Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Bacterium)-分析方法-資訊-生物在線

Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Bacterium)

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-11-04T00:00 (訪問量:4107)

?Uracil-DNA Glycosylase (Heat-labile, Bacterium),也稱Heat-labile Bacterial UDG,即熱敏型細菌UDG,來源于嗜冷海洋細菌(psychrophilic marine bacterium) BMTU3346,可催化含尿嘧啶的DNA鏈中的尿嘧啶(dU)堿基和脫氧核糖之間的N-糖苷鍵發生水解,從而釋放游離尿嘧啶。Uracil-DNA Glycosylase (UDG)可以水解含有dU的單鏈或雙鏈DNA,但不能水解RNA或含有dU的長度不超過6個堿基DNA寡聚體。

?

?

?

UDG主要應用于消除PCR擴增過程中帶來的產物污染問題。其防止污染的原理為:在PCR反應中加入適量的dUTP,以dUTP替代dTTP摻入DNA中,形成含dU堿基的PCR擴增產物;后續進行PCR反應時,使用UDG酶選擇性切割可能被污染而帶入的之前PCR擴增產生的含有dU的單鏈或雙鏈DNA,從而避免之前的PCR擴增產物可能的污染對于本次PCR擴增帶來的負面影響。

本產品為熱敏型,在50℃孵育10分鐘可以迅速不可逆滅活。在PCR或RT-PCR反應前,PCR或RT-PCR體系中加入Heat-labile Bacterium UDG室溫處理10min,即可充分消除可能的之前的含有dUTP的PCR擴增產物的污染。本產品不僅適用于PCR,也適用于qPCR、RT-PCR和qRT-PCR等體系。

活性定義:One unit is defined as the amount of enzyme that catalyzes the release of 60 pmol of uracil per minute from double-stranded, uracilcontaining DNA. Activity is measured by release of [3H]-uracil in a 50 μl Standard?Taq?Reaction Buffer containing 0.2 μg DNA (104–105?cpm/μg) in 30 minutes at 37℃.

Heat-labile Bacterial UDG酶活性鑒定結果可參考圖1。

圖1.Heat-labile Bacterial UDG催化酶解5μl含dU堿基的PCR擴增產物效果圖。使用本產品或國外N公司的酶,在20μl體系,分別以5μl含dU堿基的PCR擴增1500bp PCR產物為底物和不同量的(0U, 0.0313U, 0.0625U, 0.125U, 0.25U, 0.5U) Heat-labile Bacterial UDG,在1X Heat-labile Bacterial UDG Buffer,37℃孵育30min,然后進行1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。如圖所示,本產品與N公司相比,具有相當的酶活。M, DNA marker (D0110 DNA Ladder (0.2-12 kb, 12 bands))。

Heat-labile Bacterial UDG經滅活處理后酶活鑒定結果可參考圖2。

圖2.Heat-labile Bacterial UDG以及E. coli?UDG (D7360)經50℃10min處理后,催化酶解5μl含dU堿基的PCR擴增產物效果圖。將不同量的E. coli?UDG (0U, 0.005U, 0.01U, 0.025U)和不同量的Heat-labile Bacterial UDG (0U, 0.0625U, 0.125U, 0.25U)經50℃處理10min之后,在20μl體系,分別以5μl含dU堿基的PCR擴增1500bp PCR產物為底物,在1X Heat-labile Bacterial UDG Buffer,37℃孵育30min,然后進行1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。如圖所示,E. coli?UDG 50℃處理10min之后酶活僅輕微下降,而Heat-labile Bacterial UDG均完全滅活。M, DNA marker (D0110 DNA Ladder (0.2-12 kb, 12 bands))。

來源:大腸桿菌重組、表達和純化而獲得。

純度:不含UDG酶活力之外的內切或外切脫氧核糖核酸酶、RNase和磷酸酶活性。

用途:去除單鏈或雙鏈DNA尿嘧啶堿基;去除含dU的PCR產物氣溶膠污染;在二代測序(NGS)應用中,主要用于mRNA定向測序文庫的構建;用于提高定向誘變方法的效率和用來獲得高度標記的寡核苷酸探針;用于PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR體系。

酶儲存溶液:20mM Tris-HCl (pH 7.5), 50mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 50% (v/v) glycerol。

10X Heat-labile Bacterial UDG Buffer:100mM Tris-HCl, 500mM KCl, 15mM MgCl2, pH 8.3 at 25℃。

失活或抑制:50℃加熱10min可以使Heat-labile Bacterial UDG完全失活。

包裝清單:

產品編號 產品名稱 包裝
D7362S-1 Heat-labile Bacterial UDG (1U/μl) 100μl
D7362S-2 10X Heat-labile Bacterial UDG Buffer 500μl
說明書 1份

?

