生命體是一個多層次多功能的復雜結構體系，基因表達不只是從mRNA到蛋白的單向傳遞，而是兩者相互的動態作用。為了系統了解基因的調控機制，有必要在轉錄本和蛋白質層次上同步檢測，互相關聯分析。然而，當細胞經過轉錄水平、轉錄后（如mRNA的剪接）、翻譯后（蛋白降解和輸出）的精細調控機制后，轉錄物和蛋白質的表達水平可能會不一致。因此，定量的轉錄物和蛋白質豐度測量可作為相互的標準，為高通量分析得出的基因表達數據做出合理的解釋。正如蛋白質和RNA之間類似點可以增加我們對新的生物標記的信任度一樣，差異也能暗示我們“其他的轉錄后調控結合點可作為重要的調控研究靶點”。

武漢華美生物使用先進的高通量技術，可以在各個層次最大限度挖掘轉錄組水平和蛋白組水平的相互關聯，為尋找biomarker、mRNA和（或）蛋白質存在的可靠性、闡述復雜的生命活動機制增加更有力的證據。

現可提供的轉錄組和蛋白質組相關性分析如下：

1、基因分別在基因組、轉錄組、蛋白質組層次的定性關聯分析

通過這種“全景式”的分析比較，可實現期間的互補和整合、對生物體中基因及其表達產物的全方位分析。

2、轉錄組、蛋白質組樣品間表達量變化關聯分析

我們全面分析兩個層次基因上下調關系（如mRNA和蛋白表達量變化一致且顯著、mRNA和蛋白表達量變化一致且不顯著、mRNA和蛋白表達量變化相反）（如圖1），更細致的為您呈現其中的轉錄翻譯調控機制。

圖1：轉錄組&蛋白質組表達量變化關聯分析

3、轉錄組、蛋白質組等不同層次表達模式聚類分析。

即從整體上觀測各層次的差異基因聚類情況。

4、差異蛋白/mRNA的Pathway分析

按照2中對mRNA和蛋白表達量變化的不同狀態（如圖1），分別對其做Pathway通路分析，試圖找出一些具有意義的基因。

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