科研服務 | 一種新的冠心病診斷Biomarker被發現
?
?
?
在醫院里，各個科室的就診人數在不同的時間段都是不同的，但是有一個科室，無論什么時候都門庭若市，永遠是排著長隊——這就是心血管病科。冠狀動脈粥樣硬性心臟?。–AD）對于公共健康具有重大的影響，據世界衛生組織（WHO）2014年統計，2012年全世界范圍內，心血管疾病是非傳染性疾病死亡的主要原因，冠心病因其在世界范圍內的高發病率和死亡率對人群健康和社會經濟造成了很大的負擔。
?
冠心病病人中，很大一部分往往在出現了胸痛、心衰等明顯臨床癥狀后才到醫院就診，被確診時冠脈已經明顯狹窄或閉塞，延誤了最佳的干預時機，因此冠心病的早期診斷，對于其治療就顯得尤為重要。
?
1月3日，鄭州大學附屬河南省人民醫院心血管內科李牧蔚教授課題組在Scientific Reports雜志發表了研究論文，報道發現環狀RNA hsa_circ_0124644可用于冠狀動脈疾病的診斷。
?
研 究 背 景
?
現有的研究表明circRNA與腫瘤，心肌肥大引起的心衰，肺纖維化，肌強直營養不良，阿爾茲海默病等諸多疾病均有著密切的關系。
?
?
?
鄭州大學附屬河南省人民醫院李牧蔚教授課題組的趙振舟和李雪潔等研究者，采用博奧晶典人類環狀RNA芯片 v2篩選得到冠心病病人外周血中表達明顯升高的circRNA，并研究了circRNA作為冠心病的診斷標志物的靈敏度和特異性，對于冠心病的診斷和治療提供了新的思路。
?
技 術 路 線
?
?
?
研 究 結 果
1.博奧晶典人類環狀RNA芯片v2高通量篩選circRNA
研究者選擇了臨床和統計學特征相匹配的12個對照組個體和12個冠心病組患者，取全血，用博奧晶典人類環狀RNA芯片v2對全血中的circRNA表達分析，結果發現兩組共有22個circRNA有差異性表達，其中在冠心病患者血液中表達上調的有12個，表達下調的有10個。
?
?
2. qPCR驗證芯片結果
按p＜0.01篩選共得到5條circRNA，本研究在另外一個獨立隊列（對照組, n=30; 冠心病組, n=30）中通過qPCR對其進行了驗證，最后得到的結果與微陣列分析結果相符，與在對照組外周血中的表達量相比，這5個circRNA在冠心病組中的表達量均明顯提高。
?
?
3.差異表達circRNA的ROC分析
為了比較這5個候選的circRNA對冠心病的臨床診斷能力，研究者分別對其進行了ROC分析，結果如下圖，其中hsa_circ_0124644的靈敏度和特異度最高，分別為：86.7%和76.7%。
?
?
4. 在獨立臨床樣本中驗證circRNA-biomarker
為了測試所hsa_circ_0124644的實際診斷價值，在另一個獨立隊列（115名對照組個體，137名冠心病組個體）中進行驗證。結果顯示hsa_circ_0124644在冠心病組的表達水平明顯上調，ROC分析表明其AUC為0.769（[0.710-0.827],p＜0.001，靈敏度為0.861，特異度為0.626）。在將糖尿病，吸煙，低密度，膽固醇，高血壓這些冠心病的危險因素加入之后，AUC輕度的提升到了0.804（[0.751-0.857],p＜0.001)，表明了較好的診斷價值。
?
?
?
?
研 究 結 論
?
?
?
?
近期的明星RNA分子，circRNAs，已被證實參與了多種疾病的的病理過程，但是冠心病患者外周血中circRNA的表達特點，以及是否存在可作為診斷冠心病biomarker的circRNA，目前尚未經證實；本研究通過前期高通量circRNA芯片篩選和后續大量臨床樣本的有力驗證，確定Hsa_circ_0124644在臨床的確有潛力，可作為冠心病診斷的biomarker。本研究選出的circRNA biomarker，具有取材方便，費用低廉，有較高的診斷價值和方便、快捷的診斷流程等優點。
?
文 獻 信 息
Zhao Z, Li X, Gao C, etal. Peripheral blood circular RNA hsa_circ_0124644 can be used as adiagnostic biomarker of coronary artery disease[J]. Scientific Reports, 2017, 7 : 39918.（IF=5.228）
?
?
博奧晶典人類環狀RNA芯片 v2
為了幫助廣大科研工作者對circRNA更好地研究，北京博奧晶典生物技術有限公司在人類環狀RNA芯片v1的基礎上全新升級為v2，該芯片是目前國內外市場檢測circRNA數量最多的芯片，便于研究者對不同生理和病理狀態下circRNA的表達變化進行系統研究，如進行疾病 biomarker 研究、功能研究、與 mRNA、miRNA 相互作用。
?
博奧晶典人類環狀RNA芯片v2的超高性價比給您無限期待！
?
芯片特點
? circRNA數量多 芯片全面覆蓋Circbase，Deepbase等數據庫，檢測circRNA數量達到170,340種，是國內和國外市場上檢測數量最多的芯片。
? 探針的特異性強 芯片探針覆蓋circRNA反向剪切位點，特異性高。一般情況下，該位點的序列不存在于基因組DNA和線性RNA分子中。
? 芯片檢測效率高 芯片探針的靶向檢測與二代測序的隨機測序相比具有更高的檢測效率。一次芯片實驗檢測circRNA數量遠高于常規轉錄組測序（5-10G數據量）。
? 芯片的準確性好 芯片開發過程中的測試結果表明，高達74%的差異circRNA能得到定量PCR驗證支持。
?
博奧晶典circRNA芯片產品
?
|
芯片 名稱 |
circRNA 來源 |
circRNA 數量 |
芯片 格式 |
芯片檢測 數量 |
|
博奧晶典人類環狀RNA芯片v2 |
Circbase Deepbase Mol Cel,2015 |
92,375 142,404 65,731 |
4x180K |
? 170,340 (單探針) |
|
? 博奧晶典小鼠環狀RNA芯片v1 |
Circbase Mol Cel, 2015 Gen Bio, 2015 Gen Bio,2014 Nat Neurosci ,2015 |
1,903 15,849 2,891 7,112 28,482 |
? 8x60K |
? 30,536 (雙探針) |
|
博奧晶典大鼠環狀RNA芯片v1 |
? ? Nat Neurosci ,2015 |
? ? 18,076 |
? ? 4x44K |
? ? 18,075 (雙探針) |
?
?
博奧晶典circRNA科研服務，不僅提供芯片檢測服務，也提供circRNA-Seq檢測服務。
?
產品咨詢：
bioservice@capitalbiotech.com
?
博奧晶典科研服務事業部 李青、吳潔、張西軒 |文案
部分配圖來源于網絡，侵刪