目標(biāo)序列捕獲測序-分子生物學(xué)服務(wù) -技術(shù)服務(wù)-生物在線

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晶能生物技術(shù)(上海)有限公司
目標(biāo)序列捕獲測序

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概述

目標(biāo)序列捕獲測序是將感興趣的基因組區(qū)域通過捕獲試劑盒進(jìn)行富集后再進(jìn)行測序的研究策略。根據(jù)不同應(yīng)用可以定制幾百K到幾M的區(qū)域,利用較少的數(shù)據(jù)量就可以得到超高的靈敏度和準(zhǔn)確度,幫助您快速篩選到變異位點。您只需提供樣本和候選區(qū)域,我們即可完成從探針定制、雜交、測序到生物信息分析的全套流程。

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技術(shù)路線

生物信息學(xué)分析模塊

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樣品要求

1) 樣品純度:OD 260/280值應(yīng)在1.82.0之間;RNA應(yīng)該去除干凈。

2) 樣品濃度:最低濃度不低于50ng/μl。

3) 樣品總量:每個樣品總量不少于5μg。

4) 樣品溶劑:要溶解在H20TEpH 8.0)中。

5) 樣品運輸:DNA低溫運輸(-20℃);且在運輸過程中請用parafilm將管口密封

以防出現(xiàn)污染。

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應(yīng)用案例

線粒體呼吸鏈疾病涉及到大量的線粒體和細(xì)胞核基因,因此要發(fā)現(xiàn)此類疾病的分子機制是相當(dāng)有挑戰(zhàn)性的。Sarah 等人報道一種集合候選基因預(yù)測、高通量測序和實驗驗證的研究策略,一邊發(fā)現(xiàn)與線粒體呼吸鏈復(fù)合物I相關(guān)的疾病分子機制。他們分析了來自103個疾病案例和42個健康對照的7DNA池,并對103個候選基因進(jìn)行了深度測序,鑒定出151個可能影響蛋白功能的罕見突變。他們通過驗證性實驗(包括cDNA互補)對60個過去未能解決病例中的13個案例進(jìn)行了遺傳分析診斷,發(fā)現(xiàn)NUBPLFOXRED1的突變能引起復(fù)合物I的缺乏。他們的研究展示了大規(guī)模測序,并配合功能預(yù)測和實驗驗證,能用于鑒定個案病例中的致病突變。

參考文獻(xiàn)

[1] Sarah EC.,? Elena JT.,? Alison GC., et al. High-throughput, pooled sequencing identifies mutations in NUBPL and FOXRED1 in human complex I deficiency. Nature Genetics, 2010, 42:851–858.

[2]Saintenac C, Jiang D, Akhunov ED, et al. Targeted analysis of nucleotide and copy number variation by exon capture in allotetraploid wheat genome.2011.Genome Biol.12:R88.

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