代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新發展起來的一門學科，它通過對機體內小分子代謝物（50~1,500 Da）進行精準定性定量，分析代謝物與機體生理、病理變化的關系，從而研究植物抗逆、工業微生物提產、疾病發生發展、尋找疾病生物標記物等內容。

專業服務類型包括：

2 GC-MS 平臺提供對代謝物的無目標性廣篩，并使用業界公認的GMD 代謝組數據庫實現對代謝物的相對定性定量分析

2 LC-MS 平臺提供對代謝物的無目標性廣篩，使用Metlin 數據庫完成對代謝物的相對定性定量分析

2 NMR 平臺提供對340 余種水溶性初生代謝物小分子的絕對定性定量檢測分析

2 GC-FID 平臺提供對37 種脂肪酸的絕對定性定量檢測分析

2 LC-MS 平臺提供對甘油三酯的絕對定性定量分析

2 Shotgun MS 平臺提供對甘油磷脂的絕對定性定量檢測分析

2 LC-MS 平臺提供對10 種植物激素的絕對定性定量分析

文獻解讀

血漿蛋白質組和代謝組研究人類甲狀腺功能亢進模型

Plasma proteome and metabolome characterization of an experimental human thyrotoxicosis model

研究單位:格賴夫斯瓦爾德大學
發表時間:2017年1月
發表雜志:BMC Medicine
影響因子:8.097

一、研究背景

? ? ? ?目前臨床將檢測促甲狀腺激素(TSH)和游離甲狀腺素(FT4)的含量作為診斷與隨訪甲亢的“金標準”。但由于干擾TSH和FT4含量的因素眾多,經常出現檢測結果與臨床癥狀不一樣的情況。臨床迫切需要找尋能夠表征甲亢的新的生物標志物。

二、研究策略

三、研究結果

1.代謝組、蛋白組數據統計

后續針對樣本進行代謝組與蛋白質組檢測,共鑒定到380種代謝物與497種人類蛋白質。

2.差異代謝物功能富集分析及機理研究

349種代謝產物中65種(19%)顯著差異,其 中45種表達量上調,20種表達量下調。大部分 差異代謝物為脂質代謝物和相關化合物(見圖1)。?
3.Biomarker篩選

為了尋找新的biomarker來分類TH狀態,研究者通過兩階段交叉驗證程序建立了一個隨機森林分類器,綜合分析代謝組和蛋白質組發現的差異代謝物和差異蛋白。 最終,獲得包含代謝物和蛋白質在內的15個物質(圖 2,左圖)。30次驗證(均值AUC = 0.86;圖2,右圖) 結果顯示出穩定、良好的分類能力,可以作為潛在的 Biomarker。

圖1?差異代謝產物功能富集分析

圖2?Biomarker篩選

研究亮點

? ? ? ?實驗設計為本文最大的亮點。甲亢與多種并發癥相關,通過對健康志愿者注射藥物構建甲亢模型,排除了與甲亢自身免疫過程相關的任何潛在的干擾性疾病特異性影響。

參考文獻

? ? ? ?Pietzner M, Engelmann B, Kacprowski T, et al. Plasma proteome and metabolome characterization of an experimental human thyrotoxicosis model.[J]. Bmc Medicine, 2017, 15(1):6.