基因組學，是研究生物基因組和如何利用基因的一門學問。該學科提供基因組信息以及相關數據系統利用，試圖解決生物、醫學、工業領域、食品與農業等領域的重大問題。
全基因組表達譜是指全基因組的轉錄水平。通過全基因組表達譜研究，加以生物信息學分析，能夠解析出在特定條件下（疾病、藥物刺激等）整個基因組哪些基因的表達水平上調或下調。生命體是一個復雜的系統，生命活動的調控往往不是單一基因完成的，需要站在宏觀（全基因組）層面上研究基因互作。
全基因組表達譜芯片能夠快速、高通量、特異性地完成全基因組表達譜研究，是全基因組表達譜研究的首選技術手段。
一、技術路線和方法：

二、生物信息學分析
2.1 基本數據分析
Part01：原始數據預處理與均一化
Part02：差異基因篩選
Part03：聚類分析（層次聚類、K-means聚類）
Part04：差異基因GO分類
Part05：差異基因pathway分析
Part06：基因互作網絡構建（Network）
2.2 高級數據分析
Part08：轉錄因子結合位點分析（對植物）
Part09：數據驅動網絡構建（對多個時間點）
Part10：疾病分型
Part11：疾病預測模型構建
Part12：基因表達趨勢顯著性分析
三、芯片平臺

芯片平臺 （Human）	型號	轉錄本數量	規格	貨號
Affymetrix	Human Genome U133 Plus 2.0 Array	47000條(包含38500個基因)	1×	BT1000111
Agilent	SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K	27958條mRNA	8×60K	BT1000112
		7419條lincRNA
Agilent	Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray	41,000條	4×44K	BT1000113
華聯	人類表達譜芯片v6	32679條(包含938條控制探針)	1×	BT1000114

芯片平臺 （RAT）	型號	轉錄本數量	規格	貨號
Affymetrix	Rat Genome 230 2.0 Array	31000條(包含28000個基因)	1×	BT1000131
Agilent	Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K	30003條	8×60K	BT1000132
Agilent	Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray	41012條	4×44K	BT1000133
華聯	大鼠表達譜芯片v1	25338條(包含980條控制探針)	1×	BT1000134

芯片平臺 （Mouse）	型號	轉錄本數量	規格	貨號
Affymetrix	Mouse Genome 430 2.0 Array	39000條(包含34000個基因)	1×	BT1000121
Agilent	SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K	39430條mRNA	8×60K	BT1000122
		16251條lincRNA
Agilent	Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray	41174條	4×44K	BT1000123
華聯	小鼠表達譜芯片v2	27295條(包含872條控制探針)	1×	BT1000124

注：其他種類芯片請聯系公司銷售工程師
四、完成時間
2 個月，（其中生物信息分析1個月）
所有版權及解釋權歸BIOTREE公司所有！?




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