LLQNGMNGRT ILGSALLEDE FTPFDVVRQC SGVTFQ
備注:本氨基酸序列僅供參考,實際氨基酸長度或序列可能有一定變化。
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1.具體的使用方法請參考新型冠狀病毒(2019-nCoV) Mpro/3CLpro活性檢測試劑盒,或者自行參考相關文獻,根據實驗目的,通過實驗進行摸索和優化。
2.不同量的2019-nCoV?Main Protease(Mpro/3CLpro)酶切?MCA-AVLQSGFR-Lys(Dnp)-Lys-NH2?(冠狀病毒蛋白酶熒光底物) (P9731)生成產物的熒光強度參考圖1。
圖1. 2019-nCoV?Main Protease (Mpro/3CLpro)酶切MCA-AVLQSGFR-Lys(Dnp)-Lys-NH2底物的效果圖。實際檢測結果可能會因樣品和檢測條件等的不同而存在差異,圖中數據僅供參考。

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