SNP檢測

單核苷酸多態性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNP）是指基因組上單個核苷酸的變異，人類基因組平均每1000個就有一個SNP。它是由基因組DNA某一特定核苷酸位置上單個堿基的轉換、顛換、插入或缺失引起的點突變，使得群體之間和個體之間產生了差異。其中轉換和顛換發生頻率較高，轉換是指同型堿基之間的轉換，即嘌呤與嘌呤、嘧***與嘧***間；顛換是指發生在嘌呤與嘧***之間的替換。事實上轉換的發生頻率占多數，且CG序列上出現的SNP最為頻繁，而且多是C轉換為T，原因是CG中的C常因為甲基化自發地脫氨基后即成為T。

技術應用

SNP作為第三代遺傳標記，在復雜疾病的基因定位、關聯分析、個體疾病易感性分析與藥物基因組學的研究中發輝了重要的作用。除醫學研究外，SNP已逐漸涉及遺傳學、生態學、作物育種眾多鄰域。研究對象也由人類擴展到有重要經濟價值和研究價值的動植物、微生物等。

SNP分型檢測技術服務

SNP(single nucleotide polymophism)，即單核苷酸多態，是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態。一般來說，一個SNP位點只有兩種等位基因，因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發生頻率比較高，大約平均每1000個堿基中就有一個多態位點，是繼微衛星之后的第三代遺傳標記。有些SNP位點還會影響基因的功能，從而導致生物性狀改變甚至致病。?

SNP研究包括SNP發現（discovery）、SNP驗證（validation）以及SNP篩選（Screening or Scoring）。廣泛用于群體遺傳學研究（如生物的起源、進化及遷移等方面，將逐漸取代微衛星而成為新一代的分子生物學標記）。和疾病相關基因的研究，在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。SNP的分布不均勻，非轉錄序列中要多于轉錄序列，絕大多數位于蛋白的非編碼區。雖然SNP不及RFLP和短串聯重復序列STR標記變異程度高，但由于數量巨大，分布頻密，因此就整體而言，其多態性要高得多。??

1.?直接測序法進行SNP分析
?在所有SNP的檢測方法中，對待檢測片段進行直接擴增、測序是最為準確的方法，也是SNP分析的金標準。通常情況下，純合型SNP位點的測序峰為單一峰型，而雜合型SNP位點的測序峰為套峰，因而很容易將其區分開來。通過直接測序方法進行SNP檢測的檢出率接近100%。
1）操作流程:

• 樣品基因組DNA提取
• 根據不同的區域進行引物設計、合成
• 對所有樣品進行基因擴增并純化
• 測序
• 統計與分析

2）樣品要求：
血液樣品：樣品為EDTA抗凝或枸椽酸鈉抗凝，樣品量大于1ml，樣品采集后于-20℃或-80℃保存；
組織樣品：樣品可以為新鮮組織（最好-80℃保存）、石蠟包埋組織或95%乙醇中固定的組織，組織量大于50μg 細胞、菌液等。
3）提供結果:
實驗流程、電泳圖、測序圖譜、SNP基因型統計結果等。

2.Taqman探針法（定量PCR）
客戶根據實驗要求挑選出SNPs后，提交給我們進行引物與探針設計與合成。上述工作完成后，客戶提供2ug的DNA樣品,經確認樣品質量合格我們即可進行實驗。
1）技術特點：
適合位點數量少，樣本通量高的檢測（每個位點需要合成兩條探針，探針合成費用高）；
應用ABI7900、ABI7500定量PCR儀進行定量檢測；
操作簡便，只需一步 PCR 反應，無須進行純化和預處理，直接上機檢測；
結果清晰，軟件分析結果界面友好，標出了每個樣本的基因型及熒光強度，非常直觀；
可采用ABI合成的探針或國產探針。
2）樣品要求：同測序法。
3）提供結果：實驗流程、電泳圖、定量PCR結果、統計分析結果等。