2016生物信息學與藥物設計研討會?中國(重慶)
盛夏時節逢盛會,荷花飄香迎嘉賓。2016年7月29至31日,“第二屆生物信息學與藥物設計研討會”在重慶大學虎溪校區圖書館隆重召開。本屆大會圍繞“生物信息大數據處理與計算機輔助藥物設計”這一主題,重點探討了大數據背景下精準醫療的發展,并深入交流了新藥發現的新思路和新技術。大會由上海市生物信息學會與重慶市生物信息學會(籌)主辦,重慶大學藥學院承辦。來自重慶大學、美國北卡羅來納大學、美國國立衛生研究院、新加坡國立大學、中科院上海生科院、中科院上海藥物所、浙江大學、復旦大學、上海交通大學、同濟大學等國內外知名高校和科研單位的140余名師生參加了本次大會。
?
第一部分:大會開幕式
重慶大學校長助理夏之寧教授作為特邀嘉賓出席了大會,并代表重慶大學致開幕辭。重慶大學藥學院主任,國家“千人計劃”專家賀耘教授代表會議承辦單位致歡迎辭。開幕式由國家“青年千人計劃”入選者,重慶大學藥學院主任助理朱峰教授主持。
?
重慶大學校長助理,教育部“跨世紀優秀人才”專家,國務院政府特殊津貼獲得者,重慶大學藥學院教授 夏之寧
夏之寧教授作為特邀嘉賓出席了大會,并代表重慶大學致開幕辭。夏教授向各位來賓隆重介紹了重大建立“完備弘深之大學”的歷史使命和“研究學術、造就人才、佑啟鄉邦、振導社會”的辦學宗旨,并借用《滕王閣序》中的“登高作賦,是所望于群公”向本屆大會提出了殷切期望。
?
國家“千人計劃”專家,重慶市“百人計劃”專家,中美生物技術與制藥協會會長,重慶大學藥學院主任 賀耘
賀耘教授作為特邀嘉賓出席了大會,并代表會議承辦單位致歡迎辭。賀教授回顧了重慶大學藥學學科在校領導的全力支持下所實現的跨越式發展,從人才梯隊和學科組成等多個方面詳細介紹了藥學院的現狀,讓與會專家深切感受到了藥學院作為重大新建學院的蓬勃生機和光明前景。
?
國家“青年千人計劃”專家,中國化學會計算機化學委員會委員,重慶大學藥學院主任助理 朱峰
作為本屆大會組委會總負責人,朱峰教授向各位與會專家熱情介紹了專程來渝參會的國家“杰青”獲得者,教育部長江學者,四川大學華西藥學院秦勇教授,并作為大會開幕式主持人安排了整個大會進程。
?
第二部分:大會報告
大會報告各位專家分別從大數據與精準醫學、傳統中草藥研究和藥物設計與發現等不同角度,深入剖析了生物信息學與藥物設計領域的最新科研進展,強調要充分發揮生物信息學科的基礎性作用,重視生物醫藥大數據的收集與分析,不斷推進我國醫藥行業的健康發展。大會報告現場氣氛活躍,互動積極,為各位參會老師和同學們帶來了難得的學術視聽盛宴。
?
上海生物信息技術研究中心主任,上海市生物信息學會理事長,中科院上海生命科學研究院研究員 李亦學
作為本屆大會學術委員會主席,李亦學研究員圍繞國家“十三五”規劃重大基礎設施項目的建設,發表了題為“國家生物醫學大數據基礎設施”的精彩報告。他認為我們要重視醫療體系中的大數據,充分挖掘其潛在的應用價值,為精準醫療奠定基礎,從而更好地服務于人類的健康事業。
?
國家“千人計劃”專家,新加坡國立大學藥學院教授 陳宇綜
作為本屆大會學術委員會副主席,陳宇綜教授以屠呦呦對青蒿素的發現為案例深刻地探討了從傳統和現代醫藥中發掘新藥的新思路和新方法,探索如何應用現代科學方法從中藥和西藥中尋找發現新藥的線索,發現和鑒別出新藥源和新藥靶,從而讓世界更好地認識和了解中藥的價值。
?
中科院“百人計劃”專家,上海市“浦江人才”專家,中科院上海藥物研究所研究員 朱維良
作為本屆大會學術委員會副主席,朱維良研究員發表了題為“鹵鍵及其在藥物發現和設計中的應用”的精彩報告。報告從有機鹵鍵的基本概念、有機鹵鍵在解釋藥物-受體相互作用、在成藥性評價以及虛擬篩選等幾個方面展開,重點闡述了有機鹵鍵在藥物發現與設計中的重要意義。
?
第三部分:邀請報告
大會報告后,各位專家進一步開展了豐富的學術交流,眾多國內外著名的領域內專家分享了他們在科學研究中的寶貴心得,不僅深入介紹了各自的突破性研究成果,還與各位參會老師和同學開展了廣泛的學術交流和互動。。
?
浙江大學“求是”特聘教授,中國化學會計算機化學委員會秘書長,浙江大學藥學院教授 侯廷軍
評價了MM/PBSA和MM/GBSA在結合自由能計算方面的預測性能,發現不同模型、力場參數和介電常數均對兩者的預測性能有顯著的影響。
?
