VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI（快速、高檢出的華大平臺RNA建庫試劑盒）
產品名稱： VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI（快速、高檢出的華大平臺RNA建庫試劑盒）
英文名稱： VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI
產品編號： NRM605
產品價格： 0
產品產地： 南京
品牌商標： Vazyme
更新時間： null
使用范圍： null
- 聯系人 :
- 地址 : 南京市經濟技術開發區紅楓科技園C2棟
- 郵編 : 210000
- 所在區域 : 江蘇
- 電話 : 173****2095 點擊查看
- 傳真 : 點擊查看
- 郵箱 : wangminwen@vazyme.com
快速：極簡的操作流程，使得轉錄組建庫時間縮短至4.5 h
兼容：針對低質量樣本，有更高的建庫成功率
高質：基因檢出率高，轉錄本區域的覆蓋度均一
1. 不同物種、不同起始量模板
以動物（人體血液、293 T細胞），細菌（大腸桿菌），植物（擬南芥、大豆）Total RNA為模板，根據物種的不同分別選擇N406（動物rRNA去除產品），N407（細菌rRNA去除產品），N408（rRNA及珠蛋白mRNA去除產品）和N409（植物rRNA去除產品）進行rRNA去除。隨后參照NRM605和A公司同類型產品的建庫流程進行鏈特異性轉錄組文庫構建，結果顯示使用Vazyme # NRM605建庫相較競品均具有明顯的產量優勢。
圖1. 不同物種和投入量下NRM605構建的文庫產量
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物種 | NRM605峰型 |
239 T |
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擬南芥 |
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黃豆 |
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圖2. 不同物種在不同投入量下構建的文庫峰型
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2. 兼容低質量樣本
以低質量FFPE樣本(RIN值為2.3)為起始模板，投入量為200ng，使用VAHTS??Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)（Vazyme，# N406）進行rRNA去除，再分別以NRM605、A、B的建庫全組分按照各自的說明書進行操作，進行鏈特異轉錄組建庫。結果顯示：從產量上看，Vazyme# NRM605＞A＞B，Vazyme# NRM605 具有明顯的產量優勢。
文庫產量 | NRM605峰型 |
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圖3. 在不同公司產品對低質量樣本建庫的文庫產量
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3. 基因檢出率高
以293T細胞 Total RNA為起始模板，分別使用VAHTS??mRNA Capture Beads（Vazyme，# N401，mRNA抓取模塊，Input RNA量分別為1μg/100ng/10ng）和Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)（Vazyme，# N406，rRNA去除模塊，Input RNA量分別為1μg/100ng/10ng）進行前處理，隨后使用NRM605、A公司及B公司同類產品進行鏈特異性轉錄組文庫構建，經質控合格后的文庫使用lllumina HiSeq X10平臺進行PE150測序。對原始測序數據進行低質量讀過濾，得到高質量的Clean Reads進行分析。結果顯示：Vazyme# NRM605基因檢出率優于其他產品。
圖4.?各公司產品基因檢測數
VAHTS??Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI是針對MGI高通量測序平臺定向開發的轉錄組文庫構建專用試劑盒。試劑盒包含兩種類型的cDNA二鏈合成Buffer，可根據需要選擇普通轉錄組或鏈特異轉錄組建庫。
試劑盒將二鏈合成、末端修復和dA-Tailing合并為一步，中間不需要純化步驟，極大的簡化了操作流程，縮短了建庫時間。優化的反應體系，提高了文庫轉化效率，能兼容更低起始投入量，對不同起始量的RNA都有均一的覆蓋度。
本試劑盒利用磁珠分選的方式，可以快速獲得特定長度的文庫，能夠滿足不同實驗的個性化需求。試劑盒包含的所有酶和緩沖液都經過了嚴格的質量控制和功能驗證，最大程度上保證了文庫構建的穩定性重復性。
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