甲基化特異性檢測(MSP/qMSP/BSP)-分子生物學服務 -技術服務-生物在線
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甲基化特異性檢測(MSP/qMSP/BSP)

甲基化特異性檢測(MSP/qMSP/BSP)

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產品名稱: 甲基化特異性檢測(MSP/qMSP/BSP)

英文名稱: MSP/qMSP/BSP

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?使用美國AB公司的9700 PCR System為主的多種PCR裝置。

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? 一,原理與應用

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甲基化是在DNA甲基轉移酶(DNA Methyltransferase, DNMT)催化作用下, 利用

S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)提供甲基,在CpG二核苷酸中胞嘧

啶嘧啶環的五號碳原子上加上甲基的共價修飾過程。DNA甲基化修飾現象廣泛存在于

多種有機體中,是最早發現的修飾途徑之一,是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組

成部分。大量研究表明,DNA甲基化不改變DNA的一級結構,但是能引起染色質結構、

DNA 構象、DNA穩定性及DNA與蛋白質相互作用方式的改變,從而在基因的表達及

其調控、DNA的復制、細胞的生長發育、X染色體失活、衰老以及許多人類疾病(如發

育畸形、癌癥、心血管疾病、糖尿病和神經心理失調等)發生過程中發揮重要作用。

?? ?DNA的甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶和少量的N6- 甲基腺嘌呤及7-甲基鳥嘌呤。

在高等生物中,5-甲基胞嘧啶多發于CpG二核苷酸序列中,基因組中60%-90%的

CpG是甲基化的。在甲基轉移酶(DNMT)的催化作用下,利用S-腺苷甲硫氨酸(SAM)

提供的甲基,使CpG二核苷酸序列中的胞嘧啶轉變為5-甲基胞嘧啶。由于甲基化胞嘧

啶極易在進化中丟失,高等真核生物中CpG序列遠遠低于其理論值,但在基因組的某

些區域中,通常基因的啟動子和第一外顯子區,CpG序列密度很高,可以達均值

的5倍以上,成為鳥嘌呤和胞嘧啶的富集區,形成所謂的CpG。哺乳類基因組中約

存在4萬個CpG島,大多位于轉錄單元的5’區。CpG島的高甲基化是腫瘤中存在的普

遍現象,而啟動子CpG 島的高甲基化是除突變和缺失外腫瘤中抑癌基因失活的第三種

機制。因此,基因啟動子甲基化檢測在臨床診斷、藥物敏感性檢測等方面具有很高的

應用價值。

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二,?服務項目

1. ?BSP分析
2.? Msp分析

3. ?QMSP分析

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三, 檢測方法

???? 亞硫酸鹽修飾克隆測序法,巢式PCR法,熒光定量PCR法

四,?Real Time PCR裝置

??? 使用美國ABI公司的9700 PCR儀和Step-one PLUS System為主的PCR裝置。

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?五,?服務項目說明?

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1,?亞硫酸鹽測序法?(bisulfite sequencing PCR, BSP)

??????? 先抽提基因組DNA,再進行亞硫酸鹽修飾,甲基化PCR后裝克隆,通過最后對PCR產

物進行克隆測序,可以得到目的片段中每個CG位點的甲基化情況,這種方法更加準確,所以

目前BSP法受到更多研究者的青睞!

最后通過對測序結果分析, 可以得到如下數據:

1.? 測序序列與目的序列的相似度(%)

2.? C-T轉化效率(%)

3.? 目的序列中每個CG的甲基化情況(點狀圖)

4.? 目的序列中每個CG的甲基化比例(%)

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????????????????????????????????????????????????????? 點狀圖

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柱狀圖(百分比)

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?序列比對

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2,甲基化特異性PCR (methylation-specific PCR,MSP)

????????甲基化特異性PCR(Methylmion Specific PCR,MSP)及其改進方法是檢測基因甲基化的經典方法.

MSP法的原理是首先用亞硫酸氫鈉修飾處理基因組DNA,所有未發生甲基化的胞嘧啶都被轉化為尿嘧啶,而

甲基化的胞嘧啶則不變。然后設計針對甲基化和非甲基化序列的引物并進行聚合酶鏈反應(PCR)擴增,最后

通過瓊脂糖凝膠電泳分析,確定與引物互補的DNA序列的甲基化狀態。

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3,QMSP分析

??????????? QMSP采用熒光定量的方法,可確切定量出甲基化的比例。詳情請電聯我們的技術服務人員。

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?4,服務要求

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1.? 如果您需要進行此項服務,請電話聯系我們公司或發送E-mail給我們。
2. ?請寄送足量的并且保證純度的基因組DNA(濃度在500 ng/μl以上,體積在 20 μl以上)。
3. ?如果提供的材料為細胞或組織,DNA的提取費用另收。 同時應保證材料新鮮,動物細胞

數為106以?? 上,動物組織為100 mg以上。