單細胞 TCR/BCR 測序
產品名稱： 單細胞 TCR/BCR 測序
英文名稱： Shbio
產品編號： 無
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品牌商標： null
更新時間： 2025-04-15T13:47:01
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免疫組庫（Immune Repertoire，IR）是指機體內 T 淋巴細胞和 B 淋巴細胞多樣性的總和，反映機體免疫系統在特定時間段內應對外界刺激應答的能力。基于 10X Genomics 的單細胞系統，可實現高通量的單細胞轉錄組和 V(D)J 測序。不但可以將 TCR/BCR 雙鏈匹配，而且能夠同時獲得基因表達信息。
10X Genomic 單細胞免疫組庫測序與單細胞 RNA 測序一樣，通過微流控系統將帶有條形碼和引物的凝膠珠與單個細胞包裹在油滴中；接下來在每個油滴內，凝膠珠溶解，細胞裂解釋放 mRNA，通過逆轉錄產生帶有 10X barcode 和 UMI 信息的 cDNA。破油（Breaking Emulsions）之后，cDNA 一分為二，后續同時進行基因表達和免疫組庫的文庫構建。其中 TCR 或者 BCR 的 V(D)J 序列通過設計在 C 區的巢式引物進行 PCR 富集；而 mRNA 的信息，與 10X Genomics 3’mRNA 文庫不同，保留的是 5’端的信息。測序后即可一次性獲得大量單細胞的基因表達和免疫組庫數據。
圖 5’mRNA 與 TCR/BCR 同時建庫
1、通量高：一張芯片具有 8 個獨立的通道，可供 8 個樣本同時上機，每個通道可捕獲 10000 個細胞。
2、分辨率高：可獲得真正單細胞水平的的免疫組庫信息，并且可匹配 TCR/BCR 的雙鏈。
3、信息豐富：可同時獲得單個細胞匹配的 mRNA 和 TCR/BCR 信息。
文庫結構
5’gene expression 文庫
圖 10X Genomics 5’gene expression 文庫示意圖
V(D)J 文庫
圖 10X Genomics V(D)J 文庫示意圖
建議測序深度及參數
| 指標 | 參數 |
| 測序深度 -5’mRNA | 50,000~100,000 reads/cell |
| 測序深度 -TCR/BCR | 5,000~10,000 reads/cell |
| 測序類型 | PE150 |
1、類型：新鮮組織，原代細胞，細胞系等。
2、來源：血液提取、磁珠富集、流式富集、組織解離等。
3、樣本量及其它質控要求：
| 樣本類型 | 要求 |
| 細胞懸液 | > 10* 目標細胞個數（底限 10,000 個細胞）； |
| 活率 >80%； | |
| 濃度 500-1,000 個細胞 /ul； | |
| 細胞間無粘連（成團率 <5%）； | |
| 無大于 40um 的細胞碎片或其他顆粒物； | |
| 不存在逆轉錄抑制劑和非細胞的核酸分子。 | |
| 血液 | EDTA 抗凝的全血（不可肝素抗凝），>5ml。 |
| 組織 | 0.3cm × 0.3cm（不超過 0.5 × 0.5cm）的新鮮組織，4~5 塊。 |
4、樣本的保存與運輸
| 樣本類型 | 要求 |
| 細胞懸液 | 建議現場制備，如要運輸，建議使用伯豪生物自主研發的單細胞保護液，4°C 運輸，48 小時內送達伯豪生物實驗室。 |
| 血液 | EDTA 抗凝的全血，4°C 運輸，2 小時內送達伯豪生物實驗室；或提取 PBMC 后凍存，干冰運輸。 |
| 組織 | 建議使用伯豪生物自主研發的單細胞組織保護液，4°C 運輸，48 小時內送達伯豪生物實驗室。 |
1、腫瘤微環境；
2、自身免疫性疾?。?/p>
3、感染性疾?。?/p>
4、器官、骨髓移植；
5、抗體開發。
伯豪生物客戶項目發文
| 序號 | 伯豪生物提供服務 | 文章名稱 | 雜志 | IF | 年份 | 研究方向 |
| 1 |
【服務】單細胞轉錄組測序/TCR免疫組庫 【樣本】血液 |
Unveiling the immunological landscape of disseminated tuberculosis: a single-cell transcriptome perspective | Frontiers in Immunology | 5.7 | 2025年 | 疾病機制 |
| 2 |
【服務】RNA-seq 【樣本】細胞 |
Combined targeting of GPX4 and BCR-ABL tyrosine kinase selectively compromises BCR-ABL+ leukemia stem cells | Molecular Cancer | 27.7 | 2024年 | 疾病機制 |
| 3 |
【服務】RNA-seq 【樣本】細胞 |
Mucosal-associated invariant T cells promote ductular reaction | EBioMedicine | 5.7 | 2024年 | 疾病機制 |
| 4 |
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