單核苷酸多態性分析(SNP)檢測服務-分子生物學服務 -技術服務-生物在線
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單核苷酸多態性分析(SNP)檢測服務

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產品名稱: 單核苷酸多態性分析(SNP)檢測服務

英文名稱: SNP

產品編號: 005

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基因單核苷酸多態性(SNP)突變檢測服務?
一、 定義:?
?????? 1)一種遺傳標記,包括單個堿基的缺失和插入,更多情況是單個堿基的置換。
?????? 2)通常情況下是一種二等位基因的變異,多為轉換,即一種嘧啶堿基換為另一種嘧啶堿基,或一種 嘌呤堿基換為另一種嘌呤堿基,轉換與顛換之比為2:1。?
?????? 3)SNP在CG序列上出現最為頻繁,而且多是C→T,因為CG中C即胞嘧啶常為甲基化的,自發脫氨 后即變為胸腺嘧啶。?
?????? 4)人類基因組SNP位點的數量:目前的估計不完全相同,有人估計每400bp就有一個堿基不同;另一些人則估計變異頻率在0.5‰--10‰。如果假定1/1000的堿基是多態,那么人類30億堿基中就 有300萬SNP位點。?
?????? 5)SNP的分布不均勻,非轉錄序列中要多于轉錄序列,絕大多數位于蛋白的非編碼區。?
?????? 6)重要性:雖然SNP 不及RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)和短串聯重復序列 STR標記變異程度高,但由于數量巨大,分布頻密,因此就整體而言,其多態性要高得多。?
?????? 7)檢測方便:大多為二態,便于自動化批量檢測。?
二、 方法 DNA序列分析(DNA sequencing) 應用各種突變檢測技術檢測到的基因突變,最后都需用序列分析才能確定突變類型及突變位置,其效率可以達到100%
主要有兩種方法:
????? ?1,測序法:現在的測序方法已與經典的方法有了很大的不同,其基本原理雖仍是雙脫氧終止法,但自動化程度大為提高,操作更簡便,測序時間也大大縮短。隨著PCR技術與測序聯合使用,不需經過M13亞克隆步驟,故稱為直接測序法(direct sequencing,DS)。
????? ?2,探針法:實驗原理:探針只與模板特異性地結合,其結合位點在兩條引物之間。探針的5′端標記有報告基團(Reporter, R),如FAM、VIC等,3′端標記有熒光淬滅基團(Quencher, Q),如TAMRA等。當探針完整的時候,報告基團所發射的熒光能量被淬滅基團吸收,儀器檢測不到信號。隨著PCR的進行,Taq酶在鏈延伸過程中遇到與模板結合的探針,其5′→3′外切核酸酶活性就會將探針切斷,報告基團遠離淬滅基團,其能量不能被吸收,即產生熒光信號。在探針的5’端使用不同的Report熒光基團,單一PCR中可以檢測到多個探針的雜交與相應熒光。只有與模板完全匹配的TaqMan探針在與等位基因發生特異性雜交后,利用Taq酶的5’外切酶活性作用使得探針的5’Report熒光能夠被檢測。?
實驗步驟如下:?
(1)客戶收集標本(血液或組織等標本);?
(2)確定基因突變SNP位點, 設計合成特異PCR擴增普通引物及探針,并在NCBI網站做BLAST;?
(3)進行PCR擴增,通過SNP分型獲得實驗報告;?
(4)分析報告,給出實驗結果;?

本公司提供探針法SNP技術服務

1)snp原理

2)SNP散點圖

3)純合子擴增曲線

4)雜合子擴增曲線