p35SPPDK-EGFP-Flag(植物用綠色熒光蛋白)-分析方法-資訊-生物在線

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p35SPPDK-EGFP-Flag(植物用綠色熒光蛋白)

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-11-12T00:00 (訪問量:5355)

??p35SPPDK-EGFP-Flag(植物用綠色熒光蛋白)是自行研發的植物(如擬南芥等)原生質體表達質粒,可以作為原生質體瞬時轉染的陽性對照質粒或通過構建EGFP融合蛋白而實現觀察目的蛋白的亞細胞定位的目的。EGFP序列的N端有多個限制性酶切位點,根據閱讀框在此插入目的基因就可以表達C端含有EGFP標簽的融合蛋白,利用EGFP的熒光特性可以比較容易地觀察融合蛋白的表達水平和細胞內定位;EGFP序列的C端有2X Flag標簽(DYKDDDDKDYKDDDDK),可以在融合蛋白質粒轉染原生質體后實現Western Blot檢查融合蛋白表達水平的目的。質粒為氨芐青霉素抗性。

p35SPPDK promoter-EGFP-Flag載體中EGFP基因由35SPPDK強啟動子驅動表達。35SPPDK強啟動子由花椰菜花葉病毒35S(CaMV35S)啟動子與玉米C4PPDK啟動子融合而成,可以高效啟動目的蛋白在植物細胞中的表達。

p35SPPDK-EGFP-Flag載體僅保植物留瞬時轉染所需元件,為避免由于載體過大導致原生質體轉染效率降低而采用精簡的載體結構。此載體不可用于植物穩定遺傳株系的構建。

p35SPPDK-EGFP-Flag采用來自農桿菌的胭脂堿合酶基因的終止子(nopaline synthase terminator,NOS-T),用于終止RNA聚合酶轉錄,對目的基因的表達進行調控。

p35SPPDK-EGFP-Flag質粒的主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
M13 forward primer(M13 fwd) 1-17
35SPPDK promoter 84-593
EGFP 617-1333
2X Flag-tag 1355-1402
NOS terminator 1411-1663
M13 reverse primer(M13 rev) 1702-1718
lac operator 1726-1742
lac promoter 1750-1780
CAP binding site 1795-1816
pUC origin 2104-2692
Ampicililin resistance ORF 2863-3723
Ampicililin promoter 3724-3828

p35SPPDK-EGFP-Flag質粒(4301bp)的圖譜如下:

p35SPPDK-EGFP-Flag的詳細圖譜見說明書:https://www.beyotime.com/Manual/D2627 p35SPPDK-EGFP-Flag(植物用綠色熒光蛋白).pdf

p35SPPDK-EGFP-Flag中沒有的酶切位點(Restriction enzymes that do not cut p35SPPDK-EGFP-Flag包括:

AccI AfeI AgeI AscI AsiSI AvrII BbvCI
BclI BfuAI BglII BlpI BmtI BsiWI BspDI
BspMI BstBI BstEII BstXI BstZ17I Bsu36I ClaI
DraIII EagI EcoNI FseI HincII HpaI MfeI
MluI MscI NaeI NgoMIV NheI NotI NruI
PacI PflFI PflMI PmeI PmlI PpuMI PsiI
PspXI RsrII SacII SalI SbfI SexAI SfiI
SgrAI SmaI SnaBI SphI SrfI SwaI TspMI
Tth111I XcmI XmaI ? ? ? ?

p35SPPDK-EGFP-Flag中的單酶切位點(Restriction enzymes that cut p35SPPDK-EGFP- Flag once)包括:

  • AatII G,ACGT`C 3858 EcoRV GAT|ATC 337
    Acc65I G`GTAC,C 611 KasI G`GCGC,C 4158
    AflII A`CRYG,T 1440 KpnI G,GTAC`C 616
    AhdI GACNN,N`NNGTC 2936 NarI GG`CG,CC 4159
    AlwNI CAG,NNN`CTG 2459 NcoI C`CATG,G 616
    ApaI G,GGCC`C 396 NdeI CA`TA,TG 4108
    ApoI R`AATT,Y 1687 NsiI A,TGCA`T 1531
    AvaI C`YCGR,G 26 PaeR7I C`TCGA,G 26
    BaeI ,(N)5`(N)1ACNNNNGTAYC(N)7,(N)5` 598 PluTI G,GCGC`C 4162
    BamHI G`GATC,C 597 PshAI GACNN|NNGTC 245
    BmgBI CAC|GTC 308 PspOMI G`GGCC,C 392
    BsaAI YAC|GTR 556 PstI C,TGCA`G 1411
    BsaBI GATNN|NNATC 1474 SacI G,AGCT`C 523
    BsaI GGTCTCN`NNNN, 2997 SapI GCTCTTCN`NNN, 1927
    BsmI G`AATG,CN` 437 ScaI AGT|ACT 3417
    BsoBI C`YCGR,G 26 SfoI GGC|GCC 4160
    BspEI T`CCGG,A 527 SpeI A`CTAG,T 1335
    BspQI GCTCTTCN`NNN, 1927 SspI AAT|ATT 3740
    BsrGI T`GTAC,A 1326 StuI AGG|CCT 1349
    BstAPI GCAN,NNN`NTGC 4105 StyI C`CWWG,G 615
    CspCI NN`(N)11CAA(N)5GTGG(N)10,NN` 300 XbaI T`CTAG,A 603
    Eco53kI GAG|CTC 525 XhoI C`TCGA,G 27
    EcoO109I RG`GNC,CY 3912 ZraI GAC|GTC 3856
    EcoRI
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