如何鑒定組蛋白乳酸化修飾位點?
產品名稱: 如何鑒定組蛋白乳酸化修飾位點?
英文名稱: How to Identify Lactylation Sites on Histones?
產品編號: histone-lactylation-analysis-zh6
產品價格: 詢價
產品產地: 中國北京
品牌商標: 百泰派克生物科技
更新時間: 2026-04-22T11:31:36
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組蛋白乳酸化(histone lactylation)作為一種新型表觀遺傳修飾逐漸受到關注。該修飾揭示了代謝產物乳酸不僅僅是能量代謝的副產物,還可通過修飾組蛋白賴氨酸殘基,調控基因表達。相比乙?;?、甲基化等修飾形式,乳酸化直接連接了細胞代謝狀態與染色質動態之間的橋梁,特別在腫瘤、免疫、缺氧等研究領域展現出獨特的生物學意義。隨著研究深入,科學家急需建立一套高靈敏、高特異、可定量的技術手段來識別和分析組蛋白乳酸化修飾位點。
一、組蛋白乳酸化:代謝-表觀遺傳交叉的新視角
組蛋白是染色質的核心組成部分,其賴氨酸殘基上常見多種修飾,如乙?;?、甲基化、泛素化等。乳酸化(Lactylation)則是近年新發現的一類修飾,主要發生在賴氨酸(K)殘基上,形成ε-N-L-lactyllysine。研究發現,組蛋白乳酸化與細胞代謝密切相關,尤其在低氧環境、活躍糖酵解狀態下顯著增加,進而調控基因表達,參與多種生理與病理過程,如炎癥反應、免疫激活、腫瘤代謝等。
二、如何精準識別組蛋白乳酸化修飾位點?
1、樣本準備
為確保后續修飾位點的高效鑒定,首先需要提取高純度組蛋白:
(1)常用方法:利用強酸提取法(如0.2M H?SO?),可有效分離組蛋白與非組蛋白雜質
(2)蛋白定量與質控:建議通過SDS-PAGE或BCA進行濃度檢測與質量評估
2、組蛋白的酶切策略
由于組蛋白富含堿性氨基酸,胰蛋白酶切割位點(K/R)頻繁出現,導致多肽過短、難以用于質譜分析。
推薦的酶切方案包括:
(1)Glu-C 或 Asp-N:避免賴氨酸斷裂,保留乳酸化修飾信息
(2)多酶聯合酶切:如Trypsin + Lys-C組合,提高覆蓋度
3、富集乳酸化肽段
由于乳酸化肽在總肽段中比例極低,靶向富集成為質譜檢測前的必要步驟。
(1)抗乳酸化賴氨酸抗體富集:目前已有商業化抗體(如PTM Biolabs)可用于IP富集乳酸化肽
(2)免疫親和層析結合質譜:顯著提升修飾肽的富集效率與特異性
4、LC-MS/MS分析
(1)儀器推薦:使用高分辨率質譜儀(如Orbitrap Fusion Lumos, timsTOF Pro)
(2)參數優化:
- MS1分辨率 ≥60,000
- HCD碎裂模式,保留乳酸化標志性中性丟失信息
- 開啟動態修飾識別(variable modification: +72.0211 Da for lactylation)
(3)軟件分析:
- 使用MaxQuant、PEAKS或Byonic等支持PTM搜索的軟件
- 自定義乳酸化修飾質量,確保高置信度定位(site localization probability > 0.75)
三、組蛋白乳酸化與其他修飾的共存分析
組蛋白乳酸化常與乙?;?、甲基化等修飾共存于相同賴氨酸位點(如H3K18),在表觀調控中可能表現為協同或競爭關系。研究顯示,乳酸化可與乙?;餐龠M染色質開放,也可能因代謝狀態改變而動態替代。利用串聯免疫富集和多修飾搜索策略的質譜分析,可識別多重修飾共存的肽段。揭示乳酸化與其他修飾的互作,有助于解析其在轉錄調控、炎癥激活等生物學過程中的協同機制。
四、常見問題與優化建議
| 問題 | 原因分析 | 優化策略 |
|---|---|---|
| 修飾肽檢出率低 | 富集效率不足 | 優化抗體用量、延長孵育時間 |
| 鑒定位點置信度低 | 碎片離子不足 | 調整碰撞能量、增強HCD碎裂效率 |
| 多肽過短影響定位 | 胰酶切割過多 | 采用Glu-C或多酶聯合消化 |
| 修飾鑒定軟件漏檢 | 未設置修飾質量 | 自定義+72.0211 Da作為變量修飾 |
組蛋白乳酸化作為代謝與表觀遺傳調控之間的重要橋梁,正逐步成為腫瘤免疫、炎癥調控等前沿研究的熱點。其位點的精準鑒定依賴高純樣本制備、特異性富集策略與高分辨質譜平臺的協同配合。面對乳酸化修飾低豐度、異構體復雜等挑戰,構建一套標準化、系統化的檢測流程尤為關鍵。百泰派克生物科技整合高分辨質譜平臺(如Orbitrap Exploris 480)、自建乳酸化富集方法庫及定制化數據分析流程,為研究者提供一站式組蛋白乳酸化組學解決方案,助力解析代謝-表觀遺傳交叉調控機制。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白質組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種蛋白質標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.專業生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,最后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從最小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等專業服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
