SSR分型服務-分子生物學服務 -技術服務-生物在線
上海翼和應用生物技術有限公司
SSR分型服務

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產品名稱: SSR分型服務

英文名稱: STR

產品編號: STR-1

產品價格: 0

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更新時間: 2024-10-22T14:25:56

使用范圍: null

上海翼和應用生物技術有限公司
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STR 介紹
短串聯重復序列 (short tandem repeat,STR),又稱為微衛星標記(microsatellite)。它廣泛并均勻地存在于真核生物基因組中,一般 由一個長2~6bp的核心序列經多次串聯重復排列而成,重復次數大多在10~60次之間。個體間核心序列的重復次數呈高度變異性,構成了STR的遺傳多態 性。由于STR具有分布廣泛均勻、多態性豐富、信息量大、檢測簡便等優點,被認為是繼限制性片段長度多態性(RFLP)之后的第二代遺傳標記,已廣泛應用 于遺傳圖譜繪制、基因定位、法醫鑒定、遺傳病診斷等諸多領域。
基本原理
利用高通量測序技術對短串聯 重復(STR)位點進行深度測序,經過生物信息學分析,實現對STR位點的檢測,與傳統的凝膠電泳或毛細管電泳相比,可以直接根據序列,準確判斷STR位 點的重復次數。借助多重PCR技術,能夠實現在一個PCR反應中完成幾十個STR位點的擴增,二代測序的超高通量,可將上千個樣本和STR位點混合檢測, 大大降低實驗成本。
服務流程
1、客戶溝通,確認實驗信息(包括物種,樣本數,樣本類型,檢測片段),并進行相關分析,評估實驗可行性。
2、樣本質控,設計合成引物
3、小試、中試,調整多重PCR反應體系,評估擴增效果
4、PCR生產,構建高通量測序文庫
5、上機測序
6、生物信息學分析,將實驗報告和數據交付客戶。
提供結果
提供的結果包括:
1、實驗報告,含實驗材料與方法,所用引物序列等等
2、結果匯總,各樣本中STR位點的重復次數或片段大?。╡xcel形式)
樣本要求
1、若樣品為基因組DNA,要求:DNA濃度≥20ng/ul,體積>20ul。純度OD 260/OD280 在1.8~2.0之間。
2、若分型樣品為血樣,樣本要求:血液樣品,體積大于500ul,需用抗凝劑抗凝,送樣過程中請注意保持低溫,防止DNA降解。提取DNA將收取DNA提取費。
3、客戶在寄送樣品的時候,應在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少在運輸過程中因溫度變化導致DNA降解的可能。
4、提供STR位點信息(序列及STR重復次數)。

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