?DNA甲基化是重要的表觀遺傳學標記信息，獲得全基因組范圍內所有C位點的甲基化水平數據，對于表觀遺傳學的時空特異性研究具有重要意義。我們以新一代高通量測序平臺為基礎，進行低成本、高效率、高準確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。特定物種的高精確度甲基化修飾模式的分析，必將在表觀基因組學研究中具有里程碑式的意義，并為細胞分化、組織發育等基礎機制研究，以及動植物育種、人類健康與疾病研究奠定基礎。

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技術路線

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生物信息服務

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樣品要求

1)?樣品總量：≥?10ug;

2)?樣品濃度：≥?50ng/ul。

3)?樣品純度：OD值260/280應在1.8～2.0;

4)?樣品質量：基因組完整、無降解、無污染。

5)?樣品包裝：用封口膜密封樣品，DNA低溫運輸（-20℃）。

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應用案例

對兩只家蠶（Bombyx?mori）絲腺組織進行了研究，發現非CpG位點（CHG和CHH）的假陽性率非常高。結合兩個個體的mCs位點，構建了家蠶全基因組甲基化圖譜。共發現173,505個mC，其中99.2%發生在CG位點?；騾^的絕對/相對甲基化率明顯較高，而與smRNA互補的基因序列的甲基化程度也高于全基因組甲基化的平均水平。基因的表達水平與甲基化水平有顯著正相關，但啟動子區的甲基化水平則與基因表達水平無相關性。該研究為低甲基化物種的研究開創了一個新的格局，證實Bisulfite-Seq可用于此類物種的研究。

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參考文獻：

[1]?Xiang?H,?Zhu?J,?Chen?Q,?et?al.?Single?base-resolution?methylome?of?the?silkworm?reveals?a?sparse?epigenomic?map.?Nat?Biotechnol?2010;28:516-20.

[2]?Lister?R,?Pelizzola?M,?Dowen?RH,?et?al.?Human?DNA?methylomes?at?base?resolution?show?widespread?epigenomic?differences.Nature,?2009,?462:315-322.

[3]Feng?S,?Cokus?SJ,?Zhang?X,?et?al.Conservation?and?divergence?of?methylation?patterning?in?plants?and?animals.Proc?Natl?Acad?Sci.,?2010,?107:8689–8694.