VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(去除核糖體rRNA,適合lncRNA分析)
產(chǎn)品名稱: VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(去除核糖體rRNA,適合lncRNA分析)
英文名稱: VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina
產(chǎn)品編號(hào): NR603-01/02
產(chǎn)品價(jià)格: 0
產(chǎn)品產(chǎn)地: 江蘇南京
品牌商標(biāo): Vazyme
更新時(shí)間: null
使用范圍: null
- 聯(lián)系人 :
- 地址 : 南京市經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)紅楓科技園C2棟
- 郵編 : 210000
- 所在區(qū)域 : 江蘇
- 電話 : 173****2095 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : wangminwen@vazyme.com

包含Ribo-Off??rRNA depletion module,?可去除人、小鼠、大鼠、牛、狗、馬、雞、猴、豬、斑馬魚等物種的核糖體RNA
鏈特異性建庫(kù)
優(yōu)化的大片段建庫(kù)方案


圖1. Ribo-Off?模塊去除rRNA原理示意圖。

圖2. 使用Ribo-Off?模塊去除rRNA總共耗時(shí)不超過2小時(shí),其中操作時(shí)間僅需10分鐘以內(nèi)。

圖3. 1 μg universal human reference RNA分別用Oligo dT磁珠純化mRNA或者用Ribo-Off?模塊去除rRNA后構(gòu)建文庫(kù),用Hiseq 2500測(cè)序。數(shù)據(jù)與人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)hg19進(jìn)行比對(duì)。可以看到, Ribo-Off?模塊可以更有效地去除rRNA,并可保留更多的非編碼RNA信息。

VAHTS??Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina適用于起始模板為0.1-1 μg的人、小鼠、 大鼠總RNA的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建。與常規(guī)mRNA-seq文庫(kù)構(gòu)建不同的是,本試劑盒將rRNA (包括細(xì)胞質(zhì)28S, 18S, 5S rRNA以及線粒體12S, 5.8S rRNA)從總RNA中去除,保留mRNA以及其它非編碼RNA,可用于lncRNA等非編碼RNA的分析。降解的RNA樣本也可用本試劑盒進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建。 在第二鏈cDNA合成時(shí),摻入dUTP標(biāo)記第二鏈; PCR前將標(biāo)記的第二鏈模板用UDG酶消化,使得最終的測(cè)序信息都來自于第一鏈cDNA,從而保留了RNA的鏈方向性。測(cè)序后的數(shù)據(jù)分析可確定轉(zhuǎn)錄本是來自正義還是反義DNA鏈。



所有組分均在-20°C保存。
適用范圍
起始模板:0.1–1 μg人、小鼠、大鼠總RNA。
轉(zhuǎn)錄本信息:
本試劑盒適合于針對(duì)mRNA和所有除rRNA以外的非編碼RNA的鏈特異性RNA-seq分析,包括基因表達(dá)、單核苷酸變異 (single nucleotide variation),可變剪切/融合基因、目標(biāo)轉(zhuǎn)錄組分析等。
