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EP1?高通量基因分析系統是集成流體通路（Integrated Fluidic Circuit，IFC）技術、終點PCR技術及強大的基因分析軟件相結合的技術平臺。其創新技術就在于集成液體通路技術：利用集成電路制作工藝（光刻）在硅片或石英玻璃上刻上許多微管和微腔體，通過不同的控制閥門控制溶液在其中的流動來實現生物樣品的分液、混合、PCR擴增。集成流體通路技術極大地簡化了生物樣品和試劑的分液操作，提高分析通量和靈敏度，其納升級的反應體系為高通量的基因分析應用節省大量成本（試劑用量更少，樣品量更少）。 |
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EP1?高通量基因分析系統由EP1? Reader，PCR儀、IFC微液流芯片（耗材）、IFC Controller（將生物樣品、反應試劑導入到IFC微液流芯片中）和基因分析軟件四部分構成。IFC微液流芯片有2種：Dynamic Array（48.48動態芯片和96.96動態芯片）和Digital Array（12.765數碼芯片和48.770數碼芯片），應用于不同的基因分析中：拷貝數變化分析、遺傳突變檢測、基因分型等。
從下面的具體應用及跟傳統基因分析方法的比較上，我們可以很直觀地看到EP1?高通量基因分析系統在通量、靈敏度、靈活度上的革命性的突破。 1.EP1? Digital Array數碼芯片 :
樣本與試劑只需納升級 (nl)
比傳統方法少1,000倍, 大幅減少試劑用量
通過IFC部件, 樣本濃縮1000倍, 敏感度大大提高，檢測更準確，能檢測到單拷貝, 高重復性
使用傳統試劑, 操作簡單快捷, 省去再開發時間
應用廣泛, 如樣本定量 (Slingshot), CNV, Haplotype, 遺傳病/突變檢測等
（1）Slingshot系統 : 第二代測序儀樣本濃度確定
——無需參照樣本, 絕對定量, 高效替Roche GS 454、ABI SOLiD和Illumina Solexa等第二代測序平臺上機前作樣品濃度準確定量，可大大減少試劑用量！ |
 | （2）拷貝數變化 / 遺傳病 / 突變檢測
| 拷貝數變化（Copy Number Variation, CNV）廣泛用于藥物代謝、癌癥、免疫相關疾病、人類基因組變異以及由基因變異引起的相關疾病的研究。 EP1TM Digital Array
采用 12x765陣列PCR反應芯片，通過數字PCR，每個反應體系用量僅6 nL, 可有效分辨12與13倍（或更高）的差異。
采用常規PCR 方法和試劑, 無需改變工作流程, 結果一目了然, 方便比較
最多能兼容4種熒光染料， 進行多通道PCR ? 而傳統分析方法 ： SNP微陣列分析或比較性基因組雜交(CGH)
敏感性和分辨率較低，缺乏客觀標準，不能準確量化結果
操作煩瑣, 需要大量本試劑， 假陽性非常高 常規qPCR技術:
最多只能分辨2與3倍的DNA拷貝數差異， 試劑價錢昂貴。 |
| 2.Dynamic Array 動態芯片：
高通量，最高每次可處理9216個qPCR反應（96樣本× 96基因）
采用常規試劑方法, 用量為傳統1% （反應為nl級）
無需繁瑣加樣, IFC全自動進樣混合,減少人為誤差
利用IFC技術自動操作，重復性好
樣品、反應液組合自由多樣，應用廣泛，用戶彈性大 ? 基因分型
| ——通過簡單加樣，EP1? 基因分析系統能在短時間內分析成千上萬個基因 （96×96 / 48×48）：
更少試劑用量、更低成本
所以常規方法但更高通量
更高檢出率（Call Rate），>99.5%
更快更高效，可日處理7萬個基因型 |
| 對2000個樣品進行基因分型時，使用384微孔板與48.48 Dynamic Array的對比結果：
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384微孔板 |
48.48動態陣列 |
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總運行次數 |
250 |
42 |
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同時運行反應數 |
384 |
2,304 |
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總移液次數 |
192,000 |
4,032 |
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總反應體積 |
480 ml |
5.1 ml |
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綜合評定EP1?高通量基因分析系統，
·??IFC整合系統，簡化傳統PCR操作步驟，使操作流程簡化至1/48（48.48動態芯片）或1/96（96.96動態芯片）。
·??基因分型結果與ABI 7900 熒光定量數據具有很好的一致性。
·??重復性好，批內批間相關系數極高，p=00.0000。
·??高通量，Dynamic Array最多可實現9216個樣本的同時檢測，Digital Array一張芯片上最多可同時進行10,000(12.765數碼芯片)或37,000（48.770數碼芯片）個反應。
·??nl級反應體系，比傳統試劑耗費減少100倍，成本消耗節省一倍以上。
·??人性化數據分析軟件，使您更加靈活的得到可靠數據。
在實際的科研應用中，越來越多的報導顯示了EP1?基因分析系統正迅速地被科研工作者應用到實際研究中：
而大量高影響因子文章的陸續發表，更印證著Bio-Mark?基因分析系統在基因分析領域開創性的貢獻， http://www.fluidigm.com/technology/publications.html。相信隨著Bio-Mark?基因分析系統的推廣和深入應用，更多的驚喜將呈現給科研工作者。
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