HCS高內涵篩選(功能基因組學)
產品名稱: HCS高內涵篩選(功能基因組學)
英文名稱: HCS High-content Screening (Functional Genomics)
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? ? ? HCS(High content Screening)高內涵篩選針對基因的功能研究,通常會遇到兩種情況的問題: 一種情況是一個基因一個基因的進行,效率低,往往要做好幾個基因才能找到功能明顯和確定的基因。 另一種情況是做完高通量組學比如表達譜芯片、RNA-seq、全基因組測序、全外顯子測序、蛋白質組學等,有成百上千個候選基因、蛋白、突變位點等,不知道該挑選什么基因進行下面的研究。 HCS就是為了解決基因功能研究中這兩種最常見的困難而誕生的。 HCS(High content Screening)高內涵篩選,指一次性對至少20個甚至更多的編碼基因或非編碼RNA進行基因干擾、敲除或者過表達等基因操作;還可以一次性對大量的突變位點/SNP位點進行過表達,然后在細胞層面進行功能表型檢測,篩選有明顯功能的基因或者突變位點??梢源蠓瓤s短尋找新功能基因的科研時間,提高科研效率和節約科研成本。 技術優勢1. 全球領先的基因操作慢病毒文庫資源
cDNA--SETTM全長基因克隆文庫 覆蓋超過20000個人類基因的ORF克隆各種細胞模型(300多株) 種類齊全的病毒工具(慢病毒、腺病毒、AAV) 2. 超過10年的應用經驗,實驗人員技術熟練、經驗豐富 3. 多種高內涵篩選儀器平臺 ThermoFisher Cellomics、Brooks Automation Celigo、YOKOGAWA CQ1 4. 高檢出率 HCS的多種應用案例增殖功能基因篩選 調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后,通過高內涵儀器連續多天快速掃板,拍攝調控不同基因以后細胞的增殖情況,通過增殖曲線可以準備的判斷哪些基因knock-down或overexpression以后能夠導致細胞增殖能力的變化,篩選增殖相關的功能基因。 轉移相關功能基因篩選(劃痕法) 調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后,劃痕處理,通過高內涵儀器快速掃板,拍攝多個時間點劃痕愈合情況,觀察哪些基因上調或者下調以后能夠影響細胞的遷移功能,篩選轉移相關的功能基因。 ![]() 轉移相關功能基因篩選(transwell法) 調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后,根據感染后的細胞在一定時間內穿過transwell小室的細胞量,對細胞一定時間內的遷移率進行統計,通過shCtrl與各實驗組遷移率比較后進行統計,篩選轉移相關功能基因。 明星基因功能回復panel 尋找目的基因或者是處理因素(如:藥物)相關的功能回復基因(目的基因或者是處理因素必須是抑制細胞增殖或者轉移的)。 在目的細胞中用shRNA包裝成慢病毒干擾目的基因,然后在目的基因干擾的情況下,感染下游明星通路基因的調控慢病毒,檢測細胞的增殖或者轉移情況,尋找跟目的基因有功能回復關系的明星通路基因。 藥靶基因篩選 調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后,通過高內涵儀器連續多天快速掃板,拍攝調控不同基因以后細胞對藥物的敏感情況,通過計算不同基因操作以后,藥物對細胞的抑制率,初步篩選和藥物相關的目標基因。 血管新生功能基因篩選 調控不同基因的慢病毒感染腫瘤細胞一定時間后,將細胞上清轉移至人臍靜脈內皮細胞系培養孔中,通過HCS快速掃板,拍攝人臍靜脈內皮細胞的成管情況,可以快速的檢測上調,下調或者敲除不同基因的情況下,血管新生能力的變化,從而篩選到血管新生功能相關的功能基因。 ![]() 參考文獻1.Microscopy-Based High-Content Screening . Cell163, December 3, 2015. 2.A Lentiviral RNAi Library for Human and Mouse Genes Applied to an Arrayed Viral High-Content Screen . Cell124, 1283–1298, March 24, 2006. 3.Integration of high-content screening and untargeted metabolomics for comprehensive functional annotation of natural product libraries ;PNAS,September 29, 2015; VOL112; No. 39,11999–12004. 4.Genome-Scale CRISPR-Cas9 Knockout Screening in Human Cells.Science,3 January 2014; VOL 343. 5.Genome-scale transcriptional activation by an engineered CRISPR-Cas9 complex. Nature 29 January 2015; VOL 517. 6.Systematic Functional Annotation of Somatic Mutations in Cancer .Cancer Cell33, 450–462, March 12, 2018.Functional annotation of rare gene aberration drivers of pancreatic cancer. Nature communications; 7:10500; DOI: 10.1038; ncomms10500. 7.An RNAi screen of Rho signalling networks identifies RhoH as a regulator of Rac1 in prostate cancer cell migration. BMC Biology (2018) 16:29. 8.Functional screening identifies miRNAs inducing cardiac regeneration. Nature; VOL 492; 20/27 december 2012. 9.High-content screening identifies kinase inhibitors that overcome venetoclax resistance in activated CLL cells. Blood, 18 August 2016; Volume 128, Number 7. 上海吉凱基因醫學科技股份有限公司 |










