LncRNA芯片全面解決方案
產(chǎn)品名稱： LncRNA芯片全面解決方案
英文名稱： LncRNA Chip
產(chǎn)品編號： BT10003
產(chǎn)品價(jià)格： 5500-6500
產(chǎn)品產(chǎn)地： null
品牌商標(biāo)： null
更新時間： null
使用范圍： null
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在人的基因組中，只有2%堿基用于編碼蛋白，而有72%的堿基是可以轉(zhuǎn)錄的，因此ncRNA的存在有很大的空間。然而這些不編碼蛋白的RNA（ncRNA）有什么作用呢？近些年，研究者們主要將目光聚集在短的ncRNA（miRNA）上，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個miRNA，其主要功能是調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。但是我們不能忽視更長一些的也具有重要功能的long ncRNA。Long ncRNA (lncRNA) 是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt的RNA，它們本身并不編碼蛋白，而是以RNA的形式在多種層面上調(diào)控基因的表達(dá)水平，已知作用則包括基因沉默、基因印記和反義抑制。隨著近年來lncRNA不斷被發(fā)現(xiàn)，人們開始關(guān)注LncRNA在各種生物學(xué)過程以及疾病中所起到的作用。通過lncRNA芯片，研究人員能夠快速高通量的獲得與特定生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化。
一、技術(shù)路線和方法：
二、生物信息學(xué)分析
2.1 基本數(shù)據(jù)分析
Part01：原始數(shù)據(jù)預(yù)處理與均一化
Part02：差異lncRNA篩選
Part03：聚類分析（層次聚類）
Part04：差異lncRNA靶基因預(yù)測
Part05：靶基因GO分類
Part06：靶基因Pathway分析
2.2 高級數(shù)據(jù)分析
Part08：差異lncRNA轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析
Part09：差異lncRNA與靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
Part10：轉(zhuǎn)錄因子、lncRNA、靶基因互作網(wǎng)絡(luò)
Part11：目標(biāo)基因反向預(yù)測lncRNA
Part12：lncRNA引物設(shè)計(jì)
三、芯片平臺
| 芯片平臺 （Human） |
型號 | lncRNA\lincRNA數(shù)量 | 規(guī)格 | 貨號 |
| Agilent | SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K | 7419條lincRNA | 8×60K | BT1000311 |
| 27958條mRNA |
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| 芯片平臺 （Mouse） |
型號 | lncRNA\lincRNA 數(shù)量 |
規(guī)格 | 貨號 |
| Agilent | SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K | 16251條lincRNA | 8×60K | BT1000321 |
| 39430條mRNA |
五、完成時間
2個月，（其中生物信息分析1個月）
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