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? ? ? ?上回說到植物分子育種中,篩選百萬級的基因標記需要用到基因組測序和SNP定制芯片,這兩種方法適合于小樣本量,百萬級標記的篩選【分子育種專題年終盤點系列 | 基因標記篩選解決方案】。而當在利用高通量測序和SNP芯片的方式篩選出大量的性狀相關的SNP位點后,通常會針對特定區域SNP位點,進行超大樣品量驗證。那此時,哪種方法更加準確、快速、性價比更高呢?
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? ? ? ?AgriSeqTM 靶向測序,基于Ion AmpliSeq技術,多重PCR的金標準,是市場上最靈活和可擴展的GBS技術;配套高通量自動化工作站,實現快速和有效的工作流程。相比于高通量SNP基因芯片,AgriSeq對于<5000個標記的基因分型更為有效,單個樣本的成本更低,更高的樣本通量,獲得更多相關數據。

? ? ? ?AgriSeq靈活,準確,通量高,周期短,性價比高;已證明廣泛適用于各種作物物種;當然它不僅可以篩選驗證已有位點,也可用作新標記發現工具。

案例展示
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? ? ? ?江漢大學研究團隊利用AgriSeqTM技術開發水稻SSR基因分型應用,在8個水稻品種中鑒定到3,105個SSR標記,文章于2017年9月發表在Nucleic Acids Research上。
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? ? ? ?3,105個SSR應用指紋圖譜構建中,遠超過當前采用的48個SSR的國家農業標準;每兩個水稻品種間的SSR平均為449.71個;用該技術很容易將Xa21基因mapping在SSR21附近,然而PAGE電泳的方式卻未能檢測到。


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? ? ? ?而當最終跟性狀緊密相關的位點已鎖定在1~300個核心標記上,需要對超大樣本量進行檢測或驗證時,我們又有更優質的解決方案提供給各位老師。
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? ? ? ?博奧晶典根據國內種業需求,開發了國內首個具有自主知識產權的IMAP系統(微流控SNP芯片檢測系統)。從芯片制備、擴增反應、芯片掃描到分型軟件,為基因分型提供一整套簡便易行的解決方案,提取樣品基因組DNA后,可在2.5小時內輕松完成樣品SNP分型的檢測,從而實現低成本、快速、靈活的SNP分型,尤其適用于應用型芯片產品開發生產。

? ? ? ?IMAP系統具有操作簡單、快速、節約、持續更新的特點,目前已與多家單位合作開發多款應用型芯片,也成功完成了多種物種的分型檢測。

總結
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? ? ? ?目前可以說是生物技術飛速發展的時代,單細胞測序技術、基因編輯技術和人工智能技術等都推動著分子育種向分子設計育種階段跨越。博奧晶典也會不斷地研發和引進最新的科學技術,為分子育種事業助力。
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博奧晶典科研服務事業部 李超、李楠、李媛媛 | 文案
部分配圖來源于網絡 侵刪
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