轉錄組 轉錄組即特定組織或細胞在某一特定功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA總和，包括mRNA和非編碼RNA，轉錄組研究是基因結構和功能研究的基礎，通過第二代測序能夠快速地獲得某一特定器官或組織在某一狀態下幾乎所有的RNA轉錄本序列，從而在生物學，醫學和藥物研發領域開展研究。 無參考基因組： Unigene 功能注釋；Unigene GO分析 ；Unigene 表達差異分析；蛋白編碼區預測（CDS），Unigene 代謝通路分析；Unigene Pathway 富集性fenx分析 有參考基因組：表達差異分析；檢測基因融合；基因結構優化；鑒定基因的可變剪切；新轉錄本預測；SNP分析 應用領域：分子育種；疾病分型研究；生物代謝調控研究；病理與毒理學研究；分子標志與藥物靶點篩選研究 技術路線： 提取總RNA 富集RNA RNA片段化（200nt） 隨機引物反轉錄CDNA 加接頭PCR擴增 測序分析：測序數據統計分析；差異表達基因篩選；差異基因表達模式聚類分析；GO功能顯著性富集分析；Pathway顯著性富集分析;蛋白相互作用網絡分析