染色質免疫共沉淀技術（Chromatin?Immunoprecipitation，ChIP）也稱結合位點分析法，是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具，通常用于轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術，能夠高效地在全基因組范圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段。

ChIP-Seq的原理是：首先通過染色質免疫共沉淀技術（ChIP）特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，并對其進行純化與文庫構建；然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段信息。基于此，我們推出ChIP-Seq的完整解決方案，協助您一起探索生物奧秘。

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技術路線

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生物信息學服務

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樣品要求

1）DNA純度：OD?260/280值應在1.8～2.0?之間;?

2）DNA總量：每個樣品總量不少于30ng；

3）DNA的保存溶劑：H20或TE?(pH?8.0)中；

4）樣品運輸：冰袋運輸，且在運輸過程中請用parafilm將管口密封好，以防出現污染。

5）建議在條件允許情況下，提供可供兩次樣品制備的量，以確保實驗質量及延續性。

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應用領域

Ellen?Markljung?等利用?ChIP-Seq?技術,發現：家豬?IGF2?基因（編碼?Insulin-like?growth?factor?2?）第三內含子單堿基?G→A?的替換,導致抑制因子?ZBED6?在該基因上結合位點的喪失,從而使?IGF2?在骨骼肌中上調表達（表達量是正常情況的?3?倍）,這一突變主要影響肌肉生長（提高了骨骼肌的數量,因此豬肉產量提高了?3~4%?）、心臟增大和脂肪沉積。

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參考文獻

[1]Mitchell?JA,?Clay?I,?Umlauf?D,?et?al.?Nuclear?RNA?sequencing?of?the?mouse?erythroid?cell?transcriptome.?PLoS?One,?2012,?7:e49274.

[2]?Zong?W,?Zhong?X,?You?J,?Xiong?L,?et?al.Genome-wide?profiling?of?histone?H3K4-tri-methylation?and?gene?expression?in?rice?under?drought?stress.Plant?Mol?Biol,?2012,?[Epub?ahead?of?print]

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