VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2(適配華大平臺,降低“假陽性”,提高突變檢出精確率)-文庫及構建-試劑-生物在線
南京諾唯贊生物科技股份有限公司
VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2(適配華大平臺,降低“假陽性”,提高突變檢出精確率)

VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2(適配華大平臺,降低“假陽性”,提高突變檢出精確率)

商家詢價

產品名稱: VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2(適配華大平臺,降低“假陽性”,提高突變檢出精確率)

英文名稱: VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2

產品編號: NDM627

產品價格: 0

產品產地: 南京

品牌商標: 諾唯贊(Vazyme)

更新時間: null

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VAHTS??Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2

適配華大平臺,降低“假陽性”,提高突變檢出精確率

降低“假陽性” :?SNV和InDel檢出的假陽性大大降低,提高突變檢出的精確率。

VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2是針對MGI高通量測序平臺定向開發的片段化酶法DNA文庫構建試劑盒。本試劑盒針對原有版本進行了優化升級,在保持原有高性能的基礎上顯著降低了FFPE樣本DNA文庫中的Artificial Invert Chimera Reads比例,提高了SNV等檢出的可靠性。本試劑盒將DN**段化、末端修復以及末端加dA尾合并為一步,產物無需純化,直接進行接頭連接、文庫富集和分選,可將100 pg - 1 μg模板DNA轉換成MGI高通量測序平臺專用文庫。本試劑盒可完美兼容不同來源和不同投入量的DNA,僅需根據目標插入片段大小調整片段化時間,即可得到所需片段大小文庫。試劑盒中提供的所有試劑都經過了嚴格的質量控制和功能驗證,最大程度上保證了文庫構建的穩定性和重復性。

1. 文庫產量高

以鮭魚基因組DNA為起始模板進行文庫構建,投入量分別為100 pg、1 ng、100 ng、1 μg。Vazyme #NDM627與其他公司同類產品相比,文庫產量基本一致

圖1. 100 pg-1 μg投入量下文庫產量

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2. 下機數據質量好

以NA12878、FFPE樣本為模板,使用外顯子捕獲panel(34 Mb)進行捕獲,下機基本數據表現良好。

圖2. 下機數據

使用外顯子捕獲panel構建的文庫下機數據截取64.8M?clean reads進行后續生信分析。Vazyme #NDM627在下機基本數據方面與其他公司產品無顯著差異,Dup Rate低于其他公司產品。

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3. 假陽性檢出率低

圖3. Soft?Clip和Invert?Chimera檢出

Vazyme #NDM627在Soft Clip和Invert Chimera檢出方面,優于部分公司同類產品,與Vazyme #NDM607基本一致。

圖4. Variant檢出

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Vazyme #NDM627使用外顯子捕獲panel檢出的經VEP Filter過濾后、確定為假陽的Variant數目與其他公司同類產品一致。

圖5. SNP和InDel檢出

以NA12878為模板,綜合SNP和InDel檢出的靈敏度(Sensitivity)和精確率(Precision)進行F-Measure打分,Vazyme #NDM627在SNP和InDel檢出方面與其他公司同類產品一致。

-30 ~ -15℃保存, ≤0℃運輸。