期刊：Aquaculture；影響因子：5.1347

研究對象：肽聚糖識別蛋白（PGRP）、海參

研究目的：探究海參分泌肽聚糖識別蛋白在先天免疫中的作用

研究手段：蛋白質相互作用組學等

研究內容及結論：肽聚糖識別蛋白（PGRP）由模式識別受體（PRR）家族組成，在先天免疫中起重要作用。作者使用RACE擴增了來自海參 A. Japonicus 的新型PGRP（名為AjPGRP-S1）的全長cDNA。隨后制備密碼子優化的重組AjPGRP-S1（rAjPGRP-S1）蛋白，并通過免疫家兔培養針對rAjPGRP-S1的多克隆抗體。在轉錄水平上，通過原位雜交和RT-qPCR檢測AjPGRP-S1的組織表達模式，同時通過RT-qPCR檢測微生物多糖刺激后AjPGRP-S1的基因表達情況。采用微孔板法測定酰胺酶活性；通過ELISA和間接免疫熒光法確定病原體識別特征，并通過pull-down結合LC-MS/MS，篩選和鑒定與AjPGRP-S1相互作用的免疫因子。該蛋白預計含有一個信號肽和一個PGRP結構域，分子質量為24.6 kDa，但缺少形成鋅離子結合位點和酰胺酶活性所必需的半胱氨酸殘基。事實上，從rAjPGRP-S1中沒有檢測到酰胺酶活性。這些結果表明，AjPGRP-S1可能是一種分泌型、短型和識別型PGRP。AjPGRP-S1轉錄本在腔胞細胞中含量較高，且通過二氨基庚二酸（DAP）型肽聚糖（PGN）激發誘導，提示AjPGRP-S1主要由腔胞細胞表達，可能在防御革蘭氏陰性菌中起關鍵作用。rAjPGRP-S1 被確定能夠與 DAP 型 PGN、賴氨酸（Lys）型 PGN、β-1，3-葡聚糖、脾弧菌、黑假交替單胞菌、波羅的海希瓦氏菌、蠟樣芽孢桿菌、大腸桿菌和金黃色葡萄球菌結合，但不能結合脂多糖或甘露聚糖，暗示AjPGRP-S1可能具有廣譜病原體識別能力。此外，研究還發現rAjPGRP-S1可直接或間接地與多種可溶性和不溶性PRRs以及多種抗氧化、抗應激、補體系統、細菌裂解和免疫應答相關因子以及幾種潛在的免疫調節因子相互作用，表明A. Japonicus 完全識別病原體免疫系統可能需要AjPGRP-S1和其他PRR的協同活性。這些結果進一步表明，AjPGRP-S1可能將病原體識別后產生的免疫信號轉導到多個免疫效應子以誘導病原體攻擊導向和自我保護導向的免疫反應以及潛在的免疫調節因子從而調整A. Japonicus 免疫系統的反應。

利用蛋白質互作組學研究AjPGRP-S1與其他免疫因子的相互作用，該服務由北京百泰派克生物科技提供。結合LC-MS/MS分析的pull-down拉下蛋白顯示，rAjPGRP-S1可能直接或間接地與細胞游離體腔液中的幾種分泌性免疫相關蛋白以及一些來自體腔細胞的膜定位免疫相關蛋白相互作用。

參考文獻：Jiang J, Gao S, Wang X, et al. The role of a novel secretory peptidoglycan recognition protein from the sea cucumber Apostichopus japonicus in innate immunity[J]. Aquaculture, 2022, 546: 737339.

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質，提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種蛋白質標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.專業生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，最后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術先進，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從最小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等專業服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

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