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基因芯片技術服務
主要功能
1. 基因芯片技術服務能夠完成小鼠和人類基因表達譜芯片的優化和批量制作。
2. 通過對基因芯片數據處理和分析，可對芯片數據進行倍值，統計，聚類，分子網絡等系列分析。
3. 通過設計TaqMan探針和引物可提供對芯片結果的定量實時PCR(TaqMan)驗證支持。
4. 提供對小鼠和人類表達譜芯片所有基因的生物信息學自動注釋及更新。
實驗儀器
1. OmniGrid100 Microarrayer
??????? 主要特點與技術參數
??????? · 高速可靠的馬達和和移動平臺精確性:兩次重復<+-2.5um
??????? · 步進精度：2.5um(X軸和Y軸):1.25um(Z軸)
??????? · 配的是Telechem針,點的平均大小約150um
??????? · 一次最多可放置100塊標準玻片，每片現在最多可點22000個點
2. Genepix4000B Scanner(Axon)
??????? 主要特點與技術參數
??????? · 是基于PMT(photomultiplier tube, 光電倍增管)的檢測系統的激光共聚焦原理。
??????? · 可以選擇同步或是連續掃描，同步掃描可以避免由于機械原因造成的玻片的定位不準確，掃描誤差的出現。
??????? · 為單玻片手動載入，具有635nm(紅色的)和532nm(綠色的)兩色激光以及適配的紅色和綠色的發射濾光片。
??????? · 它可掃描多種材料，掃描大小為25mm×75mm。
??????? · 激光強度由5-100%連續可調。
??????? · 掃描精度可從5μm-10μm分級調整
人和小鼠的cDNA表達譜芯片基本分類信息
| 人的cDNA表達譜芯片基本分類信息 | 小鼠的cDNA表達譜芯片基本分類信息 | ||
| Biological Process | gene number | Biological Process | gene number |
| Amino acid metabolism | 44 | Cell juction protein | 23 |
| Apoptosis | 237 | Chaperone | 17 |
| Carbohydrate metabolism | 132 | Cytoskeletal protein | 37 |
| Cell adhesion | 274 | Extracellular matrix | 20 |
| Cell cycle | 425 | Hydrolase | 460 |
| Cell proliferation and differentiation | 283 | Ion channel | 62 |
| Cell structure and motility | 79 | Isomerase | 52 |
| Coenzyme and prosthetic group metabolism | 3 | Kinase | 421 |
| Developmental processes | 750 | Lyase | 68 |
| Electron transport | 200 | Nucleic acid binding | 444 |
| Homeostasis | 44 | Oxidoreductase | 334 |
| Intracellular protein traffic | 62 | Phosphatase | 32 |
| Lipid, fatty acid and steroid metabolism | 183 | Protease | 8 |
| Muscle contraction | 68 | Receptor | 447 |
| Neuronal activities | 62 | Signaling molecule | 156 |
| Nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism | 246 | Synthase and synthetase | 51 |
| Phosphate metabolism | 25 | Transcription factor | 307 |
| Protein metabolism and modification | 227 | Transferase | 496 |
| Protein targeting and localization | 18 | Transporter | 231 |
| Signal transduction | 1065 | ||
| Transport | 1019 | ||
服務內容
| 服務名稱 | 服務內容 |
| 定制芯片 | 根據顧客需要設計和制備cDNA芯片 |
| 芯片實驗設計 | 為顧客設計優化芯片實驗以利于得到可靠的數據和成果發表 |
| RNA樣品制備 | 從細胞或組織中提取RNA樣品 |
| 樣本標記和雜交 | 1. RNA→cDNA→cRNA,單熒光標記，與Codelink或Affymetrix oligo芯片雜交 2. RNA→cDNA，Cy3與Cy5標記，與cDNA芯片雜交 |
| 芯片簡單數據處理? | 1. 芯片所含基因的GeneBank號、基因名稱與功能簡單描述 2. 芯片實驗檢測得到的信號值 3. 數據分析后的信號比值，排序，篩選表達顯著性改變的基因 4. 芯片熒光信號彩色圖譜一張 |
| 芯片數據系列分析 | 統計分析，聚類分析(Hierarchical Clustering)，組圖分析(Self_Organizing Maps, SOMs)，分子網絡(pathway analysis) |
芯片技術服務內容說明
1. 費用：對于材料費(芯片費用)我們將給予優惠的價格；由于我們與Codelink和Affymetrix公司有著很好的戰略伙伴關系，我們愿意全力協助廣大的科研人員并以最優惠的價格提供服務。詳細服務價格敬請來電查詢。(也可以自行提供.)
2. RNA樣本要求：a) cDNA芯片，每張芯片需提供30μg-60μg total RNA。b) Codelink或Affymetrix的寡核苷酸芯片，每張芯片需提供5ug-15μg total RNA。
3. 時間：服務所需時間依樣本情況而定，一般情況下，當我們收到您所提供的達到要求的樣本后2周后即可交付結果。
服務價格
| 服務內容 | 服務收費 | |
| 芯片制作 | ||
| 開機費 | 2500元（6小時內），每小時加收250元 | |
| 玻璃片 | 150元/張 | |
| 384-well plate | ?250元/plate | |
| 點樣 | 4元/點 | |
| 樣品固定 | 180元/次 | |
| 轉移樣品 | 600元/384-well | |
| 芯片點樣位置設計 | 1000點? 350元/次 | |
| 1001-5000點，550元/次 | ||
| 5000點，850元/次 | ||
| 核酸提取及熒光標記 | 視具體實驗內容收費 | |
| 雜交反應 | 視具體實驗內容收費 | |
| Axon Scanner圖象掃描 | 600元/張芯片 | |
| Genepix定量分析 | 1000點，550元/張芯片 | |
| 1001-5000點，850元/張芯片 | ||
| 5000點，1200元/張芯片 | ||
| 基因表達的Real-time RT-PCR驗證 | ||
| 引物設計、RNA逆轉錄、Real-time RT-PCR及數據分析 | 視具體實驗內容收費 | |
| 基因芯片數據分析 | 數據質量評估 | ￥180/張 |
| 基本數據分析（雜交信號值、基因注釋、信號比值、差異表達基因的篩選） | 前兩張：￥3500/張， 多于兩張則以后￥600/張 | |
| 高級數據分析服務（基本數據分析、統計分析、篩選差異表達基因、表達模式識別、功能富集分析、文獻挖掘等） | ￥6000/張 | |
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