BioNano系統，讓基因拼接如虎添翼

時間：2013年4月18日 來源：晶能生物

第二代測序的出現實現了低成本高通量的基因組測序，但是100bp左右的短讀長卻嚴重限制了基因組的完整拼接。尤其是當遇到長片段的重復序列時，傳統的contig組裝和De novo拼接只能面對缺口望洋興嘆。為了掌握直觀而全面的基因組結構信息，挖掘出其中的生物學奧秘，科學家們迫切期盼著一種簡化基因組拼接的新技術。

BioNano公司站在了基因組拼接的最前線。他們推出了Irys系統用于長鏈DNA的單分子成像。該系統利用單酶酶切和熒光標記對長達幾百kb的單鏈DNA分子進行成像，利用高質量圖像使基因組結構通過酶切圖譜的方式展現無遺。Irys特有的超長序列讀長能夠輕松跨越重復片段和一些包含復雜元件的區域，在大大簡化基因組組裝的同時也讓困擾NGS技術的拼接缺口無處遁形。

已有文章利用該技術快速將節節麥的2.1M高重復區域的組裝完整性由75%提升至95%，技術平臺操作的簡便性和結果的準確性力證了Irys技術的廣闊應用前景。BioNano單分子成像技術無疑為全基因組結構研究，尤其是De novo和染色體結構變異方面提供了全新的研究方法。

作為BioNano在中國唯一的服務商，晶能生物技術有限公司致力于為廣大客戶提供最為**和完善的生物技術服務。日前，晶能生物已經配備了國內首套BioNano系統，并同時推出了BioNano單分子測序服務。憑借晶能生物雄厚的科研力量和完善的服務體系，相信該服務的推出必將為國內生物技術服務行業的發展注入新的活力。

（文：林泓）

參考文獻：

1. Das SK, Austin MD, Akana MC, et al. Single molecule linear analysis of DNA in nano-channel labeled with sequence specific fluorescent probes. Nucleic Acids Res 2010;38:e177.

2. Lam ET, Hastie A, Lin C, et al. Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Nat Biotechnol 2012;30:771-776.

3. Hastie AR, Dong L, Smith A, et al. Rapid genome mapping in nanochannel arrays for highly complete and accurate de novo sequence assembly of the complex Aegilops tauschii genome. PLoS One 2013;8:e55864.