中科院“百人計劃”專家,上海市“浦江人才”專家,復旦大學生物醫學研究院教授 劉雷
對原發性肝細胞癌的代謝組和轉錄組數據進行分析,發現了相應的生物標志物,運用這些標志物對病患的分類表現出了顯著的生存差異。
?
中國醫藥科技成果轉化中心重慶分中心主任,高圣醫藥董事長,威斯騰生物醫藥科技有限責任公司董事長 周勇
高創匯是一個以原創新藥孵化平臺、新藥研發服務、新藥研發鏈式公共服務平臺作為平臺主營業務的互聯網載體,采用線上與線下的無縫結合。
?
國家自然科學基金“優青”獲得者,中國化學會計算化學委員會委員,上海交通大學醫學院醫藥生物信息學中心主任、教授 張健
通過生物信息學與化學生物學手段分析了存在變構效應的各種蛋白的特征,發現了變構調控藥物的基本特征,為該類藥物的合理設計奠定了基礎。
?
上海市生物信息學會理事,教育部“新世紀優秀人才”專家,同濟大學生命科學與技術學院教授 曹志偉
探討了其課題組在運用組合藥物協同作用開展癌癥治療方向上的最新研究進展,該發現在臨床研究中已經顯示出了良好的臨床效果。
?
中國化學會計算機化學專業委員會委員,教育部“新世紀優秀人才”專家,廈門大學生命科學學院教授 紀志梁
介紹了其在大范圍大數據搜尋藥物副作用領域的研究進展,通過采用計算機高通量搜尋方法,為精準醫療研究指出了新的研究方向。
?
上海市“浦江人才”專家,同濟大學生命科學與技術學院教授 江賜忠
揭示了Oct4在體細胞重編程的表觀遺傳重排過程中的完整分子路線圖,為下一步的重編程研究提供了豐富的研究資源。
?
中國化學會計算機化學專業委員會委員,吉林大學理論化學計算所教授 鄭清川
介紹了CYP家族重要蛋白對底物的選擇性及其催化機理,清晰地闡明了CYP家族蛋白對底物的選擇性,基于此提出了該類藥物設計和優化的思路和方法。
?
美國北卡羅來納大學助理教授 姚麗霞
提出了用于衡量醫藥產業投入與需求關系的新型指數——健康科研機會指數(Health Research Opportunity Index),并指出乳腺癌是被過度投入的典型疾病。
?
浙江省微生物生化與代謝工程重點實驗室副主任,教育部“新世紀優秀人才”專家,浙江大學藥學院教授 陳新
揭示了組學技術與表型效應之間的復雜關系,從生物功能的層面理解疾病的發病機制和有效的治療方案,對開發新型疾病干預方法具有指導意義。
?
美國國家生物技術信息中心高級科學家 韓漣漪
介紹了其團隊最新構建的結合序列標記化(tokenization)技術和現代搜索引擎的組合序列比對方法,該方法大大提高了蛋白質序列相似性搜索的效率。
?
南京大學配位化學國家重點實驗室教授,南京大學化學化工學院教授 汪蓉
介紹了其課題組在DNA誘導的納米粒子裝配方向的研究工作,該工作通過分子動力學模擬發現了控制DNA功能化納米粒子自組裝和結晶化的關鍵溫度。
?
人工智能與模式識別專業委員會委員,生物信息學專業組委員,生物信息學與人工生命專委會委員,天津大學計算機學院教授 鄒權
介紹了其開發的LibD3C在線分類服務器,該分類器可以在不依賴于參數調節的基礎上,處理不平衡的正負數據集,并達到良好的分類效果。
?
重慶大學“百人計劃”專家,重慶大學化學化工學院研究員 藍宇
分享了其課題組在計算化學方向的創新性研究工作,重點介紹了其運用計算手段在構建季碳中心和立體化學方向上的豐碩研究成果。
?
重慶郵電大學生物信息學院院長、教授 舒坤賢
從高通量蛋白組學研究出發,介紹了其在整合蛋白組資源方向上的開創性研究成果——iProX,一個用于整合現有蛋白組學數據的網絡數據庫。
?
第三軍醫大學基礎醫學部生物信息學中心主任、教授 鄒凌云
介紹了其構建的網絡在線服務器T4EffPred,該服務器主要運用支持向量機方法在基因組層面預測Type IV細菌的secreted effectors。
?
杭州師范大學醫學院教授 陶林
闡述了其研究方向——研究并發現所有天然藥物在全化學空間中的聚類分布現象,并指出醫藥工業相關從業者將對該發現有著廣泛的興趣。
?
第四部分:后記
生物信息學對蛋白質和核酸功能的研究,為新藥開發提供了全新的思路,特別是為藥物設計中先導化合物的發現、藥物靶標的發現、藥物與靶點的相互作用等提供了全新的研究手段。本屆會議的成功舉辦為各位專家學者提供了一個共同探討和交流的平臺,促進了生物信息學與藥物設計研究的有機結合和協作。
?
