翼和生物多重PCR技術助力大小鼠遺傳質量鑒定-文獻綜述-資訊-生物在線

翼和生物多重PCR技術助力大小鼠遺傳質量鑒定

作者:上海翼和應用生物技術有限公司 2022-11-22T00:00 (訪問量:17862)

實驗動物簡介

實驗動物是具有明確遺傳背景并嚴格遺傳控制的動物,是人類醫學研究的重要工具之一,包括小鼠、大鼠、猴、兔、犬、豬、雞、地鼠、貓和豚鼠等多個物種,其中小鼠和大鼠為最常用的實驗動物。


根據遺傳特點的不同,實驗動物分為近交系、封閉群和雜交群


最常用的大小鼠近交系、封閉群


大小鼠遺傳質量鑒定

實驗動物具有明確遺傳背景,并需要進行遺傳控制,否則遺傳因素會干擾實驗結果。很多生命科學的研究,要求實驗動物的遺傳結構有較高的同一性、穩定性和純合度。這就提出了實驗動物的遺傳質量和監測的問題。每年進行遺傳質量鑒定是非常必要的。導致實驗動物不合格的主要是以下3個方面:

1.在繁殖飼養過程中,多個不同品系混養,可能會發生錯誤標記;

2.自身突變積累,導致遺傳特性漸漸與早期世代品系有差異;

3.封閉群繁育過程中,親本選配組合不當造成近交化。

現行的實驗動物遺傳質量控制的國家標準為《GB14923-2010?實驗動物 哺乳類實驗動物的遺傳質量控制》,國標中規定了實驗動物近交系和封閉群需定期(每年一次)進行遺傳檢測,確保遺傳質量。

國標GB14923-2010提及的遺傳質量檢測方法


目前針對大小鼠遺傳質量鑒定,除了國標GB14923-2010外,主要參考中國實驗動物學會團體標準《T/CALAS21-2017?實驗動物 小鼠、大鼠微衛星DNA標記檢測方法》。該團體標準由中國實驗動物學會實驗動物標準化專業委員會提出并組織,由中國食品藥品檢定研究院、首都醫科大學和浙江省醫學科學院共同起草完成。該標準明確規定了大小鼠遺傳質量鑒定的STR方案。新國標制訂計劃《實驗動物 近交系小鼠、大鼠SNP標記檢測法》已經于20201119日下達,并由中國食品藥品檢定研究院和上海實驗動物研究中心共同起草,目前處于起草階段。


多重PCR&二代高通量測序助力小鼠遺傳質量鑒定

翼和生物針對小鼠近交系和封閉群,從國際金標準Jackson實驗室2000SNP位點中優選出150SNP位點,采用多重PCR擴增建庫技術結合二代高通量測序進行SNP基因分型,并自寫軟件與Jackson數據庫進行比對。優選后的150SNP標記,可準確鑒別所有近交系小鼠,品系兩兩間關系最近的相差3SNP,關系最遠的相差73SNP,差異位點平均數為53個。優選后,大幅度降低成本的同時保證了鑒定結果準確性。



多重熒光PCR&ABI3730平臺STR基因分型助力大鼠遺傳質量鑒定

Biowing大鼠近交系和封閉群的遺傳質量鑒定服務,參照團標《T/CALAS21-2017?實驗動物 小鼠、大鼠微衛星DNA標記檢測方法》提供的STR引物方案,結合翼和生物多重PCR技術優勢,進行多重熒光PCRSTR分型,獲得樣本STR分型后,利用遺傳學分析軟件計算群體遺傳參數,依據團標T/CALAS21-2017的標準判斷大鼠近交系和封閉群是否合格。


送檢流程與周期

大小鼠遺傳質量鑒定檢測周期:2-3。


翼和實驗室資質


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