動植物基因組重測序

?

在已知物種基因組的情況下，對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序，可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法，可以尋找出大量的單核苷酸多態性位點（SNP），插入缺失位點（InDel,Insertion?Deletion）,結構變異位（SV,Structure?Variation），拷貝數變異（Copy?Number?Variation,CNV）等變異信息，從而獲得生物群體的遺傳特征。這對在群體水平上研究物種的進化歷史，環境適應性，自然選擇等方面具有重大意義。利用全基因組重測序有助于快速發現與動植物重要性狀相關的遺傳變異，縮短分子育種的實驗周期；有助于發現人類疾病相關的重要變異基因，加快生物醫藥研發的速度等?？梢灶A期隨著測序成本的進一步降低以及已知全基因組序列物種的增加，重測序必將成為生命科學領域的研究利器。

?

迪奧優勢

?

擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術平臺，可以根據合作伙伴要求靈活安排實驗，實驗周期短，質量可靠。

?

擁有Roche454和IIIumina?Solexa兩種高通量測序平臺，合作伙伴可根據具體需求進行選擇，以獲得最佳的實驗結果。

?

技術人員經驗豐富，可以根據合作伙伴要求在第一時間提供實驗方案，解決實驗問題，分析實驗結果。

?

擁有專業的生物信息團隊和大型計算機，可以為合作伙伴提供個性化的生物信息分析服務。

?

?

?

?

生物信息分析

?

?

1.?原始數據統計

?

2.?短序列mapping至參考基因組

?

3.?分析mapping區域reads的覆蓋度，重復性，覆蓋堿基的質量及reads方向

?

4.?SNPs,InDel,CNVS檢測

?

5.?結構變異（SVs）和基因組重排事件分析

?

?

?

?

實驗周期

?

?

迪奧生物從獲得合用伙伴樣品到高通量測序，一般控制在40個工作日左右完成。

?

送樣要求

?

1.?DNA樣品：濃度>=100ng/ul，總量>=50ug.OD值在1.8-2.0之間，樣品濃度越高越好。

?

2.?植物樣品：需要黑暗無菌條件下培養的黃化苗，組培樣品或嫩苗。

?

3.?動物樣品：應挑選肌肉，血等脂肪含量較少的組織進行取樣。為了減少個體差異對后續

生物信息分析產生的影響，應盡量從同一個體中取樣，若物種體積較小，從一個個體提取的DNA量不夠進行一次測序反應，在保證量的情況下，應盡量減少個體的個數。

?

4.?請填寫完整的送樣訂單，用自封袋密封后隨同樣品一起送樣。