譜度眾合 | LiP-MS藥物-蛋白結(jié)合域分析
產(chǎn)品名稱： 譜度眾合 | LiP-MS藥物-蛋白結(jié)合域分析
英文名稱： Spec-Ally | LiP-MS Drug-Protein Binding Domain Analysis
產(chǎn)品編號(hào)： 5
產(chǎn)品價(jià)格： null
產(chǎn)品產(chǎn)地： 湖北武漢
品牌商標(biāo)： null
更新時(shí)間： 2025-11-26T15:49:29
使用范圍： null
| 規(guī)格 | 價(jià)格 |
| 樣 | 1800.0 |
- 聯(lián)系人 : 劉宜子
- 地址 : 武漢市東湖新技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)(九峰創(chuàng)新)基地B5棟B024室
- 郵編 :
- 所在區(qū)域 : 湖北省
- 電話 : 187****3965 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : proteome@spec-ally.com
有限蛋白水解質(zhì)譜技術(shù)（Limited Proteolysis Mass Spectrometry，LiP-MS）是研究小分子化合物（天然產(chǎn)物、代謝物等）與蛋白質(zhì)相互作用，揭示蛋白結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)變化的高通量質(zhì)譜篩選技術(shù)。本公司推出LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選解決方案，包含三種研究目的場(chǎng)景：
- LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選：體外生理?xiàng)l件下尋找小分子藥物的潛在作用靶點(diǎn)；
- LiP-MS藥物-蛋白結(jié)合域分析：體外生理?xiàng)l件下研究純化重組蛋白與目標(biāo)藥物的作用域與結(jié)合位點(diǎn)。
- LiP-MS藥物機(jī)制研究：體內(nèi)給藥條件下研究小分子藥物的潛在作用靶點(diǎn)及其藥物作用機(jī)制。
技術(shù)原理
有限水解（LiP）的概念是指在生理狀態(tài)下蛋白酶對(duì)蛋白的不完全酶切。研究表明，生理狀態(tài)下折疊的蛋白具有較強(qiáng)的抗酶切能力，所以實(shí)驗(yàn)中想要實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白的完全酶切需要先對(duì)蛋白進(jìn)行變性處理（去折疊）（圖1）。而在生理狀態(tài)下，折疊蛋白的不完全酶切也需要蛋白酶識(shí)別位點(diǎn)的暴露，通常涉及到多達(dá)12以上氨基酸殘基肽段的構(gòu)象變化(局部展開(kāi))，這依賴于蛋白的動(dòng)態(tài)變化，蛋白表面肽段的柔性變化可能會(huì)形成這種能被蛋白酶識(shí)別切割的位點(diǎn)。
圖 1 蛋白有限水解示意圖
LiP-MS利用有限水解的原理來(lái)識(shí)別小分子藥物作用的蛋白靶點(diǎn)。具體來(lái)講，生理狀態(tài)下蛋白的動(dòng)態(tài)變化會(huì)暴露出表面肽段的酶切位點(diǎn)，但是小分子藥物與靶蛋白結(jié)合后，會(huì)在整體或者局部水平穩(wěn)定蛋白的結(jié)構(gòu)，這使得蛋白表面的肽段暴露和被蛋白酶酶切的可能性大大降低（圖2）。
在這個(gè)理論背景下，設(shè)置藥物處理組與溶劑處理的對(duì)照組，同時(shí)以非特異性的蛋白酶進(jìn)行處理，會(huì)在藥物結(jié)合的靶蛋白上形成酶切位點(diǎn)（肽段）的差異，最后通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)來(lái)定量篩選出組間差異的肽段（蛋白），最終可以確認(rèn)為藥物作用的結(jié)合靶點(diǎn)（圖3）。
圖 2 小分子配體（藥物）穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)
圖 3 LiP-MS流程圖
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
- 簡(jiǎn)單便捷：無(wú)需設(shè)計(jì)合成分子探針；提供野生型細(xì)胞/組織和藥物分子就可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn)；
- 真實(shí)直接：使用藥物分子在體外直接進(jìn)行結(jié)合實(shí)驗(yàn)，得到直接結(jié)合靶點(diǎn)及其結(jié)合位點(diǎn)；
- 數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)：利用質(zhì)譜技術(shù)的高通量性能，無(wú)偏見(jiàn)的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)篩選保障獲得真實(shí)的陽(yáng)性結(jié)果，實(shí)現(xiàn)治療靶點(diǎn)與脫靶靶點(diǎn)的全覆蓋；
- 直接結(jié)論：通過(guò)比較篩選、生信分析和數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘，報(bào)告直接給出推薦的靶點(diǎn)列表清單；
- 驗(yàn)證數(shù)據(jù)：對(duì)潛在靶蛋白與藥物分子進(jìn)行分子對(duì)接，在計(jì)算機(jī)模擬層面給藥物靶點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證；
LiP-MS藥物-蛋白結(jié)合域分析
該產(chǎn)品應(yīng)用于一個(gè)特殊的藥物靶點(diǎn)研究場(chǎng)景：已經(jīng)明確了藥物作用的靶蛋白，但是不清楚藥物作用在蛋白上的哪個(gè)位置（區(qū)域），可以通過(guò)對(duì)重組蛋白的LiP-MS實(shí)驗(yàn)來(lái)實(shí)現(xiàn)研究目的。客戶提供純化重組蛋白及藥物，譜度眾合實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行體外的重組蛋白和藥物分子結(jié)合實(shí)驗(yàn)，隨后進(jìn)行有限水解實(shí)驗(yàn)，通過(guò)高分辨質(zhì)譜來(lái)分析藥物作用所產(chǎn)生的差異肽段，結(jié)合分子對(duì)接可以獲得明確的藥物-蛋白結(jié)合區(qū)域信息。
送樣要求：
1. 至少6個(gè)給藥前樣本（藥物處理組3個(gè)，溶劑對(duì)照組3個(gè)；如需增加不同濃度或者不同藥物處理組，每組增加3個(gè)樣本）；
2. 單個(gè)樣本起始重組蛋白量建議>5μg（總量大于30μg，濃度不低于0.05μg/μL）；
3. 重組蛋白溶液中不含有任何去垢劑/變性劑成分。