Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pG-Tn5)(針對CUT&Tag技術定向開發的專用試劑盒)
產品名稱: Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pG-Tn5)(針對CUT&Tag技術定向開發的專用試劑盒)
英文名稱: Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pG-Tn5)
產品編號: TD901
產品價格: 0
產品產地: 南京
品牌商標: Vazyme
更新時間: 2023-09-20T18:40:31
使用范圍: null
- 聯系人 :
- 地址 : 南京市經濟技術開發區紅楓科技園C2棟
- 郵編 : 210000
- 所在區域 : 江蘇
- 電話 : 173****2095 點擊查看
- 傳真 : 點擊查看
- 郵箱 : wangminwen@vazyme.com

操作簡單:可一步實現DNA的片段化和接頭連接,僅需9 h即可實現從細胞到二代測序文庫的轉化
超高活性:兼具Protein G&Tn5活性,DN**段化活性極高
細胞起始量低:可兼容低至60個細胞,甚至單細胞
純度高:蛋白純度高、核酸殘留低

1. CUT&Tag技術原理及應用
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是替換傳統的ChIP-Seq用以研究蛋白質-基因組互作的新技術,與后者相比,它具有顯著優勢,如:信噪比高,可重復性好,實驗周期短(1天實現從細胞到文庫構建),細胞投入量低等,尤其適用于早期胚胎發育、干細胞、腫瘤以及表觀遺傳學等研究領域。

CUT&Tag技術的實驗流程簡單,主要包括:①收集細胞;②分別孵育一抗和二抗;③孵育pA/pG-Tn5轉座子(Hyperactive??pA/pG-Tn5 Transposon);④激活轉座子,進行DN**段化;⑤DNA提??;⑥文庫擴增與純化。
2. 轉座子切割活性高

如圖所示,對Vazyme #TD901中提供的pG-Tn5轉座子進行活性檢測,投入50 ng 人基因組DNA(gDNA),1 μl轉座子可快速(10 min)實現DN**段化,說明該融合酶切割DNA活性很高。
3. 細胞起始量低
A: CUT&Tag峰形圖
100 cells? ??
| 10,000 cells
|
如圖A所示:投入不同起始量的HEK293細胞(100或10,000個細胞),按照Vazyme #TD901說明書推薦的反應體系進行CUT&Tag實驗;其中,pG-Tn5轉座子使用的終濃度為0.04 μM,一抗為H3K27me3(CST,#9733),二抗為Goat anti Rabbit(Bioworld,#BS13271)。通過使用Agilent 2100 Bioanalyzer進行文庫分布檢測,結果顯示對于不同細胞投入量(100個或10,000個細胞),均可構建出與文獻中類似的呈現Ladder狀的文庫,說明該體系能夠兼容低細胞起始量的實驗。
B:Peak 富集

如圖B所示:將圖A中的CUT&Tag文庫進行二代測序分析,可以看出,100個細胞可以達到與10,000細胞類似的Peak富集,且信噪比顯著高于ChIP-Seq。
4. 實驗重復性好

如上圖所示,投入不同起始量(1,000、10,000或100,000)的HEK293細胞,每種起始量做2個重復,按照Vazyme #TD901說明書推薦的反應體系進行CUT&Tag實驗;其中,pG-Tn5轉座子使用的終濃度為0.04 μM,一抗為H3K27me3(CST,#9733),二抗為Goat anti Rabbit(Bioworld,#BS13271),陰性對照為與一抗同源的IgG(CST,#2729)。對上述文庫樣本進行二代測序,針對富集的reads進行pearson相關性分析,可以看出,平行樣本之間的重復性較好。

Hyperactive??In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina是針對CUT&Tag技術定向開發的專用試劑盒。CUT&Tag技術是一種研究蛋白質-DNA互作的新方法,通過將Protein G或Protein A與經過工程學改造的超高活性Tn5轉座酶融合,形成兼具雙重活性的新型融合酶(Hyperactive??pG-Tn5/pA-Tn5 Transposase),在抗體引導下精準靶向切割目的蛋白附近的DNA序列。與傳統的ChIP-Seq相比,該技術具有細胞投入量低、實驗周期短、信噪比高、可重復性好等優勢,尤其適用于早期胚胎發育、干細胞、腫瘤以及表觀遺傳學等研究領域。試劑盒中所有試劑都經過嚴格的質量控制和功能驗證,最大程度上保證了文庫構建的穩定性和重復性。



BOX 1:ConA beads 2 ~ 8℃保存,其余組分室溫儲存。
BOX 2:5% Digitonin -30 ~ -15℃保存,室溫下可保存1周;
10 × Binding Buffer -30 ~ -15℃保存,2 ~ 8℃下可保存6個月;
其余組分-30 ~ -15℃儲存。


