Western 免疫印跡(Western Blot)是將蛋白質轉移到膜上,然后利用抗體進行檢測的實驗。在WB 實驗中常會出現各種問題,而拖慢實驗速度,使實驗達不到理想的效果。今天百螢跟各位同學一起分享下 WB 實驗中各種問題及問題建議。
|
常見問題 |
可能原因 |
建議 |
|
電泳條帶成笑臉狀 |
膠不均勻冷切,中間冷卻不好,電泳系統溫度偏高 |
減少電壓減慢電泳速度,在冷室或者冰浴中進行電泳 |
|
電泳條帶成皺眉狀 |
可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全 |
調整裝置 |
|
拖尾 |
樣品溶解不好 |
樣品充分溶解混勻后上樣 |
|
紋理(縱向條紋) |
樣品中含有不溶性顆粒 |
樣品充分攪拌混勻 |
|
條帶偏斜 |
電極不平衡或者加樣位置偏斜 |
調整電極和加樣 |
|
條帶兩邊擴散 |
加樣量過多 |
適當減少上樣量 |
|
Marker 變黑色 |
抗體和 Marker 蛋白反應 |
在 Marker 和 sample 之間空出一個孔不上樣 |
|
背景高 |
膜封閉不夠 |
延長封閉時間,選擇適宜的抗體稀釋度 |
|
一抗稀釋度不適宜 |
對抗體進行滴度測試,選擇適宜的抗體稀釋度 |
|
|
一抗孵育的溫度偏高 |
建議 4℃ 結合過夜 |
|
|
二抗濃度度過高 |
降低二抗濃度 |
|
|
二抗的非特異性背景 |
增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否是由于二抗所致??蛇x擇其它二抗(特異性更強的,只針對重鏈) |
|
|
二抗孵育時間過久 |
減少二抗孵育時間 |
|
|
選擇膜的問題 |
硝酸纖維素的背景會比 PVDF 膜低 |
|
|
膜在實驗過程中干過 |
實驗過程中要注意保持膜的濕潤 |
|
|
檢測時曝光時間過長 |
注意曝光時間的縮短 |
|
|
洗膜不充分 |
增加洗膜的時間和次數 |
|
|
抗體和封閉蛋白有交叉反應 |
檢測抗體與封閉蛋白的交叉反應性,選擇無交叉反應的封閉劑。洗滌液中加入 Tween-20 可減少交叉反應 |
|
|
雜帶較多 |
目的蛋白有多個修飾位點(磷酸化位點,糖基化位點,乙?;稽c等),本身可以呈現多條帶 |
查閱文獻或進行生物信息學分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白試劑大小 |
|
目的蛋白有其他剪切本 |
查閱文獻或生物信息學分析可能性 |
|
|
樣品處理過程中目的蛋白發生降解 |
裂解液中加入蛋白酶抑制劑,樣品處理在冰上進行 |
|
|
上樣量過高,太敏感 |
適當減少上樣量 |
|
|
一抗不純 |
純化抗體 |
|
|
一抗特異性不高 |
重新選擇或制備高特異性的抗體 |
|
|
二抗的非特異性結合 |
增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否是由于二抗所致??蛇x擇其它二抗(特異性更強的,只針對重鏈) |
|
|
一抗或二抗濃度偏高 |
降低抗體濃度 |
|
|
細胞傳代較多,導致蛋白變異 |
使用原代或傳代少的細胞作對照 |
|
|
蛋白條帶位置 (大小)不對 |
二聚體或多聚體存在 |
增加蛋白質變性過程及強度 |
|
翻譯后剪切 |
比如很多蛋白是以前體蛋白的形式合成的,在執行功能時需要進行剪切成活化的形式 |
|
|
相對電荷 |
氨基酸電荷的組成 |
|
|
蛋白修飾 |
比如糖基化、磷酸化等修飾狀態會導致蛋白分子量增加 |
|
|
膠濃度 |
不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差 |
|
|
無蛋白條帶 |
抗體孵育不充分 |
增加抗體濃度,延長孵育時間 |
|
酶失活 |
直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯物 |
|
|
標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低 |
設置陽性對照,如果陽性對照有結果,但標本沒有則可能是標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低??煽紤]增加標本上樣量解決靶蛋白含量低的原因 |
|
|
試劑之間不匹配 |
一抗與組織種屬,一抗與二抗或/和底物與酶系統之間不匹配。通過設置內參照可以驗證二級檢測系統的有效性 |
|
|
一抗失效 |
選擇在有效期內抗體,幷選擇現配現用的工作液 |
|
|
HRP 抑制劑 |
所用溶液和容器內避免含有疊氮化鈉 |
|
|
抗體不能識別測試種屬的相關蛋白 |
購買抗體前應認真閱讀抗體說明書,確定其是否能夠交叉識別測試種屬的對應蛋白 |
|
|
二抗與一抗不匹配 |
選擇針對一抗來源種屬的抗體 |
|
|
蛋白條帶信號弱 |
抗體孵育不充分 |
增加抗體濃度,延長孵育時間 |
|
酶活性降低 |
直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯物 |
|
|
洗膜過度 |
洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強或過多,建議使用 0.1% 的弱去垢劑 Tween-20 |
|
|
標本中靶蛋白含量太低 |
增加樣本上樣量 |
|
|
抗體活性降低 |
選擇有效期內的抗體,工作液現配現用,避免長時間放置 |
|
|
蛋白轉移不充分 |
可以用麗春紅染膜幷結合染膠(考馬斯藍)后確定條帶是否轉移到膜上或轉移過度,適當調整轉膜的時間和電流 |
|
|
封閉過度 |
減少封閉劑的量或縮短時間,換用不同封閉劑類型 |
|
|
曝光時間過短 |
延長曝光時間 |
|
|
HRP 抑制劑 |
所用溶液和容器內避免含有疊氮化鈉 |
|
|
背景有黑色斑點 |
抗體與封閉試劑反應 |
使用前過濾封閉試劑 |
|
HRP 偶聯二抗中有聚集體 |
過濾二抗試劑,去除聚集體 |
|
|
暗背景上白色帶 |
HRP 含量過高 |
降低酶聯二抗的濃度 |
|
背景有不均勻的白色斑點 |
轉膜過程中有氣泡存在 |
仔細檢測,避免存在氣泡 |
|
抗體分布不均勻 |
孵育抗體時使用搖床 |
百螢生物是美國AAT Bioquest中國區域代理商,為您提供AAT Bioquest優質的產品、詳盡的技術和前沿的資訊,歡迎來電咨詢!
