SWATH（Sequential Window?Acquisition of all THeoretical Mass Spectra）是瑞士蘇黎世聯邦理工學院的 Ruedi? Aebersold 博士及其團隊與AB-SCIEX聯合推出的一項全新的質譜技術。與傳統的shot-gun技術相比，SWATH采集模式能夠將掃描區間內所有的肽段母離子經過超高速掃描并進行二級碎裂，從而獲得完整的肽段信息。因此，SWATH技術是一種真正全景式的、高通量的質譜技術，同時也解決了shot-gun鑒定較低重復度的缺點。

借助我公司現有的Triple-TOF 5600質譜系統，SWATH在定量上具有較高的準確度和動態范圍，可檢測到蛋白質的豐度差異極大，跨越4個數量級。且SWATH方法的靈敏度和動態范圍與 SRM 分析水平相當。

??????? 圖：SWATH技術示意

我公司蛋白質組學平臺技術團隊對SWATH技術經過長時間的研究及技術開發，成為國內第一家提供SWATH技術服務的公司，現可提供SWATH定量蛋白質復合體和SWATH定量蛋白質組的技術服務。

?

SWATH定量蛋白質復合體

SWATH定量方法確定蛋白質復合體的成分是SWATH定量方法最常用的應用之一，該方法已經非常成熟，實驗流程如下：

?

圖：SWATH定量方法用于判斷蛋白質復合體成分的流程圖。

?

SWATH定量蛋白質組

發現差異蛋白質SWATH定量方法基于提取Transition峰面積計算出肽段含量，通過肽段含量推理出蛋白質含量的方法。SWATH定量應用到proteome-wide水平就產生了SWATH定量蛋白質組，以此方法為基礎可以迅速鎖定幾個樣品間的差異蛋白質(類似iTRAQ定量蛋白質組)。我公司開發了一項新的技術，采用SWATH定量也可以做到6000個以上的蛋白質的SWATH定量(以人HepG2為例)。

武漢華美采用Tryspin酶解為主的方法獲得肽段，肽段除鹽后通過LC-MS/MS(5600-plus)進行鑒定和SWATH定量。我們通過嚴格的質控來確保客戶的樣品得到最高通量的鑒定和SWATH定量，同時可以依據客戶的需求做出實驗方案的調整。

?

我公司的技術特點

l? 國內第一家提供SWATH定量蛋白質組的公司；

l? 高精度定量：和MRM定量結果保持高度一致(MRM是定量領域的金標準)；

?

信息分析內容

l? 根據參考譜圖庫解析SWATH譜圖，鑒定肽段、蛋白，結果可靠性評估；

l? 根據碎片離子的XICs進行相對定量，差異表達分析；

l? 對鑒定到蛋白GO功能注釋、Pathway代謝通路注釋；

l? 差異表達蛋白GO、Pathway功能富集分析；

l? 主成分（PCA）分析，發現差異蛋白質或者復合體成員。

?

?

?