?Reduced?Representation?Bisulfite?Sequencing（RRBS）是一種準確、高效、經濟的DNA甲基化研究方法，通過酶切富集啟動子及CpG島區域，并進行Bisulfite測序，同時實現DNA甲基化狀態檢測的高分辨率和測序數據的高利用率。DNA甲基化研究一直是疾病研究的熱點，與基因表達、表型性狀息息相關。RRBS作為一種高性價比的甲基化研究方法，在大規模臨床樣本的研究中具有廣泛的應用前景。利用RRBS可以實現多個樣本的比對基因組分析。

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技術路線

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生物信息服務

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樣品要求

1）樣品總量：≥?3?μg?DNA（常規樣本），≥?5?μg?DNA（FFPE或降解DNA樣本）；

2）樣品純度：OD260/280?=?1.8-2.0；

3）樣品完整性：DNA無明顯降解與蛋白污染，需提供凝膠電泳檢測膠圖；

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應用領域

?通過對多種人類細胞類型進行甲基化譜系研究，發現非CpG甲基化主要存在于多能干細胞，并隨著分化而減少最后在體細胞中完全消失。而且非CpG甲基化可以在iPS細胞中重新被激活。非CpG甲基化和DNMT3表達水平很強的相關性，敲除DNMTA和DNMT3B基因的人類胚胎干細胞使得非CpG甲基化程度降低?？傊@些研究結果有助于進一步對我們理解人類細胞中的胞嘧啶甲基化模式。

參考文獻

[1]?Wang?Hao,?Matthew?T,QuHongzhu,Widespread?plasticity?in?CTCF?occupancy?linked?to?DNA?methylation.Genome?Research,2012,?doi:?10.1101/gr.136101.111

[2]?Ziller?MJ,?Müller?F,?Liao?J,?et?al.?Genomic?distribution?and?inter-sample?variation?of?non-CpG?methylation?across?Human?Cell?Types.PLoS?Genet.,?2011,7:e1002389.