熱啟動mTTx DNA/RNA 聚合酶-分析方法-資訊-生物在線

熱啟動mTTx DNA/RNA 聚合酶

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2021-03-25T00:00 (訪問量:2778)

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TTx DNA聚合酶源于Tth DNA聚合酶,而逆轉錄活性較Tth DNA聚合酶大幅提高,在優化的反應Buffer中,TTx表現出卓越的RT-PCR特性,但TTx DNA Polymerase的活性仍然依賴于對PCR有抑制活性的Mn2+,這種專用的反應Buffer系統限制了TTx應用的拓展性。mTTx DNA/RNA聚合酶經電子重構架技術,改變了TTx的活性配體中心,使其在Mg2+條件下仍然具有極強的逆轉錄活性。mTTx DNA/RNA Polymerase在Mg2+條件下對于DNA模板和RNA模板擴增能力幾乎無偏差,這種獨有的特性使得mTTx不再受限于反應Buffer系統,增加了其應用的拓展性,使得多種類型的實驗得以實現,包括:采用單酶進行TaqMan RT-PCR、在單管相同的Buffer系統中對RNA和DNA進行多重檢測、超多重的RNA模板擴增、RNA的NGS建庫、高保真RT-PCR擴增等。

主要特征

  • 依賴于DNA模板的聚合酶活性;
  • 5'-3'外切酶活性,用于TaqMan探針切割;
  • 金屬配體離子為Mg2+,通常使用濃度2-3.5mM;
  • 可以有效的使用dUTP,建立防污染體系;
  • 相比于TTx DNA聚合酶,mTTx的耐熱性能有所下降,92℃條件下的半衰期為30min;
  • 熱啟動版本的mTTx在50℃條件下100%無活性,92℃加熱5min后恢復活性。

單位定義

一個活力單位即在在68°C條件下,30分鐘內催化10 nmol dNTP的摻入反應成為酸不溶性物質所需的酶量。

儲存

-20℃可保存3年,避免反復凍融。

使用方法(以mTTx RNA Probe RT-qPCR MasterMix為例)

1. 按以下組分配制RT-qPCR反應液
2×mTTx MasterMix? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?10 μl
上游引物(10 μM)?????????????? ?????????????? ?????????????? 0.4 μl
下游引物(10 μM)?????????????? ?????????????? ?????????????? 0.4 μl
熒光探針(10 μM)?????????????? ?????????????? ?????????????? 0.2 μl
RNA? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? X μl
ddH2O? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Up to 20 μl
注意:引物和探針的使用濃度可在0.1-0.8ul直接調整。
2. Direct One-Step RT-PCR程序
92℃? ? ? 5 min (熱啟動)
60℃? ? ? 5 min (逆轉錄)
92℃? ? ?10 s?
60℃? ? ? 30 s(收集信號) ?循環35-45次
注意:mTTx的最佳變性溫度為92℃,其它溫度條件都會導致試劑性能下降。逆轉錄步驟的溫度可根據實際情況在58-70℃調整。

實例展示

1. 以2019新冠病毒N基因體外轉錄RNA直接作為模板,應用mTTx RNA Probe RT-qPCR MasterMix對不同拷貝的目標RNA進行TaqMan qPCR擴增,結果表明不同拷貝數的RNA,擴增性能良好。
直接一步法RT-qPCR
2. 應用mTTx RNA Probe RT-qPCR MasterMix對不同拷貝的目標DNA和RNA進行TaqMan qPCR擴增,結果表明該產品對DNA模板和RNA模板擴增幾乎無偏差,RNA模板比DNA模板更容易檢出。
直接一步法RT-qPCR
3.將不同數量的Jurkat細胞直接加入到TaqMan PCR反應體系中,應用mTTx RNA Probe RT-qPCR MasterMix進行內參基因GAPDH的TaqMan qPCR擴增。
直接一步法RT-qPCR
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