VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI（快速、高檢出的華大平臺(tái)RNA建庫試劑盒）
產(chǎn)品名稱： VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI（快速、高檢出的華大平臺(tái)RNA建庫試劑盒）
英文名稱： VAHTS Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI
產(chǎn)品編號(hào)： NRM605
產(chǎn)品價(jià)格： 0
產(chǎn)品產(chǎn)地： 南京
品牌商標(biāo)： Vazyme
更新時(shí)間： null
使用范圍： null
- 聯(lián)系人 :
- 地址 : 南京市經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)紅楓科技園C2棟
- 郵編 : 210000
- 所在區(qū)域 : 江蘇
- 電話 : 173****2095 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : wangminwen@vazyme.com
快速：極簡(jiǎn)的操作流程，使得轉(zhuǎn)錄組建庫時(shí)間縮短至4.5 h
兼容：針對(duì)低質(zhì)量樣本，有更高的建庫成功率
高質(zhì)：基因檢出率高，轉(zhuǎn)錄本區(qū)域的覆蓋度均一
1. 不同物種、不同起始量模板
以動(dòng)物（人體血液、293 T細(xì)胞），細(xì)菌（大腸桿菌），植物（擬南芥、大豆）Total RNA為模板，根據(jù)物種的不同分別選擇N406（動(dòng)物rRNA去除產(chǎn)品），N407（細(xì)菌rRNA去除產(chǎn)品），N408（rRNA及珠蛋白mRNA去除產(chǎn)品）和N409（植物rRNA去除產(chǎn)品）進(jìn)行rRNA去除。隨后參照NRM605和A公司同類型產(chǎn)品的建庫流程進(jìn)行鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建，結(jié)果顯示使用Vazyme # NRM605建庫相較競(jìng)品均具有明顯的產(chǎn)量?jī)?yōu)勢(shì)。
圖1. 不同物種和投入量下NRM605構(gòu)建的文庫產(chǎn)量
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物種 | NRM605峰型 |
239 T |
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擬南芥 |
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黃豆 |
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圖2. 不同物種在不同投入量下構(gòu)建的文庫峰型
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2. 兼容低質(zhì)量樣本
以低質(zhì)量FFPE樣本(RIN值為2.3)為起始模板，投入量為200ng，使用VAHTS??Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)（Vazyme，# N406）進(jìn)行rRNA去除，再分別以NRM605、A、B的建庫全組分按照各自的說明書進(jìn)行操作，進(jìn)行鏈特異轉(zhuǎn)錄組建庫。結(jié)果顯示：從產(chǎn)量上看，Vazyme# NRM605＞A＞B，Vazyme# NRM605 具有明顯的產(chǎn)量?jī)?yōu)勢(shì)。
文庫產(chǎn)量 | NRM605峰型 |
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圖3. 在不同公司產(chǎn)品對(duì)低質(zhì)量樣本建庫的文庫產(chǎn)量
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3. 基因檢出率高
以293T細(xì)胞 Total RNA為起始模板，分別使用VAHTS??mRNA Capture Beads（Vazyme，# N401，mRNA抓取模塊，Input RNA量分別為1μg/100ng/10ng）和Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)（Vazyme，# N406，rRNA去除模塊，Input RNA量分別為1μg/100ng/10ng）進(jìn)行前處理，隨后使用NRM605、A公司及B公司同類產(chǎn)品進(jìn)行鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建，經(jīng)質(zhì)控合格后的文庫使用lllumina HiSeq X10平臺(tái)進(jìn)行PE150測(cè)序。對(duì)原始測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行低質(zhì)量讀過濾，得到高質(zhì)量的Clean Reads進(jìn)行分析。結(jié)果顯示：Vazyme# NRM605基因檢出率優(yōu)于其他產(chǎn)品。
圖4.?各公司產(chǎn)品基因檢測(cè)數(shù)
VAHTS??Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for MGI是針對(duì)MGI高通量測(cè)序平臺(tái)定向開發(fā)的轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建專用試劑盒。試劑盒包含兩種類型的cDNA二鏈合成Buffer，可根據(jù)需要選擇普通轉(zhuǎn)錄組或鏈特異轉(zhuǎn)錄組建庫。
試劑盒將二鏈合成、末端修復(fù)和dA-Tailing合并為一步，中間不需要純化步驟，極大的簡(jiǎn)化了操作流程，縮短了建庫時(shí)間。優(yōu)化的反應(yīng)體系，提高了文庫轉(zhuǎn)化效率，能兼容更低起始投入量，對(duì)不同起始量的RNA都有均一的覆蓋度。
本試劑盒利用磁珠分選的方式，可以快速獲得特定長(zhǎng)度的文庫，能夠滿足不同實(shí)驗(yàn)的個(gè)性化需求。試劑盒包含的所有酶和緩沖液都經(jīng)過了嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證，最大程度上保證了文庫構(gòu)建的穩(wěn)定性重復(fù)性。
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