Illumina公司的Hiseq2000，Roche公司的454和ABI公司的5500xl，Ion torrent等最新的測序平臺為廣大用戶提供了強大的下一代測序方法，為目前生物學，醫學以及功能基因組學等熱門研究領域提出了全新的應用方案。我公司在此領域擁有豐富經驗的測序及生物信息學專家，具備豐富的實驗設計、測序和生物信息分析經驗，能夠提供從方案設計到生物信息分析的整體解決方案，專門為廣大科研領域的客戶提供技術服務。目前公司服務的主要科研領域包括：微生物領域，疾病相關研究，農、林、畜牧及動植物領域的研究。

微生物基因組測序服務介紹

新的測序技術的發展導致了測序成本的大幅降低。我們基于新一代測序技術，推出以下微生物基因組測序服務：

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細菌框架圖，1個月完成；

細菌精細圖，2個月完成；

真菌框架圖，2個月完成；

真菌精細圖，3個月完成；

目前細菌基因組研究進展迅猛，已有684個細菌基因組和51個古細菌基因組序列發布。新技術的應用讓更多的實驗室可以承擔細菌基因組測序的費用，很多細菌基因組的測序工作已經在進行中。微生物基因組研究將會以更快的速度發展，并充滿競爭。

一 、技術路線

基于新一代測序技術，基因組測序成本已經大大降低，而Paired-End技術的出現則大大降低了基因組組裝的難度。因此基于新一代測序的技術路線，使細菌真菌基因組測序費用降低了很多，達到了傳統測序技術的1/5到1/10，時間也大大縮短。

二、生物信息分析

生物信息分析是細菌基因組序列組裝完成后的重要工作，我們公司除了提供世界上最先進的測序服務外，還提供常規生物信息分析內容以及到文章最后成型的一攬子解決方案，如：

基因組組裝：包括原始數據統計；覆蓋度計算；組裝結果統計Scaffold N50，Contig N50；

基因組注釋：coding gene注釋；tRNA基因注釋；rRNA注釋；microRNA注釋；重復序列注釋；

基因功能注釋：GO功能分類；Interpro功能分類；KEGG分類；

比較基因組分析（有近緣物種）：SNP檢測；結構變異檢測。

個性化分析：視具體課題內容而定。

三、 常見問題及解答

1、有什么樣品要求？

1. 客戶需要提供可以證明所提供DNA完整性和準確濃度的包括DNA檢測的膠圖, 紫外分光光度計（nanodrop）檢測結果,或者Aglient 2100 Bio-Analyzer的檢測結果中一種或多種形式的樣品分析 結果；樣品純度：OD值應在1.8～2.0 之間；樣品濃度：樣品的濃度越高越好，最低不應低于30ng/μl；樣品的量：每次樣品制備需要10 μg樣品，如果需要多次制備樣品，則需要樣品總量＝制備樣品次數＊10μg；

2. 我們收到樣品后，需要對樣品進行檢測，最終樣品的量和純度，以我們的檢測結果為準，無論樣本合格與否，我們都將提供完整的檢測報告；

3. DNA如果用乙醇沉淀，則可以常溫運輸，否則在運輸過程中，最好放在干冰中，時間不要超過72小時，如果利用冰袋運輸，則時間最好不要超過24小時；且在運輸過程中請用parafilm將管口密封好，以防出現污染；

4. 請客戶仔細純化樣品，盡量避免污染進入，并請客戶將所送樣品保留備份，我們也將另外由專人保留一份備份，以防止一旦數據中出現外源DNA污染，我們能迅速的查清原因，分清責任；

5. 項目完成，數據提交給客戶后，我們將不再保存樣品，如果客戶還需要樣品，請在項目進行前予以說明，并在項目結束后一個月內將樣品拿走，逾期我們將予以清理；

6. 所有的生物實驗都不排除有意外情況發生，如果在樣品制備過程中出現非正常情況，需要跟客戶溝通，請客戶諒解，提供新的樣品DNA。

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2、對于GC含量大于60%或小于35%時，如何收費？

GC含量大于60%或小于35%時測序和組裝難度增加，需要增加測序量，具體標準和費用需要再協商。

3、哪些因素會影響測序結果的質量？

DNA樣品的純度如果不夠，將會嚴重影響測序結果的質量。另外，對于高GC含量的物種，測序結果的質量會受到一定影響。

4、測序得到的數據保存期限是多久？

??? 在測序及分析過程中，將產生幾個Gb的數據。項目結束后，這些文件需要客戶自行準備足夠空間的存儲設備加以存儲，原則上我們不給予額外保存。具體操作以合同為準。

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