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基因組重測序

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產品名稱: 基因組重測序

英文名稱: Resequencing

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全基因組重測序(Resequencing)是對基因組序列已知物種進行不同個體間的基因組測序,并在此基礎上對個體或群體水平進行差異性分析。通過全基因組重測序,可以全面的挖掘基因序列差異和結構變異,應用范圍涉及群體遺傳學研究、關聯分析、進化分析、臨床醫藥研究等眾多領域。

隨著測序成本的大幅度降低以及測序效率的數量級提升,全基因組重測序已經成為研究動植物分子育種及人類疾病最為快速有效的方法之一。

???? 技術路線

數據分析

1、基本數據分析:數據產出統計、參考序列比對

2、SNP檢測與統計

3、InDel檢測與統計

4、結構變異(SV)分析

?5、拷貝數變異(CNV)分析

參考文獻

1、Jia G, et al. A haplotype map of genomic variations and genome-wide association studies of agronomic traits in foxtail millet (Setaria italica) .Nature Genet. 2013; 45: 957-961.

?

2、Huajun Zheng,et al. The genome of the hydatid tapeworm?Echinococcus granulosus Nature Genetics 45,1168–1175 (2013)