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上海卓立生物科技有限公司
lnc RNA測序服務

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產品名稱: lnc RNA測序服務

英文名稱: lnc RNA sequencing

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?長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是指長度在200~100000 nt之間不具有蛋白編碼功能的RNA分子。它們存在帶polyA尾和不帶polyA尾兩種形式,具有跨物種的低保守性,組織特異性表達和豐度低等特點。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,保守估計哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生lncRNA轉錄本,而相應的蛋白編碼RNA的比例僅是1%~5%。目前研究提示lncRNA的功能機制主要包括參與轉錄調控、轉錄后調控、蛋白質運輸和mRNA降解。lncRNA已經成為非編碼RNA研究領域的一個熱點,借助高通量測序,研究人員能夠快速獲得與疾病或者特定生物學過程相關的lncRNA并進行深入研究。

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生物信息學分析
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測序數據質量評估(QC);
參考基因組比對分析
轉錄本組裝和新轉錄本預測
新長鏈非編碼RNA預測
已知轉錄本和新長鏈非編碼轉錄本差異分析
長鏈非編碼RNA靶基因預測
差異基因功能分析(GO注釋、KEGG注釋)
聚類分析
進階分析等
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樣品要求
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樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。
樣品的量:細胞樣品請提供至少1×107個細胞,組織樣品請提供至少300mg的組織塊或切片,RNA樣品請提供2 μg以上的總RNA。
樣品質量:RNA無明顯降解,提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間,濃度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。
樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復凍融。
樣品運輸:樣品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。