產品編號 產品名稱 包裝
D7362M-1 Heat-labile Bacterial UDG (1U/μl) 500μl
D7362M-2 10X Heat-labile Bacterial UDG Buffer 2.5ml
說明書 1份

保存條件:

-20℃保存,至少一年有效。

注意事項:

Heat-labile Bacterial UDG酶在大多數PCR或RT-PCR體系中均具有活性,但對于自行使用的PCR或RT-PCR體系,首次使用時建議先測試一下是否和所使用的體系兼容。通常取含dUTP的PCR擴增產物,參考圖1加入適量UDG,觀察能否有效降解含dUTP的PCR擴增產物。本產品會被高離子強度(>100mM)所抑制。

dNTP/dUTP推薦選購D7376 dNTP/dUTP Mixture (2.5mM each/5mM)。

Heat-labile Bacterial UDG酶對雙鏈DNA的活性低于對單鏈DNA的活性,對小的U-DNA寡核苷酸和dUMP有活性,但對RNA或正常的不含dUTP的DNA沒有活性。

Heat-labile Bacterial UDG酶活對于金屬離子沒有依賴性,在Mg2+或EDTA的存在情況下均具有活性。

由Heat-labile Bacterial UDG酶消化產生的DNA鏈的無堿基位點可通過加熱,堿處理或核酸內切核酸酶處理而除去。通常PCR反應過程中的加熱步驟可以確保UDG酶消化的位點被完全剪切開。

Heat-labile Bacterial UDG酶可以在PCR反應前清除不慎污染的含dUTP的PCR產物,從而避免由于污染導致的PCR假陽性結果。

如果需要將Heat-labile Bacterial UDG酶應用于One-Step RT-PCR或者One-Step qRT-PCR體系,需要選擇耐熱反轉錄酶,并需要將逆轉錄溫度設置為50-55℃。

本產品僅限于專業人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。

為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

使用說明:
1.按照常規反應體系設置PCR或RT-PCR反應體系,同時加入Heat-labile Bacterial UDG至最終濃度為0.02U/μl,混勻。通常僅加入PCR或RT-PCR的buffer即可,無需加入UDG的buffer。
2.25℃孵育5-10min (去除可能的含dUTP的PCR擴增產物的污染),隨后進入PCR或RT-PCR程序。??

?

?

?



?

上海雅吉生物科技有限公司 商家主頁

地 址: 上海市閔行區元江路5500號第1幢5658室

聯系人: 王源

電 話: 15301693058

傳 真: 021-34661275

Email:yajikit@163.com

相關咨詢

人原代附睪管上皮細胞 (2021-07-08T14:16 瀏覽數:25496)

雅吉生物熱烈慶祝中國建黨100周年 (2021-07-02T09:17 瀏覽數:20284)

15P-1 (小鼠睪丸上皮細胞) (STR鑒定正確) (2021-06-23T09:59 瀏覽數:23279)

客戶細胞培養過程中常見的問題說明 (2021-06-18T09:54 瀏覽數:26220)

免疫熒光鑒定步驟 (2021-06-18T09:54 瀏覽數:27464)

人真皮成纖維細胞的分離培養制備方式 (2021-06-17T09:04 瀏覽數:23621)

原代角質形成細胞的分離培養方法 (2021-06-17T09:03 瀏覽數:26824)

鉆石探頭量子顯微鏡可以探索納米微觀世界的奧秘 (2021-06-16T09:24 瀏覽數:25317)

過氧化物酶體活化受體可以加劇腫瘤形成 (2021-06-16T09:23 瀏覽數:23178)

式細胞術數據分析之——圈門技巧 (2021-06-15T10:11 瀏覽數:23116)

ADVERTISEMENT