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晶能生物技術(上海)有限公司
Illumina全基因組表達譜芯片

Illumina全基因組表達譜芯片

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產品名稱: Illumina全基因組表達譜芯片

英文名稱: Illumina whole genome microarray

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概述

?Illumina針對人、小鼠的完整RNA樣本開發了全基因組表達譜芯片產品(采用直接雜交的方法), Illumina全基因組表達譜微珠芯片使得在更高通量水平上的生物學研究成為可能,可以廣泛地應用于高置信度靶位點發掘,疾病分子分型和分子通路分析等研究領域上。研究人員現在可以在一張芯片上獲取多個樣本的全基因組表達譜。

芯片品牌美國Illumina

芯片名稱HumanHT-12 v4 Expression BeadChip

芯片信息每張芯片可平行檢測12個樣本,含有共約48,000個基因轉錄本,信息來源除36,000NCBI RefSeq外,還包含了從UniGene12,000個轉錄本信息。

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芯片名稱Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip

芯片信息針對降解RNA,采用獨特的探針設計技術,從石蠟包埋組織、福爾馬林保存樣本中獲得部分降解的RNA進行全基因組水平基因表達研究。每張可平行檢測12個樣本,包含47231個基因轉錄本。

芯片名稱MouseWG-6 v2 Expression BeadChip

芯片信息每張芯片可平行檢測 6 個樣本,包含有約 45,281 個來自 MEMBO-RefSeq 及其補充序列,RIKEN補充序列的轉錄本信息。

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技術路線

l? 晶能另為客戶提供的表達譜芯片有:

Affymetrix 表達譜芯片服務

Agilent 表達譜芯片服務

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生物信息學分析模塊

樣品要求

1) 樣品類型:細胞、新鮮組織或總RNA樣品。

2) 樣品量:細胞樣品請提供至少5×106個細胞,組織樣品請提供至少100mg的組織塊或切片???/span>RNA樣品請提供總量2μg以上。

3) 樣品質量:RNA無明顯降解,OD260/280值在1.92.1之間,濃度≥ 100ng/μl;DNA應該去除干凈。

4) 細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOLRNA保護劑處理或液氮凍存后,-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融。

5) 樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。

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參考文獻

[1] Julie B. Sneddon, Malgorzata Borowiak & Douglas A. Melton.Self-renewal of embryonic-stem-cell-derived progenitors by organ-matched mesenchyme.Nature. 2012 Nov 29;491(7426):765-8. doi: 10.1038/nature11463. Epub 2012 Oct 7.

[2]Gillich A, Bao S, Grabole N, Hayashi K, Trotter MW, Pasque V, Magnúsdóttir E, Surani MA. Epiblast stem cell-based system reveals reprogramming synergy of germline factors.Cell Stem Cell. 2012 April 6; 10(4): 425–439.doi:? 10.1016/j.stem.2012.01.020

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