cDNA第一鏈合成試劑盒(RNase H-)-分析方法-資訊-生物在線

cDNA第一鏈合成試劑盒(RNase H-)

作者:上海雅吉生物科技有限公司 2020-11-04T00:00 (訪問量:4685)

??cDNA第一鏈合成試劑盒(RNase H-),即First Strand cDNA Synthesis Kit(RNase H minus)是一種采用了經過改造和優化的M-MuLV反轉錄酶(RNase?H-),用于在總RNA、mRNA等RNA模板的基礎上反轉錄產生

cDNA第一鏈的試劑盒。本試劑盒包含了進行cDNA第一鏈合成所需的各種試劑。
采用本試劑盒可以合成長達13kb的cDNA第一鏈。在采用M-MuLV反轉錄酶(RNase?H-)的情況下,由于缺失了RNase?H,RNA和DNA雙鏈復合物中的RNA不會被降解,這樣反轉錄出來的cDNA的長度就會更長,并且產量更高。
試劑盒中提供了RNase?Inhibitor,確保在反轉錄過程中的RNA不會被RNA酶所降解并取得較好的反轉錄效果。
試劑盒還提供了Oligo(dT)18和random?hexamer這兩種引物,前者適合用于帶有Poly(A)尾的mRNA的反轉錄,后者進行反轉錄時不需要poly(A)尾。也可以自行采用基因特異性引物進行cDNA第一鏈的合成。
試劑盒中提供的Control Primer為17聚,即引物的長度為17個堿基。試劑盒中提供的Control RNA為帶有3’poly(A)的
1.1kb RNA。
使用本試劑盒合成的第一鏈,可以直接用于后續的常規PCR、real-time PCR、cDNA第二條鏈的合成等。
本試劑盒用于體積為20微升的cDNA第一鏈合成反應時足夠進行10個cDNA第一鏈樣品的合成。
包裝清單:

產品編號 產品名稱 包裝
D7166-1 M-MuLV反轉錄酶(RNase H-)(200U/μl) 2000U
D7166-2 Reaction Buffer(5X) 50μl
D7166-3 RNase Inhibitor(20U/μl) 10μl
D7166-4 dNTP Mix(10mM each) 20μl
D7166-5 Oligo(dT)18?Primer(0.5μg/μl) 10μl
D7166-6 Random Hexamer Primer(0.2μg/μl) 10μl
D7166-7 Control RNA(20ng/μl) 6μl
D7166-8 Control Primer(5pmol/μl) 6μl
D7166-9 DEPC-treated Water 0.2ml
說明書 1份

保存條件:
-20℃保存。
注意事項:?
對于GC含量比較高的RNA的反轉錄,試劑盒的使用說明中給予了特別說明,請予以關注。
本產品僅限于專業人員的科學研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內。

為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。?

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使用說明:
1. cDNA第一條鏈的合成(First-strand cDNA Synthesi):
a. 參考如下表格設置反轉錄反應:

模板(后面4種任選一種) Total RNA 0.01-5μg
或Poly(A) RNA/mRNA 1-500ng
或Specific RNA 0.01pg-500ng
或Control RNA 2μl
引物(后面3種任選一種) Oligo(dT)18?Primer (0.5μg/μl) 1μl
Random Hexamer Primer (0.2μg/μl) 1μl
Gene specific primer 15-25pmol
DEPC-treated Water To 12μl*
70℃孵育5分鐘,隨后立即放置到冰浴冷卻,4℃微離心,隨后加入下述試劑**
Reaction Buffer (5X) 4μl
RNase Inhibitor (20U/μl) 1μl
dNTP Mix (10 mM each) 2μl
MuLV反轉錄酶(RNase H-) 1μl
總體積 ? 20μl

*To 13.7μl表示加入DEPC-treated Water至最終體積為13.7μl。
70℃孵育5分鐘并且隨后冰浴冷卻,這樣可以使RNA模板的二級結構充分打開。
b. 輕輕混勻(可以用Vortex在最低速度輕輕混勻或用移液器吹打混勻),隨后離心沉淀液體。
c.?如果使用Oligo(dT)18作為引物或使用基因特異性引物,在42℃孵育60分鐘。如果使用random hexamer(隨機六聚體)作為引物,先在25℃孵育10分鐘,隨后在42℃孵育60分鐘。
注意:對于GC含量比較高的RNA模板的反轉錄反應,可以設置為45℃孵育60分鐘。
d. 70℃孵育10分鐘以失活 M-MuLV反轉錄酶(RNase H-)并終止反轉錄反應。
說明:對于長片斷的cDNA不推薦采用加熱的方法失活M-MuLV反轉錄酶(RNase H-),這種操作可能會導致部分長片斷DNA被剪切。
e. 反轉錄產物可以直接用于后續的PCR等反應,也可以-20℃凍存以備以后使用。用于后續PCR反應時,如果PCR的反應體系為50微升,則推薦使用2微升反轉錄產物。
2. 其他用途請自行參考M-MuLV反轉錄酶(RNase H-)的相關文獻資料進行。
常見問題:
1. RNA反轉錄產物電泳觀察不到。
反轉錄產物由于是從模板反轉錄而獲得,而模板的量本身比較低,反轉錄的量通常還要少于模板量,因此通常RNA的反轉錄產物直接電泳觀察是觀察不到的。
2. 反轉錄產物通過PCR擴增沒有特異性條帶。
PCR擴增沒有獲得特異性條帶時建議先使用actin、GAPDH等作為內參進行PCR擴增,看是否可以成功擴增。如果可以成功,則說明PCR擴增體系沒有問題,此時通常是目的基因的引物設計欠佳,當然也有可能是反轉錄產物質量欠佳。如果內參不能被很好地擴增,則有可能PCR體系存在問題或反轉錄產物質量欠佳。

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