“RNA類明星”的正確集合方式-ceRNA-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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“RNA類明星”的正確集合方式-ceRNA

作者:北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司 2017-05-17T13:42 (訪問量:6765)

“RNA類明星”的正確集合方式-ceRNA


博奧晶典帶您走進(jìn)

RNA的明星世界~

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RNA家族的眾多成員,

歷來都是科研工作者熱愛的研究對(duì)象:


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是不是已經(jīng)眼花繚亂,選擇障礙啦!


不必再猶豫,現(xiàn)在,有一種研究,可以把多種RNA結(jié)合在一起,集RNA于大成,那就是----ceRNA!如果說,miRNA,lncRNA,circRNA每一個(gè)都散發(fā)出耀眼的光芒,ceRNA則讓我們看到它們之間的關(guān)聯(lián)和更多的潛力。


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什么是ceRNA?


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ceRNA(competing endogenous RNAs)是一種最新發(fā)現(xiàn)的基于RNA的調(diào)節(jié)機(jī)制,涉及多種RNA分子。發(fā)揮ceRNA作用的,可以是mRNA、假基因、lncRNA、circRNA等等。這些RNA一般具有如下特征:

1)具有MRE,即miRNA反應(yīng)原件;

2)能夠競爭性結(jié)合miRNA,最終發(fā)揮抑制miRNA對(duì)靶基因調(diào)控的作用。


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ceRNA 研究現(xiàn)狀

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國自然ceRNA資助項(xiàng)目,從無到有,現(xiàn)在正經(jīng)歷著躍式增長。如同以lncRNA為主題的標(biāo)書是腫瘤研究的最大贏家,以ceRNA為主題的標(biāo)書也有相似的趨勢(shì)。

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國自然資助ceRNA項(xiàng)目數(shù)量


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是不是有老師會(huì)想,今年怎么就沒想到寫ceRNA相關(guān)的本子啊?有想法永遠(yuǎn)不會(huì)遲,請(qǐng)抓緊聯(lián)系北京博奧晶典生物有限公司吧(010-69002900),我們?yōu)槟峁┮徽臼絚eRNA檢測分析服務(wù),早早準(zhǔn)備好,不要錯(cuò)過明年的國自然盛宴!

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以腫瘤為例,近年來國內(nèi)外科研工作者發(fā)現(xiàn),ceRNA介導(dǎo)參與肺癌,胃癌,肝癌,乳腺癌,前列腺癌,結(jié)直腸癌,淋巴瘤,內(nèi)皮細(xì)胞癌,黑色素瘤,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤等人類腫瘤的發(fā)生發(fā)展(Avencia Sanchez-Mejias and Yvonne Tay,2015)。這些實(shí)體瘤和血液循環(huán)系統(tǒng)惡性腫瘤中的研究均顯示,ceRNA在癌癥發(fā)病機(jī)制中起到了重要的作用,影響了關(guān)鍵致癌基因活抑癌基因的表達(dá),并且可以作為癌癥治療的潛在靶標(biāo)(Wang Y, et al., 2016)。

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國內(nèi)ceRNA與癌癥研究正如火如荼得展開。早在2014年,寧波大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員對(duì)胃癌中與lncRNA有關(guān)的競爭性內(nèi)源RNA展開了分析(guo et al., 2014),首次構(gòu)建了lncRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)。隨后,引用頭頸部鱗癌、前列腺癌、甲狀腺乳頭狀癌、垂體促性腺激素腫瘤、卵巢癌、慢性淋巴細(xì)胞白血病等6種癌癥的數(shù)據(jù)對(duì)這一網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行驗(yàn)證,研究結(jié)果揭示了一個(gè)明確的癌相關(guān)的ceRNA網(wǎng)絡(luò)。又如,來自西南醫(yī)科大學(xué)的研究者(Huang M .et al,2016)及山東大學(xué)附屬省立醫(yī)院的研究者(Hanbo Wang. et al.,2016)分別對(duì)前列腺癌,中南大學(xué)第三湘雅醫(yī)院的研究者對(duì)結(jié)直腸癌(Wu H. et al., 2017),山東大學(xué)附屬省立醫(yī)院的研究者對(duì)膀胱癌開展了ceRNA分析。


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當(dāng)然,ceRNA研究不僅僅局限于癌癥研究領(lǐng)域,例如,北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司支持支持山東大學(xué)苗俊英課題組研究者們采用博奧晶典人類長鏈非編碼RNA芯片v4進(jìn)行了血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡相關(guān)的ceRNA機(jī)制;相關(guān)結(jié)果發(fā)表在2016年的scientific reports上(Lu, et al., 2016)。

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參考文獻(xiàn):

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[1] Wang Y, et al., The Emerging Function and Mechanism of ceRNAs in Cancer. Trends Genet. 2016 Feb 24;pii:S0168-9525(16)00016-0. doi:10.1016/j.tig.2016.02.001.

[2] Long noncoding RNA associated-competing endogenous RNAs in gastric cancer. Sci Rep. 2014;6088. pii:srep06088. doi:10.1038/srep06088;

[3] Huang M et al., Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. Oncotarget. 2016 May 30;pii:9706. doi:10.18632/oncotarget.

[4] Wu H et al., Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and construction of miR-133b mediated ceRNA network in colorectal cancer. Oncotarget. 2017 Feb 03;pii:15045. doi:10.18632/oncotarget

[5] Hanbo Wang et al., Comprehensive analysis of aberrantly expressed profiles of lncRNAs and miRNAs with associated ceRNA network in muscle-invasive bladder cancer. Oncotarget. 2016 Dec 27;7(52):86174-86185. doi: 10.18632/oncotarget.13363.

[6] Lu, W., et al. Long Noncoding RNA LOC100129973 Suppresses Apoptosis by TargetingmiR-4707-5p and miR-4767 in Vascular Endothelial Cells.Scientific Reports 6 (2016).

[7] Avencia Sanchez-Mejias and Yvonne Tay. Competing endogenous RNA networks: tying the essential knots for cancer biology and therapeutics. Journal of Hematology & Oncology (2015) 8:30. DOI 10.1186/s13045-015-0129-1

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說了這么多,ceRNA研究到底怎么做呢?

且聽下回分解。

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