?生物素隨機引物DNA標記試劑盒(Biotin Random Prime DNA Labeling Kit)是一種通過隨機引物標記反應產生生物素標記DNA探針的試劑盒。本試劑盒標記的生物素DNA探針可以用于常規的Northern、Southern、colony或plaque hybridization、dot或slot blot、原位雜交等。
在Klenow酶(Klenow?fragment,3'-5'exo-)催化下,通過隨機引物標記反應(random prime labeling)可以把生物素標記的Biotin-11-dUTP摻入到新合成的DNA探針中,這樣就可以產生生物素標記的DNA探針。在隨機引物標記反應過程中,一些標記好的DNA探針可以被Klenow酶從模板DNA鏈上驅趕下來。這樣在模板量較少的情況下,通過隨機引物標記反應,最后可以產生比模板DNA量更多的生物素標記DNA探針,可多達1-15倍左右。
本試劑盒可以用于多種DNA模板的標記,包括DN**段、線性化的質?;騝osmid、超螺旋DNA等。用于本試劑盒的模板DN**段應不小于100bp,小于100bp的DNA模板可以使用生物素3'末端DNA標記試劑盒(D3106)進行DNA探針標記。
用于本試劑盒的模板DNA的量應不少于10ng,推薦的模板用量為100ng-1μg。
本試劑盒中提供了已經用生物素標記好的Biotin-Control DNA,可以用作檢測生物素DNA探針標記效率的對照。
生物素標記DNA可以使用化學發光法生物素標記核酸檢測試劑盒(D3308)或其它適當試劑盒進行檢測。
本試劑盒可以用于10個標記反應。
包裝清單:
| 產品編號 | 產品名稱 | 包裝 |
| D3118-1 | Random Primer in Buffer(5X) | 105μl |
| D3118-2 | Klenow Fragment | 11μl |
| D3118-3 | Biotin-Labeling Mix | 50μl |
| D3118-4 | Ultrapure Water | 1ml |
| D3118-5 | Biotin-Control DNA(3ng/μl) | 50μl |
| D3118-6 | 探針標記終止液 | 100μl |
| — | 說明書 | 1份 |
保存條件:
-20℃保存。
注意事項:
需自備用于探針標記效率檢測的相關試劑。
本產品僅限于專業人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。
為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
使用說明:
1. 在一離心管或PCR管內加入100ng-1μg?DNA模板,再加入適量試劑盒提供的Ultrapure Water,至總體積為34μl。
說明:通常100-300ng?DNA模板已經足夠用于一次標記反應。
2. 加入10μl?Random Primer in Buffer (5X),混勻。如有液滴沾在管壁上,高速離心數秒使所有液體集中在管底。
3. 沸水浴加熱5分鐘,或在PCR儀上100℃加熱5分鐘(如果不能設置100℃,99℃加熱5分鐘也完全可以)。
4. 立即放置到預先準備好的冰水浴中至少2-3分鐘。
5. 加入5μl?Biotin-Labeling Mix。
6. 加入1μl?Klenow Fragment,混勻。如有液滴沾在管壁上,高速離心數秒使所有液體集中在管底。
7. 37℃孵育1小時或過夜(不宜超過20小時)。37℃孵育過夜可以顯著增加生物素標記DNA的產量,因此推薦孵育過夜(12-20)小時。
8. 加入3μl探針標記終止液,混勻,終止標記反應。至此標記反應已經全部完成,標記好的DNA可以-20℃保存。
9. 此時探針可以直接用于探針標記效率的檢測及Southern、Northern等后續操作。
10. 整個探針標記反應的流程參見下表:
| 100ng-1μgDNA模板 | xμl |
| Ultrapure Water | (34-x)μl |
| Random Primer in Buffer (5X) | 10μl |
| 100℃ 5分鐘,立即冰浴冷卻 | |
| Biotin-Labeling Mix | 5μl |
| Klenow Fragment | 1μl |
| 總體積 | 50μl |
| 37℃孵育過夜 | |
| 探針標記終止液 | 3μl |
| -20℃保存 | |
| 此時可用于標記效率的檢測及Southern、Northern等后續檢測 | |
11. 探針標記效率的檢測:可以對標記好的探針進行適當梯度稀釋后,使用化學發光法生物素標記核酸檢測試劑盒(D3308)或其它適當的方法進行檢測。通常探針的標記效率可以參考下表:
| 模板DNA量 | 生物素標記DNA產量 | |
| - | 孵育1小時 | 孵育20小時 |
| 10ng | 80ng | 900ng |
| 30ng | 150ng | 1350ng |
| 100ng | 350ng | 1650ng |
| 300ng | 750ng | 2200ng |
| 1000ng | 1300ng | 2600ng |
| 3000ng | 1600ng | 2600ng |
注意:具體的探針標記效率還和模板DNA的長度、純度等因素有關,上表的數值僅供參考。
12. 使用本試劑盒所獲得的生物素標記DNA的長度通常在數百bp左右。具體的長度因模板的長度而有所不同。例如模板DNA的長度為1kb,則生物素標記DNA產物的長度通常為100-1000bp,平均長度約為300bp左右。
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