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【基因編輯】服務之一:CRISPR/Cas9基因敲除
簡介
CRISPR/Cas(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/Cas)系統是目前被廣泛運用的基因編輯系統,其原理是由CRISPR轉錄產生的gRNA介導Cas核酸酶靶向目標序列,對序列進行切割。其中最常用的是靶向DNA的CRISPR/Cas9系統,此系統是由II類CRISPR/Cas系統改造而來,能夠在植物、細菌、酵母、魚類及哺乳動物等多種細胞中,進行有效的靶向編輯,具有操作簡易、效率高、以及作用靶位點多等優勢。
CRISPR/Cas9系統中sgRNA(small guide RNA)識別并結合目標基因的靶向序列,引導Cas9對結合位點進行剪切,產生DNA雙鏈斷裂(double-strand break, DSB),機體自身通過非同源重組(non-homologous end joining,NHEJ)的方式修復DSB,參與修復的蛋白經常會在DNA末端插入或刪除幾個堿基,修復后的基因由于產生突變而導致功能喪失,從而實現機體內的基因敲除(Gene Knockout)。
其中Cas9可根據不同菌屬來源及大小進行分類,目前得到廣泛應用的有SpCas9和SaCas9,SpCas9來源于化膿性鏈球菌(S.pyogenes)的Cas9核酸酶,由1368個氨基酸組成,可識別的PAM序列為NGG ,由于構建載體載量過大,因此所選擇的病毒載體有限,通常構建在慢病毒載體上;SaCas9是來源于金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的Cas9核酸酶,由1053個氨基酸組成,可識別的PAM序列為NNGRRT,比SpCas9小25%,能夠進行AAV病毒的包裝,適用范圍更廣。
CRISPR/Cas9系統介導的基因編輯(Wiles M V et al. Mammalian Genome, 2015)
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非同源重組修復DSB(Wiles M V et al. Mammalian Genome, 2015)
應用
CRISPR/Cas9基因敲除細胞系建立
CRISPR/Cas9基因敲除建立動物疾病模型
技術優勢
- 操作簡易:僅需Cas9核酸酶和sgRNA即可對目標基因靶位點進行切割;
- 效率高:在基因組水平上編輯目標基因,高度模擬目標模型,可精確編輯基因組;
- 作用靶位點多:可實現多個靶基因位點及多個基因的同時敲除;
- 提供多種基因編輯病毒工具:AAV、LV;
- 提供 BSL-1 和 BSL-2 病毒注射及實驗操作平臺;
- 全面的實驗技術支持。
服務內容
- sgRNA的設計;
- 細胞內sgRNA剪切活性篩選;
- 敲除載體的構建;
- 依據所要編輯的細胞選擇Cas9和sgRNA不同導入方式:
b、 脂質體難轉染細胞:使用質粒系統電轉化、慢病毒或腺相關病毒感染(Cas9和sgRNA);
- 篩選基因敲除單克隆細胞系。
服務流程

客戶提供
1、目的基因基因序列(序列/ID)以及物種來源;
2、需介導基因敲除的細胞(可選);
3、病毒類型選擇以及要求;
4、血清型選擇。
服務信息及最終交付內容、產品
| 流程分布 | 周期(工作日) | 交付內容 | 交付產品 |
| sgRNA序列的設計 | 2~4周 | sgRNA設計分析報告 | - |
| sgRNA的活性篩選 | 獲得有活性的sgRNA及篩選報告 | ||
| 基因敲除質粒的構建 | 1周 | 基因敲除質粒報告 | 基因敲除質粒 |
| 病毒包裝 | 3周 | 病毒包裝報告 | 高純度病毒 |
| 單克隆細胞分選報告 | 8周 | 單克隆細胞分選及檢測結果報告 | 基因敲除單克隆細胞系 |
聲明:樞密科技提供的所有基因編輯服務及該服務的后續研究,僅適用在國家法律和倫理規范的范圍內實施。禁止用于任何人體或臨床實驗的研究;禁止用于對人類生殖體系進行基因修飾的研究;禁止將基因修飾的其他動物胚胎及生殖細胞植入人體。客戶如違反相關法律規定,本公司不承擔任何法律責任。
案例展示
HaoyiWang等人研究發現,CRISPR / Cas介導的基因編輯允許高效地同時破壞小鼠胚胎干(ES)細胞中的五個基因(Tet1,2,3,Sry,Uty-8等位基因),通過NHEJ引入多個隨機indel的靶向突變。將靶向Tet1和Tet2的Cas9 mRNA和sgRNA共注射到受精卵中,在兩種基因中產生具有雙等位基因突變的小鼠,效率為80%。CRISPR / Cas系統允許一步產生攜帶多個基因突變的動物,這種方法將大大加速功能冗余基因和上位基因相互作用的體內研究。
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小鼠胚胎干細胞的多基因敲除(Wang H et al. Cell, 2013)

小鼠和小鼠胚胎干細胞的多基因編輯(Wang H et al. Cell, 2013)
參考文獻
- Wiles M V , Qin W , Cheng A W , et al. CRISPR–Cas9-mediated genome editing and guide RNA design[J]. Mammalian Genome, 2015, 26(9-10).
- Wang H , Yang H , Shivalila C , et al. One-Step Generation of Mice Carrying Mutations in Multiple Genes by CRISPR/Cas-Mediated Genome Engineering[J]. Cell, 2013, 153(4):910-918.
