環(huán)境微生物群落多樣性分析,基于Roche 454 FLX +、Illumina MiSeq等第二代高通量測序平臺,對核糖體RNA高變區(qū)域,比如16S/18S/ITS等序列;或功能基因,比如細菌和古菌的氨氧化酶基因進行測序,揭示環(huán)境樣品中眾多不同類型微生物種類以及它們之間的相對豐度和進化關系。
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鳥槍法戰(zhàn)略(Shotgun Strategy)又稱隨機測序戰(zhàn)略,是由美國塞萊拉遺傳公司創(chuàng)始人克雷格•文特爾發(fā)明,主要針對大片段的全長測序
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TA克隆技術(TA cloning)利用Taq聚合酶具有末端轉(zhuǎn)移酶(TdT)活性,但卻不具有3''''-5''''端外切酶校準活性的特點,可在PCR產(chǎn)物的3''''端加上一個非模板依賴堿基“A”。
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真菌屬于較低等的真核生物,種類繁多,在自然界中分布廣泛。據(jù)估計,全世界約有150萬種真菌,其中包含許多具有重要的藥用價值和食用價值的有益真菌,同時也存在著大量能引發(fā)動植物病害的致病菌。因此,合理利用有益真菌,控制和預防有害真菌對人類的生產(chǎn)和生活具有重要的
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傳統(tǒng)的真菌分類鑒定主要是按照真菌的形態(tài)、生長以及生理生化等特征對真菌進行分類。然而真菌的種類繁多,個體多態(tài)性明顯,而且其生長、生理生化特征也會隨著環(huán)境的變化而不穩(wěn)定。因此,采用傳統(tǒng)的方法對真菌進行正確的分類存在較大的困難。
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宏基因組測序即利用測序技術對環(huán)境樣品中全部微生物的基因組進行測定,以分析微生物群體的基因組成及功能,解讀微生物群體的多樣性和豐度,探索微生物與環(huán)境及宿主之間的關系,發(fā)掘和研究新的具有特定功能的基因等
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是根據(jù)核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,并且在每個堿基后面進行熒光標記,產(chǎn)生以A、T、C、G結束的四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進行檢測,從而獲得可見的DNA堿基序列。華美瑞康為您提供專業(yè)的Sanger測序服務:DNA
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技術特點1. 原理簡單,容易掌握,適合短基因片段的SNP篩查。2. 檢出率接近100%。3. 可以發(fā)現(xiàn)新的SNP位點。
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細菌人工染色體(Bacterial Artificial Chromosome,BAC)文庫的構建是進行基因組研究的一項重要基礎性工作,特別是對大基因組及超大基因組來說更是如此,在物理作圖、基因圖位克隆、基因結構和調(diào)控等研究中發(fā)揮了重要作用。
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