lnc RNA測(cè)序服務(wù)
產(chǎn)品名稱： lnc RNA測(cè)序服務(wù)
英文名稱： lnc RNA sequencing
產(chǎn)品編號(hào)：
產(chǎn)品價(jià)格： 詢價(jià)
產(chǎn)品產(chǎn)地： null
品牌商標(biāo)： null
更新時(shí)間： null
使用范圍： null
- 聯(lián)系人 :
- 地址 : 新駿環(huán)路188號(hào)
- 郵編 : 200230
- 所在區(qū)域 : 上海
- 電話 : 189****3602 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : 2913230655@qq.com
?長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是指長(zhǎng)度在200~100000 nt之間不具有蛋白編碼功能的RNA分子。它們存在帶polyA尾和不帶polyA尾兩種形式，具有跨物種的低保守性，組織特異性表達(dá)和豐度低等特點(diǎn)。lncRNA的種類遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)編碼RNA，保守估計(jì)哺乳動(dòng)物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生lncRNA轉(zhuǎn)錄本，而相應(yīng)的蛋白編碼RNA的比例僅是1%~5%。目前研究提示lncRNA的功能機(jī)制主要包括參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控、蛋白質(zhì)運(yùn)輸和mRNA降解。lncRNA已經(jīng)成為非編碼RNA研究領(lǐng)域的一個(gè)熱點(diǎn)，借助高通量測(cè)序，研究人員能夠快速獲得與疾病或者特定生物學(xué)過(guò)程相關(guān)的lncRNA并進(jìn)行深入研究。
?
生物信息學(xué)分析
?
測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估（QC）；
參考基因組比對(duì)分析
轉(zhuǎn)錄本組裝和新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)
新長(zhǎng)鏈非編碼RNA預(yù)測(cè)
已知轉(zhuǎn)錄本和新長(zhǎng)鏈非編碼轉(zhuǎn)錄本差異分析
長(zhǎng)鏈非編碼RNA靶基因預(yù)測(cè)
差異基因功能分析（GO注釋、KEGG注釋）
聚類分析
進(jìn)階分析等
?
樣品要求
?
樣品類型：細(xì)胞、新鮮組織或RNA樣品。
樣品的量：細(xì)胞樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?×107個(gè)細(xì)胞，組織樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片，RNA樣品請(qǐng)?zhí)峁? μg以上的總RNA。
樣品質(zhì)量：RNA無(wú)明顯降解，提取的總RNA OD260/280值在1.8~2.2之間，濃度 ≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7。
樣品保存：細(xì)胞樣品或新鮮組織塊（切成~50mg的小塊）可用TRIZOL或RNA保護(hù)劑處理或液氮凍存后，-80℃保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
樣品運(yùn)輸：樣品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰運(yùn)輸。